Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1XDW4

Protein Details
Accession A0A1Y1XDW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
515-537PSWTWSFKYRYWKNKCKSYGPLIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MVFRKLNKWNNIKEKCEYVTDKPDIDYLFIDMNGLISDKLHDFERDNSIDSLNEKKIAENVFDKIDINLHILNPKKVLGIFFDGVSPFAKISLQRQRRFREYYIGFKKKIQEKKDNDSTWRNINVIFSGPEVPNEGEYKIFEYIRSNKILSSNDFSYEKRCICTADSDFYLLSLALHQRNILIYNEYSNNFSKKKNFFSIDKLRHVILSNFPNAIKEDHNKIIDDIICLSFLTENNYLPGVYDIEYDDIIKVYMKFYKTNEFINNNGKLNEKNLKKFLILLRDEICIVNKMIYYLDNEMKDSCFNSDKEISSKFSEEYDDSIKFGNINIYMFKRIIFQNILNLCKDPKLKYIVIDYKNSKANEFLKFLCFKFNLSYTEKKQITITDADNKNNTYDNDNYWNFKDYCNRYNYDINNLKNLDDRREYLLLRRCKELNIKYTIEYSVISKKENCENDGKNILEKIKLKIDEDDRNGVYEEMKDDYYNNNIPNCNRREFINHYIEGIKWLLNTYYDKVPSWTWSFKYRYWKNKCKSYGPLISDLCNFEENENFEFDQGEPLKPITQLLTILPPESFNLLPNSYKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.65
3 0.64
4 0.6
5 0.56
6 0.57
7 0.56
8 0.52
9 0.47
10 0.47
11 0.4
12 0.35
13 0.29
14 0.21
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.12
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.08
23 0.06
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.13
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.29
32 0.29
33 0.31
34 0.3
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.31
39 0.25
40 0.27
41 0.25
42 0.24
43 0.29
44 0.29
45 0.31
46 0.28
47 0.28
48 0.26
49 0.27
50 0.26
51 0.22
52 0.22
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.21
58 0.24
59 0.26
60 0.25
61 0.24
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.24
67 0.23
68 0.21
69 0.22
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.16
74 0.1
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.2
79 0.3
80 0.39
81 0.45
82 0.54
83 0.61
84 0.68
85 0.73
86 0.67
87 0.66
88 0.61
89 0.65
90 0.68
91 0.68
92 0.62
93 0.59
94 0.65
95 0.64
96 0.68
97 0.66
98 0.65
99 0.65
100 0.73
101 0.79
102 0.75
103 0.73
104 0.72
105 0.67
106 0.64
107 0.58
108 0.49
109 0.4
110 0.36
111 0.31
112 0.25
113 0.21
114 0.16
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.19
130 0.25
131 0.28
132 0.31
133 0.29
134 0.27
135 0.32
136 0.35
137 0.33
138 0.32
139 0.29
140 0.3
141 0.31
142 0.3
143 0.29
144 0.32
145 0.29
146 0.24
147 0.24
148 0.22
149 0.22
150 0.28
151 0.27
152 0.26
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.22
157 0.21
158 0.13
159 0.1
160 0.08
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.14
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.21
176 0.24
177 0.24
178 0.27
179 0.32
180 0.35
181 0.4
182 0.45
183 0.47
184 0.45
185 0.52
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.54
190 0.47
191 0.44
192 0.42
193 0.34
194 0.3
195 0.26
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.21
202 0.19
203 0.19
204 0.22
205 0.25
206 0.27
207 0.26
208 0.25
209 0.26
210 0.23
211 0.2
212 0.17
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.09
218 0.08
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.22
245 0.23
246 0.27
247 0.32
248 0.31
249 0.33
250 0.37
251 0.39
252 0.33
253 0.32
254 0.29
255 0.24
256 0.26
257 0.3
258 0.28
259 0.28
260 0.3
261 0.3
262 0.29
263 0.32
264 0.31
265 0.32
266 0.29
267 0.27
268 0.26
269 0.25
270 0.25
271 0.21
272 0.19
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.15
293 0.17
294 0.18
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.2
299 0.21
300 0.18
301 0.16
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.21
326 0.24
327 0.25
328 0.23
329 0.23
330 0.21
331 0.22
332 0.25
333 0.2
334 0.2
335 0.24
336 0.24
337 0.26
338 0.33
339 0.38
340 0.38
341 0.42
342 0.41
343 0.4
344 0.45
345 0.43
346 0.35
347 0.32
348 0.33
349 0.31
350 0.31
351 0.29
352 0.27
353 0.3
354 0.3
355 0.3
356 0.26
357 0.23
358 0.23
359 0.25
360 0.25
361 0.27
362 0.34
363 0.33
364 0.42
365 0.41
366 0.39
367 0.38
368 0.34
369 0.33
370 0.3
371 0.29
372 0.29
373 0.31
374 0.33
375 0.34
376 0.33
377 0.3
378 0.29
379 0.27
380 0.22
381 0.21
382 0.22
383 0.28
384 0.29
385 0.3
386 0.29
387 0.33
388 0.3
389 0.3
390 0.35
391 0.34
392 0.39
393 0.41
394 0.42
395 0.41
396 0.47
397 0.46
398 0.47
399 0.48
400 0.42
401 0.44
402 0.43
403 0.39
404 0.38
405 0.39
406 0.34
407 0.3
408 0.31
409 0.3
410 0.32
411 0.32
412 0.34
413 0.41
414 0.43
415 0.42
416 0.44
417 0.4
418 0.41
419 0.5
420 0.49
421 0.48
422 0.46
423 0.46
424 0.44
425 0.45
426 0.41
427 0.32
428 0.26
429 0.22
430 0.22
431 0.22
432 0.23
433 0.23
434 0.26
435 0.33
436 0.36
437 0.36
438 0.37
439 0.39
440 0.42
441 0.47
442 0.44
443 0.38
444 0.38
445 0.36
446 0.34
447 0.34
448 0.32
449 0.33
450 0.34
451 0.33
452 0.37
453 0.42
454 0.44
455 0.46
456 0.48
457 0.41
458 0.41
459 0.4
460 0.33
461 0.27
462 0.2
463 0.18
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.14
468 0.16
469 0.2
470 0.24
471 0.25
472 0.27
473 0.3
474 0.33
475 0.41
476 0.44
477 0.43
478 0.39
479 0.39
480 0.42
481 0.46
482 0.51
483 0.5
484 0.45
485 0.43
486 0.44
487 0.42
488 0.37
489 0.3
490 0.22
491 0.14
492 0.15
493 0.13
494 0.15
495 0.18
496 0.19
497 0.24
498 0.25
499 0.26
500 0.27
501 0.28
502 0.3
503 0.34
504 0.35
505 0.32
506 0.39
507 0.43
508 0.46
509 0.56
510 0.6
511 0.64
512 0.7
513 0.77
514 0.78
515 0.83
516 0.85
517 0.82
518 0.8
519 0.79
520 0.78
521 0.72
522 0.71
523 0.63
524 0.59
525 0.54
526 0.48
527 0.4
528 0.33
529 0.29
530 0.22
531 0.25
532 0.25
533 0.23
534 0.25
535 0.23
536 0.21
537 0.21
538 0.2
539 0.24
540 0.23
541 0.23
542 0.21
543 0.22
544 0.24
545 0.23
546 0.24
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.18
551 0.23
552 0.22
553 0.23
554 0.22
555 0.2
556 0.2
557 0.22
558 0.2
559 0.16
560 0.2
561 0.22
562 0.27