FuNGI

A0A1Y1X478

Protein Details

Accession

A0A1Y1X478

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
698-718	SSIITKKHKPHIKQLRQQLDM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MDLSTFNYSLSKHNIWQQCVYKNDSNTKKLNDLMEVYEDDLYVCDNYKTFNCIRYLNLKSFKGLCVKEDFDTARTSFKKIRIDRKIDYYVNNITINKNGKLLALIGEEGVNVMVIPHTINQINVEELRANIITVGSDIYSSNSGIKIVKAAWHPLSSTNSHIVILSSDGCLRLFDVSSESKEPEQRYYIGPQYYNEYKAFSSSVYIPGRSISGNSEEMETISFAFGNGDDWEIFTIYVLMKNGDVYAICPFLPSKSTVKKSLLENLSLSIEQRWKESDPEDLVIDQQYRLQRCWISTVLQNLKPVKLNELGDEDEEVIINGNISRFKDIHPVIQGPFLLQPAPIEFDPEKSDLDSIASSIISLKTEPFSIILIAYTNGKVDVCLNVAPVEALWMSNNETVQDFELPVLAVYETINLKFKNDLPNIKNNVINIKEDKRYPDICYLYHHYGVHSISFHNWLSLFNDINNNNNLLQKFEDILKREIPSDVSLKVDTLVFGNENDDNPVVGLASSTGIFVGYNLLVLSSSNDFVSIELPIRIKTNSLLFNRNNDNKDYKDLFPVMDLTCPMPVHLGSKKKTGQLYPNFINETTLKYLAEQITLARNDLKELEIYRNKIEKKVNMQSEEYFNQLKKLKDICKRISTSLKSNTENLSARMERIIDNQTMLITKADILLQMLFDRCQPELTDEEKKWFSELKHLSSIITKKHKPHIKQLRQQLDMLKEETKDKIEITEQAIILGTSQKKSVFEALNQESIALMNTMNTLTNLQNEMENLKISNQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.48
3	0.55
4	0.57
5	0.57
6	0.58
7	0.62
8	0.59
9	0.59
10	0.65
11	0.65
12	0.65
13	0.65
14	0.65
15	0.62
16	0.6
17	0.56
18	0.5
19	0.44
20	0.4
21	0.36
22	0.32
23	0.29
24	0.25
25	0.22
26	0.17
27	0.14
28	0.13
29	0.1
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.13
34	0.14
35	0.2
36	0.22
37	0.26
38	0.29
39	0.3
40	0.34
41	0.4
42	0.45
43	0.48
44	0.53
45	0.49
46	0.5
47	0.51
48	0.5
49	0.5
50	0.45
51	0.39
52	0.38
53	0.4
54	0.37
55	0.4
56	0.38
57	0.31
58	0.34
59	0.31
60	0.33
61	0.32
62	0.36
63	0.36
64	0.4
65	0.49
66	0.53
67	0.63
68	0.65
69	0.72
70	0.72
71	0.74
72	0.76
73	0.7
74	0.65
75	0.59
76	0.54
77	0.5
78	0.48
79	0.41
80	0.34
81	0.37
82	0.39
83	0.34
84	0.3
85	0.27
86	0.24
87	0.23
88	0.22
89	0.18
90	0.15
91	0.14
92	0.12
93	0.12
94	0.11
95	0.1
96	0.09
97	0.06
98	0.04
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.05
103	0.06
104	0.09
105	0.1
106	0.1
107	0.13
108	0.14
109	0.16
110	0.15
111	0.16
112	0.14
113	0.13
114	0.16
115	0.14
116	0.12
117	0.1
118	0.1
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.05
123	0.06
124	0.06
125	0.08
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.17
136	0.17
137	0.23
138	0.24
139	0.25
140	0.25
141	0.28
142	0.31
143	0.28
144	0.29
145	0.27
146	0.25
147	0.24
148	0.23
149	0.19
150	0.16
151	0.15
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.12
163	0.13
164	0.17
165	0.19
166	0.2
167	0.22
168	0.27
169	0.28
170	0.28
171	0.29
172	0.27
173	0.28
174	0.32
175	0.35
176	0.33
177	0.32
178	0.29
179	0.33
180	0.35
181	0.35
182	0.3
183	0.26
184	0.23
185	0.23
186	0.23
187	0.16
188	0.16
189	0.14
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.2
194	0.2
195	0.2
196	0.18
197	0.17
198	0.12
199	0.14
200	0.15
201	0.15
202	0.16
203	0.15
204	0.15
205	0.14
206	0.12
207	0.09
208	0.07
209	0.07
210	0.05
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.06
222	0.07
223	0.06
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.1
240	0.13
241	0.18
242	0.25
243	0.3
244	0.34
245	0.38
246	0.41
247	0.42
248	0.48
249	0.44
250	0.37
251	0.33
252	0.3
253	0.28
254	0.24
255	0.22
256	0.15
257	0.17
258	0.15
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.19
263	0.19
264	0.22
265	0.2
266	0.21
267	0.21
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.16
272	0.11
273	0.13
274	0.15
275	0.16
276	0.17
277	0.2
278	0.19
279	0.19
280	0.23
281	0.21
282	0.2
283	0.21
284	0.28
285	0.31
286	0.32
287	0.36
288	0.34
289	0.34
290	0.35
291	0.33
292	0.28
293	0.27
294	0.25
295	0.22
296	0.23
297	0.22
298	0.19
299	0.19
300	0.16
301	0.11
302	0.1
303	0.08
304	0.06
305	0.05
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.09
312	0.1
313	0.11
314	0.19
315	0.19
316	0.22
317	0.23
318	0.25
319	0.23
320	0.25
321	0.23
322	0.16
323	0.16
324	0.13
325	0.11
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.09
330	0.08
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.15
335	0.16
336	0.15
337	0.13
338	0.13
339	0.1
340	0.11
341	0.09
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.14
406	0.21
407	0.24
408	0.31
409	0.32
410	0.41
411	0.45
412	0.45
413	0.44
414	0.36
415	0.37
416	0.31
417	0.3
418	0.26
419	0.25
420	0.26
421	0.26
422	0.29
423	0.29
424	0.29
425	0.3
426	0.33
427	0.31
428	0.29
429	0.32
430	0.34
431	0.32
432	0.33
433	0.3
434	0.23
435	0.24
436	0.24
437	0.2
438	0.15
439	0.13
440	0.11
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.11
445	0.1
446	0.11
447	0.13
448	0.12
449	0.1
450	0.16
451	0.16
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.2
457	0.19
458	0.15
459	0.16
460	0.14
461	0.14
462	0.16
463	0.19
464	0.19
465	0.22
466	0.23
467	0.23
468	0.23
469	0.22
470	0.2
471	0.19
472	0.17
473	0.16
474	0.15
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.12
479	0.1
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.07
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.13
527	0.17
528	0.22
529	0.25
530	0.33
531	0.33
532	0.39
533	0.46
534	0.51
535	0.48
536	0.45
537	0.46
538	0.4
539	0.46
540	0.44
541	0.37
542	0.35
543	0.34
544	0.3
545	0.27
546	0.27
547	0.21
548	0.17
549	0.17
550	0.13
551	0.14
552	0.13
553	0.12
554	0.11
555	0.11
556	0.14
557	0.19
558	0.26
559	0.26
560	0.34
561	0.37
562	0.41
563	0.45
564	0.46
565	0.5
566	0.51
567	0.57
568	0.53
569	0.54
570	0.51
571	0.46
572	0.44
573	0.35
574	0.3
575	0.26
576	0.23
577	0.18
578	0.17
579	0.22
580	0.2
581	0.2
582	0.16
583	0.14
584	0.19
585	0.2
586	0.2
587	0.18
588	0.17
589	0.18
590	0.19
591	0.18
592	0.14
593	0.16
594	0.24
595	0.27
596	0.3
597	0.34
598	0.4
599	0.41
600	0.45
601	0.49
602	0.47
603	0.51
604	0.58
605	0.59
606	0.56
607	0.58
608	0.54
609	0.54
610	0.48
611	0.43
612	0.37
613	0.3
614	0.32
615	0.34
616	0.32
617	0.32
618	0.39
619	0.44
620	0.49
621	0.59
622	0.61
623	0.65
624	0.68
625	0.68
626	0.69
627	0.66
628	0.66
629	0.66
630	0.65
631	0.59
632	0.58
633	0.54
634	0.51
635	0.48
636	0.41
637	0.38
638	0.32
639	0.31
640	0.29
641	0.28
642	0.22
643	0.25
644	0.27
645	0.2
646	0.2
647	0.2
648	0.19
649	0.18
650	0.18
651	0.14
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.09
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.11
661	0.12
662	0.11
663	0.12
664	0.14
665	0.14
666	0.15
667	0.15
668	0.17
669	0.2
670	0.25
671	0.32
672	0.31
673	0.37
674	0.37
675	0.37
676	0.36
677	0.36
678	0.32
679	0.34
680	0.39
681	0.38
682	0.42
683	0.42
684	0.4
685	0.43
686	0.47
687	0.46
688	0.49
689	0.49
690	0.51
691	0.61
692	0.68
693	0.67
694	0.73
695	0.75
696	0.77
697	0.8
698	0.84
699	0.83
700	0.77
701	0.75
702	0.71
703	0.66
704	0.59
705	0.53
706	0.45
707	0.37
708	0.37
709	0.36
710	0.32
711	0.28
712	0.24
713	0.24
714	0.24
715	0.27
716	0.28
717	0.31
718	0.28
719	0.27
720	0.27
721	0.23
722	0.21
723	0.23
724	0.22
725	0.17
726	0.19
727	0.21
728	0.22
729	0.25
730	0.32
731	0.3
732	0.31
733	0.39
734	0.41
735	0.43
736	0.42
737	0.38
738	0.31
739	0.27
740	0.23
741	0.14
742	0.1
743	0.07
744	0.08
745	0.09
746	0.09
747	0.1
748	0.12
749	0.12
750	0.16
751	0.17
752	0.17
753	0.18
754	0.19
755	0.2
756	0.2
757	0.2

A0A1Y1X478

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer