FuNGI

A0A1Y1WQ63

Protein Details

Accession

A0A1Y1WQ63

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-97	EISRICPECKKYNYNNNNNDNNN	Hydrophilic
156-185	LLDSSKNKLKKEEKEKKRRKEKTISEYVFI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
161-177	KNKLKKEEKEKKRRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MYLKFDLYTDEEYEKYGVLIKYKRNLTDNSTSYTLEPQVPCKQCKSVVDCPGHLGRIPLHHRIVHPIFINILCKEISRICPECKKYNYNNNNNDNNNNNNSLTNKNCCCDKPIPPAFFSLHKTKLYGKEKIDEEIEILNKVEENNEEEKENINDELLDSSKNKLKKEEKEKKRRKEKTISEYVFIFGDQIISIDEMYEVISSGDFSECPCRQKQLLNVFIKNIPVLPVCLRPSVLNPDNVTIHSSVTTLYGRILDLNRQYQNENPSLNKITYILRIFNMFRRILGIRSSTDEENDNKAYIKQMLSGKNGIFRNMCLAKRQNFCLRSVIIPNIDIPLDVTLLPKKFTDEIVPYGYEPGDYVIINRQPTLQTTSILAFRSYPADCQAIQVNPLVVSVFQADFDGDEMNIFWLSSEEAKKDMATKLNLANNIRSYKNGEILITFMQDTLTGLYNMTRDKEIVDKPFIKTICQKLSIGKKKWRNFCKYYKSCMNSWKIPYAHFLSVLLPKTLTLYDEDNTLLIDKGILVGVITGFNQMLLLRAIINYGDEFYLEFLWNVQRIIQEYNITHIITISIGDCVPSKELEEIFLPILESIPKELFYVNIPNIDKFIKSQAKNKHFELLCRYMFIKYYPLMKLVDSIDNNLTNIINSGSKGHNDNVVQMLMSVGVQAILPTIPIRNSYIDGLTAKELFIHSKSGRAGIISTSLNTSSSGYLQRELVKSMEDLVTDEKGVVYDANNEPVSFYPFNLNTGEIDDMFLDYAFSLASVLLNYFLENIKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.17
3	0.2
4	0.18
5	0.23
6	0.29
7	0.35
8	0.43
9	0.49
10	0.54
11	0.53
12	0.55
13	0.56
14	0.59
15	0.56
16	0.53
17	0.5
18	0.45
19	0.42
20	0.41
21	0.37
22	0.33
23	0.32
24	0.32
25	0.39
26	0.45
27	0.47
28	0.48
29	0.5
30	0.49
31	0.55
32	0.57
33	0.57
34	0.6
35	0.62
36	0.58
37	0.58
38	0.56
39	0.5
40	0.42
41	0.35
42	0.29
43	0.32
44	0.36
45	0.38
46	0.39
47	0.41
48	0.41
49	0.49
50	0.49
51	0.45
52	0.41
53	0.35
54	0.34
55	0.32
56	0.35
57	0.25
58	0.24
59	0.19
60	0.18
61	0.2
62	0.22
63	0.25
64	0.29
65	0.33
66	0.39
67	0.48
68	0.54
69	0.6
70	0.63
71	0.67
72	0.69
73	0.75
74	0.79
75	0.8
76	0.84
77	0.84
78	0.85
79	0.8
80	0.76
81	0.7
82	0.66
83	0.59
84	0.53
85	0.45
86	0.38
87	0.38
88	0.38
89	0.38
90	0.4
91	0.38
92	0.38
93	0.41
94	0.4
95	0.44
96	0.44
97	0.47
98	0.5
99	0.55
100	0.56
101	0.52
102	0.55
103	0.51
104	0.49
105	0.46
106	0.43
107	0.4
108	0.37
109	0.38
110	0.41
111	0.49
112	0.51
113	0.53
114	0.49
115	0.51
116	0.52
117	0.53
118	0.47
119	0.37
120	0.32
121	0.29
122	0.26
123	0.19
124	0.18
125	0.15
126	0.14
127	0.14
128	0.14
129	0.11
130	0.15
131	0.17
132	0.18
133	0.19
134	0.19
135	0.21
136	0.21
137	0.21
138	0.17
139	0.13
140	0.12
141	0.12
142	0.13
143	0.11
144	0.12
145	0.11
146	0.15
147	0.2
148	0.24
149	0.25
150	0.32
151	0.4
152	0.49
153	0.59
154	0.67
155	0.73
156	0.81
157	0.9
158	0.91
159	0.94
160	0.93
161	0.91
162	0.91
163	0.91
164	0.89
165	0.9
166	0.82
167	0.73
168	0.64
169	0.55
170	0.44
171	0.33
172	0.23
173	0.12
174	0.09
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.07
193	0.15
194	0.17
195	0.21
196	0.22
197	0.25
198	0.27
199	0.32
200	0.39
201	0.41
202	0.49
203	0.52
204	0.52
205	0.5
206	0.49
207	0.45
208	0.37
209	0.27
210	0.2
211	0.13
212	0.14
213	0.14
214	0.17
215	0.18
216	0.19
217	0.19
218	0.18
219	0.21
220	0.28
221	0.28
222	0.27
223	0.26
224	0.28
225	0.28
226	0.28
227	0.27
228	0.19
229	0.16
230	0.13
231	0.12
232	0.09
233	0.1
234	0.1
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.08
239	0.11
240	0.11
241	0.14
242	0.17
243	0.23
244	0.25
245	0.26
246	0.27
247	0.29
248	0.33
249	0.32
250	0.3
251	0.26
252	0.28
253	0.29
254	0.28
255	0.24
256	0.21
257	0.19
258	0.22
259	0.22
260	0.19
261	0.17
262	0.2
263	0.21
264	0.23
265	0.27
266	0.22
267	0.2
268	0.22
269	0.22
270	0.21
271	0.22
272	0.2
273	0.16
274	0.2
275	0.23
276	0.19
277	0.2
278	0.21
279	0.21
280	0.22
281	0.22
282	0.19
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.17
287	0.15
288	0.16
289	0.21
290	0.24
291	0.27
292	0.29
293	0.28
294	0.32
295	0.32
296	0.29
297	0.24
298	0.2
299	0.24
300	0.26
301	0.26
302	0.25
303	0.3
304	0.35
305	0.38
306	0.43
307	0.44
308	0.41
309	0.42
310	0.4
311	0.36
312	0.31
313	0.3
314	0.28
315	0.2
316	0.19
317	0.17
318	0.14
319	0.13
320	0.1
321	0.08
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.1
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.15
334	0.14
335	0.17
336	0.18
337	0.18
338	0.16
339	0.16
340	0.15
341	0.12
342	0.09
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.09
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.14
354	0.18
355	0.15
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.16
360	0.16
361	0.15
362	0.1
363	0.1
364	0.12
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.15
372	0.12
373	0.13
374	0.13
375	0.11
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.03
396	0.03
397	0.04
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.12
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.17
409	0.21
410	0.23
411	0.27
412	0.25
413	0.25
414	0.25
415	0.27
416	0.25
417	0.21
418	0.23
419	0.21
420	0.23
421	0.22
422	0.18
423	0.15
424	0.17
425	0.16
426	0.12
427	0.11
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.08
438	0.09
439	0.1
440	0.09
441	0.08
442	0.09
443	0.14
444	0.17
445	0.2
446	0.25
447	0.26
448	0.27
449	0.31
450	0.31
451	0.28
452	0.3
453	0.33
454	0.33
455	0.33
456	0.32
457	0.34
458	0.44
459	0.52
460	0.53
461	0.55
462	0.6
463	0.65
464	0.74
465	0.77
466	0.75
467	0.73
468	0.76
469	0.79
470	0.75
471	0.75
472	0.75
473	0.69
474	0.64
475	0.65
476	0.61
477	0.56
478	0.53
479	0.52
480	0.44
481	0.42
482	0.42
483	0.38
484	0.32
485	0.26
486	0.24
487	0.19
488	0.23
489	0.23
490	0.19
491	0.14
492	0.13
493	0.14
494	0.14
495	0.12
496	0.09
497	0.11
498	0.1
499	0.12
500	0.12
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.06
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.03
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.11
544	0.13
545	0.15
546	0.16
547	0.17
548	0.16
549	0.2
550	0.21
551	0.19
552	0.17
553	0.15
554	0.13
555	0.1
556	0.1
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.07
562	0.08
563	0.09
564	0.09
565	0.09
566	0.11
567	0.11
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.13
572	0.12
573	0.11
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.12
585	0.18
586	0.16
587	0.22
588	0.23
589	0.22
590	0.24
591	0.25
592	0.22
593	0.18
594	0.27
595	0.29
596	0.31
597	0.39
598	0.48
599	0.56
600	0.6
601	0.61
602	0.61
603	0.53
604	0.55
605	0.56
606	0.53
607	0.44
608	0.42
609	0.41
610	0.33
611	0.33
612	0.29
613	0.25
614	0.2
615	0.24
616	0.23
617	0.25
618	0.24
619	0.23
620	0.25
621	0.24
622	0.28
623	0.23
624	0.25
625	0.26
626	0.26
627	0.26
628	0.23
629	0.21
630	0.14
631	0.14
632	0.12
633	0.1
634	0.09
635	0.13
636	0.14
637	0.16
638	0.19
639	0.2
640	0.24
641	0.24
642	0.26
643	0.25
644	0.23
645	0.21
646	0.17
647	0.16
648	0.1
649	0.1
650	0.07
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.04
657	0.05
658	0.06
659	0.08
660	0.08
661	0.11
662	0.13
663	0.15
664	0.17
665	0.19
666	0.19
667	0.2
668	0.2
669	0.2
670	0.2
671	0.18
672	0.16
673	0.15
674	0.15
675	0.15
676	0.16
677	0.21
678	0.19
679	0.24
680	0.25
681	0.26
682	0.26
683	0.24
684	0.23
685	0.17
686	0.22
687	0.17
688	0.17
689	0.17
690	0.17
691	0.16
692	0.16
693	0.16
694	0.13
695	0.16
696	0.2
697	0.2
698	0.22
699	0.24
700	0.29
701	0.29
702	0.3
703	0.28
704	0.24
705	0.22
706	0.24
707	0.22
708	0.16
709	0.17
710	0.18
711	0.18
712	0.16
713	0.16
714	0.13
715	0.12
716	0.12
717	0.11
718	0.09
719	0.15
720	0.16
721	0.22
722	0.23
723	0.22
724	0.23
725	0.24
726	0.3
727	0.23
728	0.22
729	0.25
730	0.25
731	0.27
732	0.27
733	0.27
734	0.21
735	0.23
736	0.24
737	0.16
738	0.16
739	0.14
740	0.13
741	0.13
742	0.12
743	0.09
744	0.07
745	0.07
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.04
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.09

A0A1Y1WQ63

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer