Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UHN1

Protein Details
Accession A0A1Y1UHN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-372TPNNNGNSSKKNRNKNKNKGQNNNNNNNQNQHydrophilic
381-407NTAQNSNQQQRKQKKSKSSIDLQNKNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences SVAAFVPEKNGVPASIRIFSLGNFEVPTLIKTFFKADSVEMLWNKLGVSLLVWTHTEVDASGLSYYGEASLYYFSIAGKFECRVPIEPGAPIHDVSWSPNSKEFIVIHGLMPSSATLYDWRAIPIYDFPKNHRNFVRYSPHSRIICIAGFGNLAGEMDFFDRLTCQKVDGRHVITATLTPRLRVDNGFKIWHYSGVKLFECDIKELYQISWRPIQPDHFPPHNTLSPPPKGLIEDTSKETKKPVGVYRPPGARASASNLSLRETSMSSLSMTSTDNSTSSKEDNLLHPPSINNNINRQNKNQNQKQAQNQQNQKQSQNQQNNQASQKNQNQSNSGNSSPQTTPNNNGNSSKKNRNKNKNKGQNNNNNNNQNQNNNQSQNSNTAQNSNQQQRKQKKSKSSIDLQNKNGSKPSSPTGSPNQSQSGNSNKNPNHENQKKIKTLQRKLREIAEIKAKHAAGQKLEHTQIIKMEKESELAKELETYLAKNNQNQNQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.25
4 0.24
5 0.24
6 0.23
7 0.26
8 0.22
9 0.19
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.19
20 0.18
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.21
25 0.23
26 0.29
27 0.26
28 0.27
29 0.25
30 0.24
31 0.23
32 0.19
33 0.17
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.18
69 0.21
70 0.22
71 0.26
72 0.3
73 0.29
74 0.3
75 0.29
76 0.29
77 0.27
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.27
87 0.29
88 0.27
89 0.31
90 0.28
91 0.23
92 0.26
93 0.25
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.15
98 0.15
99 0.12
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.18
112 0.21
113 0.26
114 0.27
115 0.31
116 0.4
117 0.42
118 0.48
119 0.47
120 0.45
121 0.42
122 0.49
123 0.54
124 0.51
125 0.57
126 0.57
127 0.59
128 0.57
129 0.54
130 0.48
131 0.4
132 0.34
133 0.27
134 0.21
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.11
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.18
155 0.23
156 0.28
157 0.3
158 0.28
159 0.28
160 0.26
161 0.24
162 0.24
163 0.19
164 0.2
165 0.17
166 0.16
167 0.17
168 0.19
169 0.2
170 0.2
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.29
175 0.28
176 0.3
177 0.29
178 0.31
179 0.27
180 0.22
181 0.22
182 0.24
183 0.24
184 0.21
185 0.22
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.17
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.15
195 0.16
196 0.17
197 0.22
198 0.21
199 0.23
200 0.24
201 0.27
202 0.26
203 0.31
204 0.35
205 0.33
206 0.34
207 0.34
208 0.37
209 0.37
210 0.34
211 0.31
212 0.32
213 0.3
214 0.3
215 0.28
216 0.23
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.18
221 0.18
222 0.2
223 0.26
224 0.25
225 0.25
226 0.25
227 0.23
228 0.21
229 0.24
230 0.26
231 0.29
232 0.34
233 0.39
234 0.43
235 0.44
236 0.43
237 0.39
238 0.34
239 0.26
240 0.21
241 0.22
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.13
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.21
272 0.22
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.26
278 0.28
279 0.24
280 0.29
281 0.38
282 0.46
283 0.49
284 0.51
285 0.54
286 0.57
287 0.65
288 0.64
289 0.64
290 0.63
291 0.67
292 0.71
293 0.71
294 0.72
295 0.71
296 0.73
297 0.71
298 0.72
299 0.7
300 0.64
301 0.62
302 0.61
303 0.62
304 0.64
305 0.61
306 0.62
307 0.64
308 0.65
309 0.62
310 0.58
311 0.51
312 0.5
313 0.54
314 0.5
315 0.5
316 0.47
317 0.46
318 0.43
319 0.47
320 0.43
321 0.36
322 0.32
323 0.28
324 0.3
325 0.27
326 0.31
327 0.31
328 0.29
329 0.32
330 0.37
331 0.41
332 0.39
333 0.43
334 0.42
335 0.45
336 0.5
337 0.56
338 0.57
339 0.63
340 0.71
341 0.77
342 0.84
343 0.86
344 0.9
345 0.9
346 0.92
347 0.92
348 0.92
349 0.92
350 0.91
351 0.9
352 0.87
353 0.83
354 0.74
355 0.72
356 0.64
357 0.59
358 0.54
359 0.5
360 0.49
361 0.46
362 0.46
363 0.4
364 0.39
365 0.39
366 0.37
367 0.36
368 0.29
369 0.29
370 0.29
371 0.33
372 0.39
373 0.43
374 0.47
375 0.49
376 0.58
377 0.65
378 0.75
379 0.78
380 0.79
381 0.8
382 0.84
383 0.87
384 0.85
385 0.85
386 0.84
387 0.84
388 0.84
389 0.77
390 0.77
391 0.69
392 0.63
393 0.58
394 0.5
395 0.41
396 0.37
397 0.37
398 0.34
399 0.33
400 0.37
401 0.41
402 0.47
403 0.46
404 0.46
405 0.46
406 0.42
407 0.42
408 0.42
409 0.43
410 0.43
411 0.44
412 0.5
413 0.48
414 0.52
415 0.55
416 0.57
417 0.58
418 0.58
419 0.64
420 0.64
421 0.71
422 0.72
423 0.74
424 0.76
425 0.76
426 0.78
427 0.8
428 0.8
429 0.79
430 0.76
431 0.75
432 0.75
433 0.67
434 0.63
435 0.63
436 0.55
437 0.49
438 0.51
439 0.45
440 0.41
441 0.45
442 0.43
443 0.37
444 0.41
445 0.44
446 0.44
447 0.46
448 0.44
449 0.39
450 0.36
451 0.37
452 0.37
453 0.35
454 0.29
455 0.31
456 0.29
457 0.3
458 0.3
459 0.26
460 0.25
461 0.23
462 0.21
463 0.2
464 0.2
465 0.22
466 0.21
467 0.2
468 0.23
469 0.31
470 0.34
471 0.4
472 0.48