Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XHF4

Protein Details
Accession A0A1Y1XHF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-282ASKLDKKKKYEKEIEHYKKCBasic
612-634NENETKTENKKEKEKENENENENAcidic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13174  TPR_6  
PF13176  TPR_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MNISKIQANKVVSIKRPPSQEVLNPDMEFYNKPSTVRNHYQPTGKHKKSLVKNICEEMLINGNIDSFVNFFYLTHTTQNPNESKEKSKTELNKPINIKESNNEDEEEDEEEEQRKYFEIPTYSEEKLKGTITDMSKSNMLSTDNLFNFNALYVKIEECERVGNALDGYNAKKNLAEYFGRLNNWNEAIRYYQKAYDSILLLKNKVELYMEAIYNIGYAYEKNNQIVKALAYYIKCREIAIDEYNKSFELSASKKIVKLRLIIASKLDKKKKYEKEIEHYKKCIKIIKESYEDKDEISKISFRLGTAYYNNDELDKAIKLFEEFINNNNNSNKNVINKRFAHASIADCYVRNNNLDKAIEHLEKFISFGAKDIKQKTAQIEALNKLGIIYNKRGEYKKAVVCFEKHFELLNSLKQETENTVKENSVKPEKISYKKGSLPSMTSLSQDQLTNDNNEDMVKENLRDSNKSLVNMNSLLNENDNNYSPNEIIGNSKKFNEALIQMGIAKADNELHRFFNWIQKSDTPSLKSLLQWKANRSIVEYSDDNEDTFLINSEKDTEDILNDKHGFEISNKDENENENDNININENENENDNKNENENENESENENESESENENETKTENKKEKEKENENENENENENNNNNNNNNENENDYIKKDNDENKEENQVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.59
4 0.57
5 0.55
6 0.55
7 0.56
8 0.54
9 0.53
10 0.53
11 0.47
12 0.44
13 0.4
14 0.35
15 0.31
16 0.27
17 0.3
18 0.26
19 0.27
20 0.32
21 0.38
22 0.45
23 0.53
24 0.57
25 0.57
26 0.61
27 0.67
28 0.67
29 0.71
30 0.73
31 0.68
32 0.66
33 0.64
34 0.69
35 0.71
36 0.76
37 0.75
38 0.72
39 0.75
40 0.72
41 0.66
42 0.57
43 0.47
44 0.39
45 0.35
46 0.26
47 0.21
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.11
59 0.14
60 0.16
61 0.19
62 0.22
63 0.25
64 0.29
65 0.37
66 0.37
67 0.38
68 0.43
69 0.44
70 0.48
71 0.51
72 0.54
73 0.49
74 0.55
75 0.59
76 0.63
77 0.69
78 0.67
79 0.68
80 0.67
81 0.69
82 0.68
83 0.62
84 0.54
85 0.49
86 0.5
87 0.46
88 0.43
89 0.38
90 0.31
91 0.29
92 0.28
93 0.25
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.13
102 0.13
103 0.15
104 0.18
105 0.2
106 0.22
107 0.27
108 0.31
109 0.32
110 0.34
111 0.31
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.21
116 0.18
117 0.23
118 0.23
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.24
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.18
129 0.23
130 0.22
131 0.25
132 0.24
133 0.22
134 0.2
135 0.19
136 0.17
137 0.09
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.23
165 0.27
166 0.27
167 0.29
168 0.28
169 0.27
170 0.29
171 0.27
172 0.21
173 0.19
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.22
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.23
189 0.24
190 0.21
191 0.2
192 0.16
193 0.11
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.07
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.13
218 0.16
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.2
226 0.23
227 0.26
228 0.24
229 0.25
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.18
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.2
238 0.23
239 0.24
240 0.27
241 0.31
242 0.35
243 0.31
244 0.31
245 0.29
246 0.32
247 0.33
248 0.31
249 0.31
250 0.33
251 0.38
252 0.44
253 0.48
254 0.44
255 0.49
256 0.58
257 0.64
258 0.66
259 0.69
260 0.68
261 0.71
262 0.78
263 0.82
264 0.77
265 0.73
266 0.67
267 0.61
268 0.56
269 0.52
270 0.43
271 0.43
272 0.44
273 0.46
274 0.48
275 0.48
276 0.48
277 0.46
278 0.44
279 0.35
280 0.31
281 0.25
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.12
286 0.14
287 0.14
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.12
309 0.12
310 0.14
311 0.2
312 0.21
313 0.23
314 0.24
315 0.24
316 0.2
317 0.22
318 0.21
319 0.22
320 0.29
321 0.3
322 0.35
323 0.35
324 0.36
325 0.36
326 0.35
327 0.31
328 0.25
329 0.23
330 0.18
331 0.19
332 0.18
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.2
345 0.2
346 0.18
347 0.18
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.12
352 0.09
353 0.07
354 0.09
355 0.12
356 0.16
357 0.2
358 0.22
359 0.25
360 0.26
361 0.28
362 0.29
363 0.29
364 0.28
365 0.27
366 0.29
367 0.26
368 0.26
369 0.23
370 0.21
371 0.16
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.15
376 0.17
377 0.2
378 0.24
379 0.25
380 0.26
381 0.3
382 0.35
383 0.36
384 0.36
385 0.37
386 0.36
387 0.37
388 0.38
389 0.36
390 0.3
391 0.26
392 0.23
393 0.2
394 0.21
395 0.2
396 0.21
397 0.2
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.18
403 0.22
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.23
409 0.25
410 0.28
411 0.29
412 0.28
413 0.28
414 0.35
415 0.42
416 0.45
417 0.49
418 0.48
419 0.47
420 0.51
421 0.54
422 0.5
423 0.44
424 0.41
425 0.36
426 0.35
427 0.3
428 0.26
429 0.22
430 0.2
431 0.19
432 0.17
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.16
439 0.15
440 0.14
441 0.14
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.18
448 0.2
449 0.22
450 0.22
451 0.28
452 0.29
453 0.3
454 0.31
455 0.27
456 0.28
457 0.27
458 0.25
459 0.19
460 0.18
461 0.17
462 0.16
463 0.15
464 0.13
465 0.14
466 0.14
467 0.14
468 0.13
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.11
474 0.15
475 0.21
476 0.25
477 0.25
478 0.26
479 0.26
480 0.26
481 0.26
482 0.24
483 0.19
484 0.17
485 0.16
486 0.16
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.1
491 0.09
492 0.06
493 0.09
494 0.11
495 0.14
496 0.16
497 0.18
498 0.18
499 0.22
500 0.23
501 0.28
502 0.3
503 0.29
504 0.31
505 0.33
506 0.39
507 0.41
508 0.46
509 0.4
510 0.38
511 0.37
512 0.35
513 0.35
514 0.36
515 0.38
516 0.41
517 0.43
518 0.45
519 0.51
520 0.53
521 0.51
522 0.46
523 0.43
524 0.36
525 0.36
526 0.33
527 0.26
528 0.27
529 0.27
530 0.23
531 0.19
532 0.18
533 0.14
534 0.13
535 0.13
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.17
546 0.17
547 0.21
548 0.21
549 0.2
550 0.2
551 0.2
552 0.19
553 0.17
554 0.25
555 0.24
556 0.3
557 0.31
558 0.32
559 0.33
560 0.35
561 0.4
562 0.36
563 0.32
564 0.26
565 0.26
566 0.25
567 0.24
568 0.24
569 0.18
570 0.15
571 0.16
572 0.16
573 0.17
574 0.19
575 0.21
576 0.21
577 0.24
578 0.25
579 0.24
580 0.26
581 0.29
582 0.28
583 0.31
584 0.32
585 0.31
586 0.31
587 0.31
588 0.3
589 0.28
590 0.27
591 0.23
592 0.2
593 0.18
594 0.16
595 0.17
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.19
600 0.19
601 0.19
602 0.19
603 0.24
604 0.27
605 0.35
606 0.41
607 0.46
608 0.55
609 0.63
610 0.72
611 0.75
612 0.8
613 0.79
614 0.8
615 0.81
616 0.76
617 0.72
618 0.66
619 0.58
620 0.5
621 0.44
622 0.36
623 0.33
624 0.31
625 0.33
626 0.33
627 0.36
628 0.37
629 0.39
630 0.41
631 0.39
632 0.4
633 0.35
634 0.36
635 0.33
636 0.35
637 0.33
638 0.32
639 0.35
640 0.33
641 0.34
642 0.38
643 0.43
644 0.47
645 0.52
646 0.53
647 0.52