FuNGI

A0A1Y1WZ98

Protein Details

Accession

A0A1Y1WZ98

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-132	KIIHERYKPKKANDTENNAF	Hydrophilic
274-294	KIKRGFCQRLKGKQGRFRGNL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

GTSDKTARCETCGETLQDCVGHYGFVRLAVPVFHIGYFKQTLVVLQNICKTCGKVLLEEKERRKYLTRLNNPGLDDIKKRAILKALNTACKKVSRCPHCKSVNGVVKKVGALKIIHERYKPKKANDTENNAFKETFNNAIELDPSLKFQIGKAQEDLNPLIVYNLFTKITSEDCEILGLDPVKGRPENFLWTSIPVPPICIRPSVAQNGASNEDDITVLISDIVFINTRIFHSIQSGETISKFMEHWEWLQLLCSQLVNADLPGVQSIPINMVKIKRGFCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSARTVISPDPNLQIEEVAVPELVAKVLTYPERVFEHNIEKLRKCVLNGPDKWPGAVYIRSDKKDEKPKYLKYGDRKQYANNLKIGDIVDRHLRDGDVVLFNRQPSLHRMSVMAHFAKVKPWRTFRFNECCCTPYNADFDGDEMNLHLPQTEEARAEAMELMGIKYNLVTPRHGVPLIAATQDFITASYLLTLKDSFFNRAQFAQITSFMGDALMDIDIPPPAVQKPIRLWTGKQIFSILLRPNKKCPVKVNLETKNKSFTKPKGPAHMCPSDGFLVIQDSVIMCGVIDKSIIGDGSKDSIFYVVLREYGGREAAICMNRLAKVCARWLANRGFSIGIEDVQPGDDLKLQKEDVVEKGYSDCDQLIAKSNAGELENQPGCNQEQTLEAKISGVLSKIRDDVGQCCFQELNRHNAPLIMSVCGSKGSKINVSQMVACVGQQIISGNRIPNGFGDRSLPHFPRKSKIPPAKGFVRNSFYSGLTPYEFFFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLVTHYDGSVRNSTGGIIQFKYGDDGLDPIHMEGGDHPVNFERSFMNTQQLHPSTNKERGLLPYEIKELLNKELSRKEVTNLYSEKFSELLRDFIESKIQSLIKTHVSRTTQIALDNCNKITEKQLKAFFTVCFNKYRKSIIEPGTAVGAIGGQSLGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIINASKNISTPIISADLLNKTSDVKSARIVKGRIEKTIIEDVAEYIEVVIKPSECYVLIKIDLEAIEKLTLEVDIFSIAKSIVLAPKLKIPENYVRIYKPDKIAVNIPMKGDTNELFYALEALKRALPKIIIKGIPSINRAVINEEKEGLKLLVEGYGLREVMAIDGVNGLESSTNHIIEMQQVLGIEAARNSIIKEIQYTMQSHGMQLDFRHCMLLSDLMTFKGEILGITRFGIAKMKDSVLMLASFEKTTDHLFDASFYGKKDSIDGVSECVIMGIPMHVGTGIFKLLQKYPFYIFSYIIYIYIYIYIHI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.34
3	0.33
4	0.31
5	0.28
6	0.24
7	0.18
8	0.15
9	0.14
10	0.16
11	0.15
12	0.15
13	0.15
14	0.13
15	0.13
16	0.13
17	0.15
18	0.15
19	0.16
20	0.15
21	0.16
22	0.15
23	0.2
24	0.22
25	0.2
26	0.18
27	0.17
28	0.19
29	0.22
30	0.27
31	0.24
32	0.26
33	0.33
34	0.32
35	0.35
36	0.35
37	0.33
38	0.29
39	0.34
40	0.32
41	0.32
42	0.4
43	0.46
44	0.54
45	0.61
46	0.67
47	0.69
48	0.7
49	0.66
50	0.64
51	0.62
52	0.63
53	0.65
54	0.67
55	0.68
56	0.72
57	0.73
58	0.69
59	0.66
60	0.6
61	0.53
62	0.47
63	0.42
64	0.41
65	0.41
66	0.4
67	0.39
68	0.42
69	0.42
70	0.43
71	0.48
72	0.5
73	0.54
74	0.56
75	0.55
76	0.52
77	0.54
78	0.52
79	0.5
80	0.53
81	0.55
82	0.62
83	0.66
84	0.72
85	0.72
86	0.74
87	0.72
88	0.73
89	0.72
90	0.69
91	0.64
92	0.57
93	0.52
94	0.49
95	0.46
96	0.38
97	0.32
98	0.26
99	0.29
100	0.36
101	0.41
102	0.44
103	0.45
104	0.52
105	0.56
106	0.67
107	0.7
108	0.67
109	0.7
110	0.73
111	0.79
112	0.79
113	0.8
114	0.78
115	0.78
116	0.74
117	0.66
118	0.59
119	0.49
120	0.43
121	0.36
122	0.33
123	0.26
124	0.23
125	0.21
126	0.21
127	0.22
128	0.2
129	0.19
130	0.13
131	0.14
132	0.15
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.22
137	0.24
138	0.27
139	0.28
140	0.3
141	0.31
142	0.36
143	0.36
144	0.3
145	0.25
146	0.21
147	0.2
148	0.17
149	0.16
150	0.13
151	0.15
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.14
156	0.16
157	0.17
158	0.19
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.17
163	0.16
164	0.17
165	0.15
166	0.13
167	0.14
168	0.15
169	0.18
170	0.2
171	0.2
172	0.21
173	0.23
174	0.3
175	0.29
176	0.32
177	0.29
178	0.3
179	0.31
180	0.29
181	0.3
182	0.22
183	0.24
184	0.23
185	0.26
186	0.25
187	0.25
188	0.25
189	0.25
190	0.31
191	0.34
192	0.34
193	0.34
194	0.34
195	0.36
196	0.37
197	0.33
198	0.28
199	0.22
200	0.19
201	0.15
202	0.13
203	0.11
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.16
220	0.18
221	0.17
222	0.19
223	0.19
224	0.17
225	0.17
226	0.17
227	0.14
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.17
235	0.18
236	0.17
237	0.18
238	0.17
239	0.16
240	0.15
241	0.13
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.1
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.1
256	0.11
257	0.12
258	0.14
259	0.16
260	0.21
261	0.26
262	0.28
263	0.3
264	0.39
265	0.46
266	0.5
267	0.58
268	0.62
269	0.67
270	0.75
271	0.78
272	0.77
273	0.77
274	0.81
275	0.8
276	0.75
277	0.69
278	0.69
279	0.69
280	0.67
281	0.65
282	0.64
283	0.54
284	0.51
285	0.48
286	0.41
287	0.33
288	0.29
289	0.3
290	0.23
291	0.23
292	0.24
293	0.25
294	0.25
295	0.26
296	0.25
297	0.2
298	0.2
299	0.21
300	0.18
301	0.16
302	0.14
303	0.12
304	0.1
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.07
315	0.09
316	0.11
317	0.11
318	0.15
319	0.17
320	0.19
321	0.22
322	0.23
323	0.28
324	0.31
325	0.37
326	0.4
327	0.38
328	0.39
329	0.41
330	0.39
331	0.34
332	0.36
333	0.38
334	0.42
335	0.44
336	0.48
337	0.51
338	0.49
339	0.48
340	0.4
341	0.34
342	0.28
343	0.27
344	0.25
345	0.26
346	0.32
347	0.34
348	0.37
349	0.4
350	0.45
351	0.53
352	0.54
353	0.56
354	0.58
355	0.63
356	0.69
357	0.72
358	0.71
359	0.7
360	0.76
361	0.74
362	0.71
363	0.67
364	0.61
365	0.64
366	0.65
367	0.59
368	0.53
369	0.45
370	0.39
371	0.39
372	0.36
373	0.28
374	0.2
375	0.18
376	0.2
377	0.19
378	0.2
379	0.19
380	0.18
381	0.16
382	0.16
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.17
387	0.18
388	0.18
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.17
393	0.23
394	0.22
395	0.22
396	0.23
397	0.24
398	0.26
399	0.3
400	0.25
401	0.2
402	0.2
403	0.2
404	0.25
405	0.29
406	0.32
407	0.34
408	0.41
409	0.46
410	0.51
411	0.56
412	0.58
413	0.62
414	0.59
415	0.58
416	0.52
417	0.48
418	0.44
419	0.43
420	0.37
421	0.29
422	0.3
423	0.25
424	0.24
425	0.23
426	0.21
427	0.17
428	0.15
429	0.12
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.07
437	0.09
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.09
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.18
459	0.21
460	0.2
461	0.18
462	0.14
463	0.16
464	0.16
465	0.14
466	0.11
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.12
482	0.13
483	0.16
484	0.18
485	0.2
486	0.21
487	0.21
488	0.22
489	0.18
490	0.18
491	0.16
492	0.14
493	0.13
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.07
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.03
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.1
511	0.1
512	0.13
513	0.17
514	0.22
515	0.27
516	0.27
517	0.28
518	0.33
519	0.4
520	0.38
521	0.34
522	0.3
523	0.26
524	0.26
525	0.31
526	0.27
527	0.27
528	0.31
529	0.33
530	0.37
531	0.46
532	0.48
533	0.47
534	0.47
535	0.48
536	0.51
537	0.57
538	0.61
539	0.62
540	0.68
541	0.66
542	0.62
543	0.62
544	0.54
545	0.5
546	0.47
547	0.43
548	0.44
549	0.5
550	0.53
551	0.55
552	0.57
553	0.59
554	0.58
555	0.56
556	0.47
557	0.39
558	0.37
559	0.27
560	0.24
561	0.19
562	0.13
563	0.1
564	0.09
565	0.08
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.04
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.07
589	0.06
590	0.08
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.1
602	0.11
603	0.11
604	0.1
605	0.11
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.13
610	0.13
611	0.15
612	0.18
613	0.19
614	0.18
615	0.23
616	0.24
617	0.25
618	0.23
619	0.23
620	0.19
621	0.17
622	0.18
623	0.13
624	0.1
625	0.08
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.05
631	0.05
632	0.08
633	0.08
634	0.09
635	0.11
636	0.1
637	0.11
638	0.12
639	0.13
640	0.12
641	0.14
642	0.13
643	0.11
644	0.12
645	0.12
646	0.11
647	0.1
648	0.09
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.12
653	0.12
654	0.12
655	0.11
656	0.12
657	0.12
658	0.12
659	0.13
660	0.08
661	0.14
662	0.14
663	0.14
664	0.14
665	0.15
666	0.14
667	0.14
668	0.13
669	0.07
670	0.1
671	0.12
672	0.14
673	0.13
674	0.12
675	0.12
676	0.12
677	0.12
678	0.08
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.09
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.11
687	0.13
688	0.15
689	0.18
690	0.17
691	0.17
692	0.17
693	0.16
694	0.24
695	0.24
696	0.27
697	0.25
698	0.26
699	0.25
700	0.26
701	0.26
702	0.2
703	0.19
704	0.12
705	0.11
706	0.11
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.08
711	0.1
712	0.11
713	0.14
714	0.15
715	0.19
716	0.2
717	0.21
718	0.2
719	0.18
720	0.18
721	0.15
722	0.13
723	0.1
724	0.07
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.06
729	0.07
730	0.09
731	0.09
732	0.11
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.14
737	0.13
738	0.12
739	0.15
740	0.14
741	0.19
742	0.23
743	0.24
744	0.26
745	0.31
746	0.33
747	0.34
748	0.4
749	0.43
750	0.48
751	0.55
752	0.59
753	0.58
754	0.62
755	0.66
756	0.67
757	0.64
758	0.58
759	0.54
760	0.45
761	0.42
762	0.39
763	0.3
764	0.24
765	0.21
766	0.18
767	0.14
768	0.14
769	0.12
770	0.12
771	0.11
772	0.11
773	0.1
774	0.09
775	0.1
776	0.11
777	0.11
778	0.1
779	0.09
780	0.09
781	0.08
782	0.08
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.07
793	0.1
794	0.12
795	0.18
796	0.19
797	0.22
798	0.22
799	0.23
800	0.23
801	0.22
802	0.2
803	0.17
804	0.18
805	0.15
806	0.15
807	0.15
808	0.15
809	0.13
810	0.12
811	0.11
812	0.11
813	0.14
814	0.15
815	0.13
816	0.13
817	0.13
818	0.13
819	0.13
820	0.15
821	0.14
822	0.13
823	0.13
824	0.13
825	0.13
826	0.14
827	0.12
828	0.09
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.08
833	0.08
834	0.06
835	0.07
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.11
840	0.12
841	0.11
842	0.12
843	0.13
844	0.15
845	0.15
846	0.15
847	0.11
848	0.13
849	0.17
850	0.18
851	0.24
852	0.23
853	0.24
854	0.32
855	0.32
856	0.31
857	0.28
858	0.34
859	0.32
860	0.38
861	0.38
862	0.31
863	0.32
864	0.33
865	0.37
866	0.34
867	0.3
868	0.25
869	0.26
870	0.26
871	0.24
872	0.22
873	0.19
874	0.19
875	0.23
876	0.21
877	0.23
878	0.26
879	0.29
880	0.3
881	0.29
882	0.28
883	0.28
884	0.29
885	0.31
886	0.3
887	0.28
888	0.26
889	0.26
890	0.25
891	0.2
892	0.18
893	0.17
894	0.16
895	0.17
896	0.15
897	0.17
898	0.17
899	0.17
900	0.23
901	0.17
902	0.17
903	0.2
904	0.2
905	0.18
906	0.19
907	0.22
908	0.24
909	0.26
910	0.27
911	0.29
912	0.3
913	0.32
914	0.33
915	0.34
916	0.27
917	0.28
918	0.28
919	0.26
920	0.3
921	0.3
922	0.27
923	0.25
924	0.25
925	0.23
926	0.3
927	0.34
928	0.32
929	0.37
930	0.42
931	0.41
932	0.43
933	0.44
934	0.37
935	0.36
936	0.37
937	0.32
938	0.34
939	0.35
940	0.37
941	0.37
942	0.41
943	0.36
944	0.36
945	0.43
946	0.4
947	0.44
948	0.41
949	0.39
950	0.36
951	0.33
952	0.26
953	0.17
954	0.12
955	0.06
956	0.05
957	0.04
958	0.03
959	0.03
960	0.04
961	0.04
962	0.03
963	0.04
964	0.04
965	0.06
966	0.06
967	0.07
968	0.08
969	0.11
970	0.11
971	0.13
972	0.13
973	0.12
974	0.12
975	0.12
976	0.12
977	0.1
978	0.1
979	0.09
980	0.09
981	0.08
982	0.08
983	0.07
984	0.06
985	0.06
986	0.08
987	0.07
988	0.08
989	0.1
990	0.11
991	0.13
992	0.17
993	0.26
994	0.27
995	0.29
996	0.31
997	0.32
998	0.32
999	0.32
1000	0.28
1001	0.19
1002	0.16
1003	0.16
1004	0.16
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.15
1008	0.17
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.15
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.22
1018	0.31
1019	0.36
1020	0.4
1021	0.41
1022	0.43
1023	0.51
1024	0.52
1025	0.49
1026	0.43
1027	0.39
1028	0.37
1029	0.43
1030	0.36
1031	0.26
1032	0.24
1033	0.21
1034	0.19
1035	0.18
1036	0.13
1037	0.06
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.09
1041	0.1
1042	0.09
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.12
1046	0.1
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.15
1055	0.15
1056	0.13
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.09
1062	0.08
1063	0.07
1064	0.06
1065	0.05
1066	0.07
1067	0.07
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.09
1074	0.1
1075	0.14
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.22
1079	0.26
1080	0.28
1081	0.28
1082	0.31
1083	0.38
1084	0.41
1085	0.45
1086	0.44
1087	0.42
1088	0.44
1089	0.47
1090	0.47
1091	0.41
1092	0.43
1093	0.4
1094	0.39
1095	0.42
1096	0.45
1097	0.47
1098	0.44
1099	0.41
1100	0.37
1101	0.35
1102	0.33
1103	0.31
1104	0.23
1105	0.21
1106	0.19
1107	0.19
1108	0.16
1109	0.15
1110	0.17
1111	0.14
1112	0.15
1113	0.11
1114	0.12
1115	0.14
1116	0.15
1117	0.16
1118	0.16
1119	0.19
1120	0.22
1121	0.28
1122	0.34
1123	0.33
1124	0.33
1125	0.38
1126	0.41
1127	0.42
1128	0.4
1129	0.36
1130	0.32
1131	0.32
1132	0.31
1133	0.31
1134	0.31
1135	0.29
1136	0.29
1137	0.28
1138	0.26
1139	0.24
1140	0.25
1141	0.2
1142	0.14
1143	0.12
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.1
1147	0.1
1148	0.1
1149	0.12
1150	0.12
1151	0.11
1152	0.11
1153	0.1
1154	0.1
1155	0.11
1156	0.08
1157	0.06
1158	0.07
1159	0.07
1160	0.06
1161	0.06
1162	0.06
1163	0.06
1164	0.07
1165	0.13
1166	0.15
1167	0.15
1168	0.15
1169	0.16
1170	0.16
1171	0.18
1172	0.19
1173	0.13
1174	0.11
1175	0.11
1176	0.11
1177	0.11
1178	0.11
1179	0.09
1180	0.08
1181	0.08
1182	0.08
1183	0.09
1184	0.09
1185	0.11
1186	0.13
1187	0.13
1188	0.15
1189	0.17
1190	0.2
1191	0.24
1192	0.25
1193	0.25
1194	0.3
1195	0.3
1196	0.28
1197	0.28
1198	0.26
1199	0.24
1200	0.24
1201	0.26
1202	0.22
1203	0.22
1204	0.24
1205	0.2
1206	0.2
1207	0.21
1208	0.23
1209	0.18
1210	0.19
1211	0.2
1212	0.19
1213	0.2
1214	0.19
1215	0.17
1216	0.13
1217	0.12
1218	0.09
1219	0.11
1220	0.12
1221	0.12
1222	0.13
1223	0.14
1224	0.13
1225	0.13
1226	0.2
1227	0.18
1228	0.2
1229	0.23
1230	0.24
1231	0.24
1232	0.24
1233	0.25
1234	0.21
1235	0.2
1236	0.17
1237	0.16
1238	0.16
1239	0.15
1240	0.14
1241	0.14
1242	0.13
1243	0.16
1244	0.17
1245	0.17
1246	0.16
1247	0.16
1248	0.18
1249	0.2
1250	0.22
1251	0.21
1252	0.2
1253	0.22
1254	0.23
1255	0.23
1256	0.24
1257	0.24
1258	0.23
1259	0.26
1260	0.26
1261	0.24
1262	0.24
1263	0.23
1264	0.21
1265	0.17
1266	0.15
1267	0.1
1268	0.09
1269	0.06
1270	0.06
1271	0.06
1272	0.06
1273	0.06
1274	0.06
1275	0.08
1276	0.09
1277	0.09
1278	0.1
1279	0.12
1280	0.16
1281	0.21
1282	0.26
1283	0.28
1284	0.3
1285	0.33
1286	0.37
1287	0.39
1288	0.37
1289	0.33
1290	0.3
1291	0.31
1292	0.28
1293	0.24
1294	0.19
1295	0.15
1296	0.13
1297	0.15

A0A1Y1WZ98

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer