FuNGI

A0A1Y1VS49

Protein Details

Accession

A0A1Y1VS49

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
202-235	KSGSSSQSKSKKRSKRSRKHKKDQNKNNSNNFLH	Hydrophilic
285-304	KKSQEKEKDKDKNKNKNFIG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
210-223	KSKKRSKRSRKHKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.833, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047313 SMN_C
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
CDD	cd22852 SMN_C cd22851 SMN_N

Amino Acid Sequences

MDELLIQEDYEDGEIEYNENNEDIINKSDSNIIENNEEEGEIEDEKIIDNINNNDNDNDNENENENEIENVNENDYYNDNENDINNENDIEIDNDIDNDKDDSQNQFDNENNIQESDNENSQEIMIYSREDDDDKTLTHKEIWDDSSLIKAWDNAVEEYEKYHSIKATKDKSIDNEVYTDYNLPSKKRNASVLYENVNDTIKSGSSSQSKSKKRSKRSRKHKKDQNKNNSNNFLHYDQPDDININLYNIDYGDDNNTTTTTTTTLTSTTEQLSNQVQIHPNQAIKKSQEKEKDKDKNKNKNFIGPPYEIYELKSNNETSSNTDATPPIFSTNITSNINNKVKINDDTLTENKKIKTEVKIKEKEQEQEQEKEQEQEQEKEQKKEQGSIKNKEFLNHKTLEEEEKNYNNMMNDYSAATSIHQNQNYSKSSTAKDYYYNTYNETANGNAYGYQNYNEAGSSNADEALMNMMMAWYWAGYYTCNYYNALGNNKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.11
5	0.11
6	0.1
7	0.1
8	0.09
9	0.1
10	0.12
11	0.15
12	0.16
13	0.16
14	0.17
15	0.22
16	0.22
17	0.24
18	0.25
19	0.24
20	0.24
21	0.24
22	0.25
23	0.21
24	0.2
25	0.16
26	0.15
27	0.15
28	0.12
29	0.12
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.1
34	0.09
35	0.09
36	0.12
37	0.16
38	0.22
39	0.24
40	0.25
41	0.26
42	0.27
43	0.28
44	0.28
45	0.26
46	0.22
47	0.21
48	0.22
49	0.22
50	0.21
51	0.19
52	0.16
53	0.15
54	0.13
55	0.12
56	0.12
57	0.12
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.14
63	0.16
64	0.18
65	0.18
66	0.17
67	0.18
68	0.18
69	0.21
70	0.21
71	0.19
72	0.16
73	0.16
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.09
79	0.09
80	0.08
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.14
89	0.17
90	0.2
91	0.23
92	0.23
93	0.23
94	0.24
95	0.27
96	0.27
97	0.26
98	0.23
99	0.21
100	0.2
101	0.19
102	0.2
103	0.18
104	0.19
105	0.17
106	0.16
107	0.16
108	0.15
109	0.15
110	0.12
111	0.1
112	0.08
113	0.08
114	0.09
115	0.1
116	0.1
117	0.11
118	0.12
119	0.13
120	0.14
121	0.14
122	0.16
123	0.17
124	0.17
125	0.18
126	0.19
127	0.18
128	0.21
129	0.22
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.2
134	0.19
135	0.17
136	0.13
137	0.12
138	0.11
139	0.12
140	0.14
141	0.11
142	0.12
143	0.13
144	0.12
145	0.14
146	0.15
147	0.14
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.22
153	0.29
154	0.34
155	0.36
156	0.39
157	0.4
158	0.42
159	0.47
160	0.43
161	0.35
162	0.3
163	0.27
164	0.25
165	0.23
166	0.2
167	0.13
168	0.15
169	0.17
170	0.17
171	0.21
172	0.26
173	0.3
174	0.32
175	0.38
176	0.36
177	0.39
178	0.44
179	0.44
180	0.41
181	0.37
182	0.34
183	0.3
184	0.26
185	0.21
186	0.16
187	0.11
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.11
192	0.15
193	0.18
194	0.25
195	0.34
196	0.41
197	0.48
198	0.57
199	0.63
200	0.69
201	0.78
202	0.82
203	0.83
204	0.88
205	0.91
206	0.93
207	0.95
208	0.94
209	0.94
210	0.94
211	0.94
212	0.94
213	0.93
214	0.9
215	0.86
216	0.84
217	0.74
218	0.65
219	0.57
220	0.47
221	0.39
222	0.31
223	0.27
224	0.19
225	0.19
226	0.17
227	0.14
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.04
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.12
257	0.11
258	0.13
259	0.13
260	0.15
261	0.14
262	0.16
263	0.17
264	0.17
265	0.19
266	0.19
267	0.21
268	0.21
269	0.23
270	0.24
271	0.25
272	0.33
273	0.34
274	0.39
275	0.46
276	0.5
277	0.54
278	0.61
279	0.67
280	0.68
281	0.75
282	0.78
283	0.79
284	0.8
285	0.84
286	0.75
287	0.74
288	0.7
289	0.67
290	0.62
291	0.52
292	0.46
293	0.4
294	0.4
295	0.31
296	0.28
297	0.26
298	0.22
299	0.21
300	0.23
301	0.19
302	0.18
303	0.2
304	0.19
305	0.19
306	0.23
307	0.22
308	0.2
309	0.2
310	0.2
311	0.19
312	0.19
313	0.15
314	0.12
315	0.11
316	0.1
317	0.12
318	0.15
319	0.18
320	0.19
321	0.2
322	0.21
323	0.31
324	0.34
325	0.32
326	0.3
327	0.28
328	0.3
329	0.31
330	0.32
331	0.24
332	0.22
333	0.26
334	0.3
335	0.33
336	0.32
337	0.34
338	0.31
339	0.32
340	0.33
341	0.33
342	0.37
343	0.42
344	0.49
345	0.55
346	0.61
347	0.62
348	0.66
349	0.66
350	0.62
351	0.59
352	0.59
353	0.53
354	0.5
355	0.51
356	0.5
357	0.46
358	0.43
359	0.38
360	0.37
361	0.36
362	0.35
363	0.37
364	0.41
365	0.45
366	0.47
367	0.5
368	0.49
369	0.47
370	0.52
371	0.54
372	0.54
373	0.58
374	0.62
375	0.64
376	0.63
377	0.62
378	0.58
379	0.57
380	0.52
381	0.49
382	0.43
383	0.38
384	0.34
385	0.36
386	0.39
387	0.37
388	0.36
389	0.35
390	0.35
391	0.36
392	0.33
393	0.33
394	0.26
395	0.24
396	0.21
397	0.17
398	0.15
399	0.15
400	0.14
401	0.13
402	0.12
403	0.12
404	0.15
405	0.22
406	0.28
407	0.29
408	0.31
409	0.34
410	0.41
411	0.43
412	0.42
413	0.38
414	0.35
415	0.36
416	0.41
417	0.4
418	0.36
419	0.37
420	0.38
421	0.41
422	0.42
423	0.41
424	0.37
425	0.37
426	0.35
427	0.31
428	0.29
429	0.23
430	0.2
431	0.19
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.17
437	0.17
438	0.16
439	0.16
440	0.16
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.13
452	0.11
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.04
460	0.04
461	0.05
462	0.06
463	0.08
464	0.1
465	0.16
466	0.18
467	0.2
468	0.21
469	0.22
470	0.27
471	0.31

A0A1Y1VS49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer