Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XQM9

Protein Details
Accession A0A1Y1XQM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-51ITDKSKVSVVNNKKKRCQVKMACVNCQKACKKCANVRPCSRCIQRHydrophilic
57-88CFDIERKPRRVGVKRGPYKKRRNWKLEILAIIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-80RKPRRVGVKRGPYKKRRNW
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8.833, mito 7.5, cyto_mito 6.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MEKQIIITDKSKVSVVNNKKKRCQVKMACVNCQKACKKCANVRPCSRCIQRGIADTCFDIERKPRRVGVKRGPYKKRRNWKLEILAIIEKKAFASQVTSLQFINEKILIEGTGPYLMFFDIENNINFKSFNIFQHSRVHGIRIVNNENCKLIAAYGSKSLKIFEFDILTIEDQYDVVLTEKASIEVKDWILDAKFLYENKQSNVPTDIALALAHNFVIVYNIDLTEKKYEVHSEINCIIYSAKFYGNTLDTLKMASGTVFNVVILWNVLNKSNKSAIIQEFKGHEGVIFAIDFTDDGKKLCSVSDDRTLRVWTVNDRKSVVLYGHTSRIWDCILTDRYAITVSEDTTCRVWDYHNETCSACWEGHYGKDIWCVAISPNKDIVATGGGDSGVRLWDLKDLEYNRIESSNALKEVSLPEQEMYIDPSIKDTLPKKEFIRNFAQVDDRKTVFITNTGYFLVHDLNKNETSVLYQDMSFCNYSMMNISDCKRIIGSGDLSGNVLLLSPDNLFKPIKWKAHEGKVFDVYFEKSDDPNIIYFFSYNVNNEMLWSEINITDGSNPIVNQKKKIKLSVNTVMCLTYSEKFNVLLMGCRHGSVIVYKINNDDPNETIEPIYRYTHAHGKDAITCITIDRNLSTDDSLVFHSTGRDGNYNQFRLTGNALSNNEIKEQELIKIEEIGKSKITKGWLEKVIIVNNTKLLLGFFQKRFFVYNDDKKYEVMSISCGGAHRKWYFSTESENINKAVFSFYRKEKLYAYLRNIQVQKLFKEEKLQDNLHGKEIRTIKFIDNSIIESDHIKEDMGLLVTGAEDSLLKFLKYDPDKSSIQIHSKSSIRKHTSVIKNLGFSSGINNLLFTSGACEELNVWKLEIKEDTSEMCDSNLYINCVNYVSAPHVSPVTSETRIMDMDIANLSILKLREYANDIGIHLIITGYSDSLTRLWVFDEKSNKFEIIACGKLSNRCILRTKFHFITLNDNTKKLIAFVAATDGQVYLCDCTNIVKKYLDGELSKSKELVSFSKITLHQSGINGLDVHTDINNKQRLIIATGGDDNACSVAFVDISKDNQNKLSVINYKKFTQEFAHSSALTDVKIFNDNYILTISEDQRLNIWSITINEKIEIKLIESKYIDIPDVSCMDIVQISNTKWKVALSGIGIQILYITLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.46
3 0.51
4 0.59
5 0.67
6 0.74
7 0.82
8 0.85
9 0.84
10 0.84
11 0.83
12 0.85
13 0.87
14 0.85
15 0.86
16 0.83
17 0.82
18 0.75
19 0.74
20 0.71
21 0.68
22 0.68
23 0.67
24 0.69
25 0.71
26 0.77
27 0.78
28 0.81
29 0.84
30 0.85
31 0.81
32 0.81
33 0.78
34 0.74
35 0.7
36 0.68
37 0.63
38 0.63
39 0.63
40 0.57
41 0.51
42 0.45
43 0.42
44 0.35
45 0.29
46 0.24
47 0.28
48 0.34
49 0.39
50 0.44
51 0.48
52 0.57
53 0.66
54 0.73
55 0.74
56 0.76
57 0.8
58 0.86
59 0.9
60 0.9
61 0.92
62 0.92
63 0.92
64 0.92
65 0.91
66 0.89
67 0.89
68 0.88
69 0.83
70 0.77
71 0.7
72 0.67
73 0.59
74 0.51
75 0.41
76 0.32
77 0.25
78 0.23
79 0.18
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.26
89 0.23
90 0.24
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.15
115 0.18
116 0.19
117 0.22
118 0.29
119 0.31
120 0.34
121 0.43
122 0.45
123 0.44
124 0.42
125 0.41
126 0.36
127 0.39
128 0.4
129 0.39
130 0.43
131 0.42
132 0.46
133 0.44
134 0.41
135 0.37
136 0.33
137 0.26
138 0.19
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.24
143 0.25
144 0.26
145 0.26
146 0.27
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.18
151 0.19
152 0.17
153 0.19
154 0.19
155 0.18
156 0.16
157 0.14
158 0.12
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.16
182 0.15
183 0.2
184 0.24
185 0.27
186 0.29
187 0.36
188 0.33
189 0.33
190 0.36
191 0.32
192 0.25
193 0.23
194 0.21
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.18
217 0.2
218 0.27
219 0.26
220 0.28
221 0.29
222 0.3
223 0.28
224 0.26
225 0.23
226 0.16
227 0.18
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.17
233 0.17
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.12
241 0.11
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.16
257 0.17
258 0.21
259 0.24
260 0.25
261 0.25
262 0.3
263 0.31
264 0.34
265 0.34
266 0.33
267 0.32
268 0.32
269 0.31
270 0.25
271 0.19
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.15
289 0.15
290 0.2
291 0.29
292 0.3
293 0.3
294 0.33
295 0.33
296 0.3
297 0.29
298 0.26
299 0.25
300 0.33
301 0.36
302 0.36
303 0.37
304 0.36
305 0.35
306 0.35
307 0.27
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.22
312 0.22
313 0.22
314 0.2
315 0.21
316 0.18
317 0.14
318 0.12
319 0.16
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.17
339 0.24
340 0.28
341 0.29
342 0.31
343 0.3
344 0.3
345 0.31
346 0.26
347 0.18
348 0.12
349 0.14
350 0.13
351 0.15
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.19
356 0.19
357 0.17
358 0.15
359 0.15
360 0.13
361 0.17
362 0.18
363 0.16
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.15
385 0.16
386 0.2
387 0.22
388 0.23
389 0.2
390 0.2
391 0.2
392 0.15
393 0.18
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.18
400 0.19
401 0.16
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.16
415 0.17
416 0.25
417 0.27
418 0.31
419 0.32
420 0.39
421 0.42
422 0.42
423 0.46
424 0.42
425 0.41
426 0.39
427 0.43
428 0.37
429 0.39
430 0.38
431 0.31
432 0.26
433 0.25
434 0.24
435 0.18
436 0.18
437 0.17
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.11
446 0.13
447 0.13
448 0.16
449 0.17
450 0.17
451 0.16
452 0.13
453 0.13
454 0.11
455 0.12
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.11
470 0.13
471 0.15
472 0.16
473 0.16
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.07
486 0.06
487 0.04
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.06
492 0.06
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.16
497 0.22
498 0.26
499 0.28
500 0.35
501 0.39
502 0.48
503 0.52
504 0.47
505 0.44
506 0.45
507 0.42
508 0.35
509 0.31
510 0.23
511 0.19
512 0.18
513 0.16
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.05
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.1
546 0.18
547 0.19
548 0.25
549 0.31
550 0.37
551 0.39
552 0.45
553 0.47
554 0.45
555 0.51
556 0.54
557 0.49
558 0.43
559 0.41
560 0.34
561 0.28
562 0.24
563 0.18
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.09
572 0.11
573 0.1
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.1
579 0.11
580 0.08
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.12
585 0.13
586 0.16
587 0.18
588 0.18
589 0.16
590 0.13
591 0.18
592 0.18
593 0.17
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.14
599 0.11
600 0.12
601 0.14
602 0.19
603 0.19
604 0.2
605 0.2
606 0.2
607 0.22
608 0.22
609 0.2
610 0.15
611 0.13
612 0.12
613 0.12
614 0.11
615 0.09
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.11
634 0.18
635 0.24
636 0.25
637 0.24
638 0.24
639 0.23
640 0.22
641 0.24
642 0.19
643 0.14
644 0.17
645 0.18
646 0.18
647 0.2
648 0.19
649 0.18
650 0.16
651 0.15
652 0.13
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.14
657 0.13
658 0.15
659 0.15
660 0.17
661 0.18
662 0.17
663 0.16
664 0.16
665 0.17
666 0.17
667 0.19
668 0.19
669 0.21
670 0.26
671 0.28
672 0.29
673 0.3
674 0.3
675 0.31
676 0.3
677 0.27
678 0.21
679 0.18
680 0.17
681 0.15
682 0.12
683 0.09
684 0.08
685 0.11
686 0.17
687 0.18
688 0.2
689 0.2
690 0.21
691 0.23
692 0.23
693 0.26
694 0.28
695 0.36
696 0.4
697 0.42
698 0.42
699 0.4
700 0.4
701 0.34
702 0.26
703 0.17
704 0.13
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.12
710 0.12
711 0.18
712 0.17
713 0.18
714 0.19
715 0.21
716 0.23
717 0.23
718 0.28
719 0.25
720 0.29
721 0.3
722 0.31
723 0.29
724 0.26
725 0.24
726 0.18
727 0.18
728 0.13
729 0.14
730 0.18
731 0.21
732 0.28
733 0.29
734 0.3
735 0.29
736 0.36
737 0.4
738 0.42
739 0.44
740 0.45
741 0.45
742 0.5
743 0.5
744 0.44
745 0.41
746 0.38
747 0.33
748 0.32
749 0.33
750 0.28
751 0.34
752 0.37
753 0.38
754 0.41
755 0.41
756 0.39
757 0.44
758 0.45
759 0.43
760 0.41
761 0.34
762 0.35
763 0.39
764 0.35
765 0.3
766 0.31
767 0.28
768 0.29
769 0.29
770 0.25
771 0.21
772 0.21
773 0.19
774 0.18
775 0.16
776 0.13
777 0.14
778 0.12
779 0.11
780 0.1
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.08
785 0.07
786 0.06
787 0.06
788 0.06
789 0.05
790 0.05
791 0.04
792 0.03
793 0.03
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.08
799 0.16
800 0.19
801 0.24
802 0.25
803 0.3
804 0.31
805 0.32
806 0.38
807 0.35
808 0.38
809 0.37
810 0.35
811 0.35
812 0.39
813 0.43
814 0.42
815 0.47
816 0.47
817 0.46
818 0.48
819 0.53
820 0.57
821 0.59
822 0.61
823 0.53
824 0.49
825 0.47
826 0.44
827 0.35
828 0.26
829 0.21
830 0.17
831 0.16
832 0.14
833 0.14
834 0.13
835 0.13
836 0.12
837 0.09
838 0.1
839 0.08
840 0.1
841 0.09
842 0.09
843 0.1
844 0.14
845 0.16
846 0.13
847 0.13
848 0.14
849 0.15
850 0.17
851 0.17
852 0.16
853 0.15
854 0.16
855 0.17
856 0.17
857 0.18
858 0.16
859 0.15
860 0.13
861 0.11
862 0.15
863 0.15
864 0.15
865 0.15
866 0.15
867 0.15
868 0.16
869 0.15
870 0.11
871 0.11
872 0.11
873 0.12
874 0.12
875 0.13
876 0.13
877 0.13
878 0.13
879 0.14
880 0.16
881 0.16
882 0.16
883 0.16
884 0.17
885 0.17
886 0.17
887 0.16
888 0.11
889 0.11
890 0.11
891 0.1
892 0.08
893 0.08
894 0.08
895 0.09
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.11
900 0.14
901 0.18
902 0.2
903 0.2
904 0.21
905 0.2
906 0.19
907 0.18
908 0.16
909 0.11
910 0.09
911 0.06
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.06
918 0.07
919 0.09
920 0.08
921 0.08
922 0.1
923 0.14
924 0.16
925 0.21
926 0.3
927 0.3
928 0.33
929 0.34
930 0.33
931 0.29
932 0.3
933 0.31
934 0.27
935 0.27
936 0.25
937 0.26
938 0.28
939 0.31
940 0.31
941 0.32
942 0.29
943 0.31
944 0.38
945 0.4
946 0.46
947 0.49
948 0.55
949 0.5
950 0.53
951 0.54
952 0.47
953 0.53
954 0.52
955 0.56
956 0.5
957 0.48
958 0.44
959 0.39
960 0.38
961 0.29
962 0.22
963 0.13
964 0.11
965 0.11
966 0.15
967 0.15
968 0.15
969 0.14
970 0.13
971 0.11
972 0.11
973 0.11
974 0.08
975 0.07
976 0.08
977 0.07
978 0.12
979 0.19
980 0.21
981 0.23
982 0.23
983 0.23
984 0.26
985 0.3
986 0.3
987 0.25
988 0.28
989 0.34
990 0.37
991 0.37
992 0.35
993 0.32
994 0.3
995 0.31
996 0.29
997 0.26
998 0.25
999 0.24
1000 0.31
1001 0.32
1002 0.33
1003 0.33
1004 0.32
1005 0.29
1006 0.27
1007 0.3
1008 0.24
1009 0.25
1010 0.21
1011 0.18
1012 0.17
1013 0.14
1014 0.14
1015 0.12
1016 0.14
1017 0.14
1018 0.22
1019 0.27
1020 0.25
1021 0.26
1022 0.29
1023 0.3
1024 0.31
1025 0.32
1026 0.25
1027 0.22
1028 0.24
1029 0.23
1030 0.19
1031 0.17
1032 0.14
1033 0.11
1034 0.09
1035 0.07
1036 0.06
1037 0.06
1038 0.06
1039 0.06
1040 0.09
1041 0.11
1042 0.15
1043 0.23
1044 0.25
1045 0.27
1046 0.3
1047 0.32
1048 0.3
1049 0.29
1050 0.34
1051 0.35
1052 0.4
1053 0.45
1054 0.45
1055 0.46
1056 0.51
1057 0.5
1058 0.46
1059 0.43
1060 0.43
1061 0.4
1062 0.42
1063 0.44
1064 0.38
1065 0.38
1066 0.38
1067 0.34
1068 0.26
1069 0.22
1070 0.18
1071 0.15
1072 0.2
1073 0.19
1074 0.16
1075 0.18
1076 0.18
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.17
1080 0.15
1081 0.19
1082 0.2
1083 0.22
1084 0.23
1085 0.22
1086 0.23
1087 0.24
1088 0.24
1089 0.19
1090 0.19
1091 0.15
1092 0.17
1093 0.22
1094 0.23
1095 0.22
1096 0.23
1097 0.24
1098 0.24
1099 0.25
1100 0.23
1101 0.22
1102 0.26
1103 0.27
1104 0.31
1105 0.3
1106 0.32
1107 0.32
1108 0.33
1109 0.31
1110 0.23
1111 0.23
1112 0.21
1113 0.21
1114 0.19
1115 0.16
1116 0.14
1117 0.14
1118 0.15
1119 0.14
1120 0.14
1121 0.17
1122 0.18
1123 0.26
1124 0.27
1125 0.27
1126 0.26
1127 0.26
1128 0.25
1129 0.23
1130 0.26
1131 0.21
1132 0.26
1133 0.26
1134 0.27
1135 0.26
1136 0.23
1137 0.21