Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W8J0

Protein Details
Accession A0A1Y1W8J0    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MLKSRERAIKKLKSKLKEKNNNNNNKNKKEEEHydrophilic
90-110DDNNNNKRYRKRKLIYCDYNLHydrophilic
252-284EEFDRRETEKRQRQEKKFNAKLKELRRKTRTSIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-20RERAIKKLKSKLKEKN
261-283KRQRQEKKFNAKLKELRRKTRTS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MLKSRERAIKKLKSKLKEKNNNNNNKNKKEEEEIIIFDDDNDFVTNNNKNKNSNINSETTGNNNNNRNQKQDTLKDIINSSIIENGLSVDDNNNNKRYRKRKLIYCDYNLSEIVDTKGGFLIEKTEEDLLKDKEPEKKVKHLLPIDLELQNNPKCQECDSLDIDYNYLDNFNVKVCRNCRTKMPEKYSLLTKTECKEDYLLTDSELRDRELLPCWERPNPHKSSWNNMMLFVRYQVEEYAFKKWGSEQGLDEEFDRRETEKRQRQEKKFNAKLKELRRKTRTSIWLKEKAKAHVHEFGETVVNESGESVHRCKTCGYLEEFEEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.86
3 0.87
4 0.87
5 0.89
6 0.89
7 0.91
8 0.92
9 0.91
10 0.91
11 0.9
12 0.87
13 0.84
14 0.78
15 0.72
16 0.68
17 0.65
18 0.6
19 0.55
20 0.48
21 0.44
22 0.39
23 0.34
24 0.27
25 0.22
26 0.16
27 0.12
28 0.11
29 0.08
30 0.08
31 0.13
32 0.2
33 0.24
34 0.32
35 0.35
36 0.37
37 0.41
38 0.51
39 0.51
40 0.53
41 0.51
42 0.47
43 0.46
44 0.46
45 0.43
46 0.37
47 0.39
48 0.35
49 0.38
50 0.4
51 0.44
52 0.51
53 0.52
54 0.54
55 0.51
56 0.53
57 0.55
58 0.55
59 0.55
60 0.5
61 0.49
62 0.45
63 0.42
64 0.36
65 0.29
66 0.24
67 0.17
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.12
78 0.18
79 0.22
80 0.27
81 0.3
82 0.35
83 0.44
84 0.52
85 0.56
86 0.62
87 0.66
88 0.7
89 0.76
90 0.82
91 0.82
92 0.78
93 0.75
94 0.66
95 0.59
96 0.5
97 0.41
98 0.3
99 0.22
100 0.17
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.16
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.2
120 0.26
121 0.3
122 0.38
123 0.38
124 0.43
125 0.48
126 0.5
127 0.54
128 0.49
129 0.47
130 0.41
131 0.4
132 0.35
133 0.3
134 0.26
135 0.2
136 0.22
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.21
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.15
152 0.13
153 0.09
154 0.07
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.1
160 0.11
161 0.16
162 0.18
163 0.25
164 0.29
165 0.3
166 0.36
167 0.41
168 0.5
169 0.55
170 0.6
171 0.61
172 0.6
173 0.61
174 0.6
175 0.55
176 0.47
177 0.4
178 0.36
179 0.29
180 0.31
181 0.29
182 0.25
183 0.22
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.19
188 0.15
189 0.18
190 0.16
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.21
199 0.21
200 0.24
201 0.27
202 0.3
203 0.33
204 0.37
205 0.41
206 0.41
207 0.43
208 0.48
209 0.47
210 0.52
211 0.56
212 0.58
213 0.51
214 0.48
215 0.44
216 0.37
217 0.35
218 0.28
219 0.21
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.2
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.21
231 0.25
232 0.25
233 0.26
234 0.23
235 0.26
236 0.28
237 0.28
238 0.27
239 0.24
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.15
244 0.18
245 0.25
246 0.36
247 0.42
248 0.51
249 0.61
250 0.7
251 0.78
252 0.85
253 0.88
254 0.88
255 0.88
256 0.87
257 0.83
258 0.82
259 0.81
260 0.81
261 0.82
262 0.8
263 0.81
264 0.8
265 0.8
266 0.77
267 0.78
268 0.77
269 0.76
270 0.76
271 0.75
272 0.78
273 0.74
274 0.75
275 0.7
276 0.68
277 0.67
278 0.62
279 0.58
280 0.56
281 0.55
282 0.5
283 0.45
284 0.39
285 0.34
286 0.29
287 0.27
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.19
295 0.18
296 0.24
297 0.25
298 0.26
299 0.28
300 0.32
301 0.33
302 0.35
303 0.4
304 0.38