Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XGC3

Protein Details
Accession A0A1Y1XGC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-245LMMVLKKKGSNKKAKSGFIKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-240KKRKIKNLMMVLKKKGSNKKAKS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MSDNKAEIFLKKDYHFFKLENDELNNNKIFIWTYWKLNKNDIGKKNNSIEVFEIILSDGERLWSQNIKIKDISVYIKNIKEEDYYTLIKKALTYTKKDTEEKFIYNWNLKDDIANLTIKLEISNSNDNLQNKFQYLLGSIDLLPVKSENRKQIYQLIYEDTEKEYQKLKDENSFLIITNDSLQKIQNEFTEKMTMIVEDKNKLEEVYLLKFRELLNEKKRKIKNLMMVLKKKGSNKKAKSGFIKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.38
4 0.41
5 0.43
6 0.45
7 0.42
8 0.42
9 0.43
10 0.42
11 0.45
12 0.4
13 0.31
14 0.28
15 0.23
16 0.22
17 0.17
18 0.23
19 0.21
20 0.28
21 0.37
22 0.44
23 0.46
24 0.5
25 0.56
26 0.56
27 0.63
28 0.64
29 0.64
30 0.61
31 0.65
32 0.64
33 0.62
34 0.54
35 0.46
36 0.39
37 0.33
38 0.29
39 0.22
40 0.18
41 0.13
42 0.12
43 0.1
44 0.08
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.12
51 0.13
52 0.19
53 0.21
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.25
60 0.22
61 0.25
62 0.26
63 0.28
64 0.28
65 0.28
66 0.26
67 0.23
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.2
72 0.2
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.22
79 0.24
80 0.28
81 0.33
82 0.4
83 0.45
84 0.48
85 0.46
86 0.46
87 0.46
88 0.42
89 0.37
90 0.34
91 0.33
92 0.33
93 0.32
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.21
98 0.18
99 0.17
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.1
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.18
114 0.19
115 0.21
116 0.21
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.13
134 0.17
135 0.23
136 0.28
137 0.29
138 0.31
139 0.37
140 0.38
141 0.36
142 0.33
143 0.29
144 0.26
145 0.25
146 0.25
147 0.2
148 0.21
149 0.18
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.25
154 0.28
155 0.28
156 0.31
157 0.33
158 0.32
159 0.31
160 0.3
161 0.25
162 0.23
163 0.21
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.22
175 0.23
176 0.25
177 0.27
178 0.24
179 0.24
180 0.22
181 0.19
182 0.15
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.22
194 0.27
195 0.26
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.33
200 0.35
201 0.38
202 0.43
203 0.52
204 0.57
205 0.64
206 0.7
207 0.69
208 0.72
209 0.71
210 0.7
211 0.71
212 0.77
213 0.77
214 0.79
215 0.76
216 0.75
217 0.71
218 0.7
219 0.7
220 0.7
221 0.71
222 0.72
223 0.76
224 0.78
225 0.82