Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IYW4

Protein Details
Accession A0A1X2IYW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-72GDKRRGGDKRQGGRPQRGRQFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-70QPKNDKRSPKSAGAKKSGGDKRRGGDKRQGGRPQRGR
211-232REQRPARGGNDRRGGRNNNRRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, cyto 11, nucl 10.5, cyto_mito 8.499, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSAFSKNAFSLLSEDGEVRPQPAPVKEEAKPVEQPKNDKRSPKSAGAKKSGGDKRRGGDKRQGGRPQRGRQFDRHSATGIVDSEKKEKQGWGHAETAEAEAASDAVNPKDPAAAEQAAAPVEAEEEAVKTLDEYLAEKANKNLKVTLPEARKANEGADDAKWKDTVAFSKTEEPEYLPAKEKAAKKEKVVKTTKVFVEIEQRFQEKPRFQREQRPARGGNDRRGGRNNNRRGGRQSNGVNVNLQDDSAFPSLGAASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.19
4 0.19
5 0.18
6 0.16
7 0.17
8 0.21
9 0.24
10 0.27
11 0.28
12 0.33
13 0.33
14 0.41
15 0.42
16 0.42
17 0.45
18 0.48
19 0.52
20 0.51
21 0.58
22 0.59
23 0.66
24 0.67
25 0.69
26 0.69
27 0.69
28 0.7
29 0.71
30 0.72
31 0.7
32 0.73
33 0.71
34 0.68
35 0.6
36 0.64
37 0.62
38 0.58
39 0.57
40 0.53
41 0.51
42 0.59
43 0.62
44 0.57
45 0.59
46 0.62
47 0.64
48 0.68
49 0.73
50 0.7
51 0.76
52 0.8
53 0.8
54 0.79
55 0.79
56 0.74
57 0.74
58 0.75
59 0.74
60 0.69
61 0.61
62 0.54
63 0.46
64 0.41
65 0.35
66 0.27
67 0.2
68 0.17
69 0.18
70 0.2
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.28
77 0.32
78 0.31
79 0.33
80 0.31
81 0.3
82 0.29
83 0.27
84 0.18
85 0.12
86 0.08
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.11
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.06
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.15
126 0.21
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.21
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.27
135 0.29
136 0.3
137 0.29
138 0.29
139 0.26
140 0.25
141 0.19
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.24
157 0.26
158 0.26
159 0.25
160 0.23
161 0.25
162 0.25
163 0.26
164 0.23
165 0.22
166 0.23
167 0.29
168 0.32
169 0.37
170 0.44
171 0.45
172 0.48
173 0.58
174 0.61
175 0.65
176 0.67
177 0.64
178 0.6
179 0.64
180 0.59
181 0.54
182 0.48
183 0.4
184 0.44
185 0.39
186 0.39
187 0.35
188 0.36
189 0.31
190 0.35
191 0.42
192 0.39
193 0.45
194 0.5
195 0.56
196 0.58
197 0.68
198 0.74
199 0.77
200 0.78
201 0.78
202 0.72
203 0.69
204 0.75
205 0.71
206 0.7
207 0.68
208 0.63
209 0.6
210 0.64
211 0.67
212 0.67
213 0.72
214 0.72
215 0.72
216 0.74
217 0.73
218 0.73
219 0.72
220 0.66
221 0.64
222 0.59
223 0.59
224 0.58
225 0.54
226 0.49
227 0.41
228 0.4
229 0.31
230 0.26
231 0.17
232 0.13
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.12
237 0.12