Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2I7F3

Protein Details
Accession A0A1X2I7F3    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-47ADQYRQKESSRSPKPYRRNQLNQPGFPGHydrophilic
79-105AGMPRPQHPQQQKHFHHQQQQQQQQQRHydrophilic
496-526KSYSRSSTSHHRDSRKRSRSRSLSPPERHSSHydrophilic
529-554RRHSNSSSSGHRKPRRTSRSPAPTAAHydrophilic
591-616EDEDDHHHRRHRRSSNSRHHRSGSSRBasic
621-658SSSTRHRSSSRHRHSDDYRKSDRYRDSSRDRSYRRDKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
507-549RDSRKRSRSRSLSPPERHSSSRRRHSNSSSSGHRKPRRTSRSP
599-635RRHRRSSNSRHHRSGSSRRHHGSSSTRHRSSSRHRHS
639-640RK
648-658SRDRSYRRDKK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033489  RBBP6  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16620  vRING-HC-C4C4_RBBP6  
Amino Acid Sequences MDSEEGGSQHTTQDGLSHHADQYRQKESSRSPKPYRRNQLNQPGFPGNTGSMFDPMMAMNMNMGMMNPLQFQLMTMQQAGMPRPQHPQQQKHFHHQQQQQQQQQRPSESQVPPPGYVCHKCGQAGHWIYYCPNVPKGQYVPRQNNSSQSAPIPALTETDITPDELVCTICNELFRNASISLCCGKSFCEDCIVNALDKTHQCPHCGKSASSDQVVPNKTLRKIVGVFEDERQSLKETNHPTYRKQQEKFNTENDRFEGLDNSHKNGSDEIDMGTSKQHDQQPASPPLDNQKLANLHPQQINAHQQQQQSHTPFDSTDNNHGGHGRKQNTQGMDSMGRGFNGAPPAGMPFMANPTMFMGGSGAVPPFGFPDMSWMFGGNGTGNNSGGGRGGPFPAMNAMPMLPSFFGGNNGAPIHYPGGFSGRGRGTGGKNSTNTQQKQQQRRQSDTTPYDLSNDTENTKTVDTATHDSRSSSRRRHHQYDDDNASEIEGHDSTRSKSYSRSSTSHHRDSRKRSRSRSLSPPERHSSSRRRHSNSSSSGHRKPRRTSRSPAPTAAPAPAPGTRAGTTKHYQDEGDDIVDYGDDDFEDEDEGEDEDDHHHRRHRRSSNSRHHRSGSSRRHHGSSSTRHRSSSRHRHSDDYRKSDRYRDSSRDRSYRRDKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.21
4 0.23
5 0.25
6 0.28
7 0.32
8 0.36
9 0.41
10 0.44
11 0.43
12 0.42
13 0.47
14 0.53
15 0.6
16 0.63
17 0.66
18 0.69
19 0.77
20 0.85
21 0.89
22 0.91
23 0.9
24 0.9
25 0.9
26 0.91
27 0.91
28 0.84
29 0.8
30 0.74
31 0.64
32 0.55
33 0.47
34 0.37
35 0.28
36 0.26
37 0.21
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.13
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.19
67 0.22
68 0.21
69 0.22
70 0.28
71 0.33
72 0.42
73 0.48
74 0.57
75 0.61
76 0.7
77 0.74
78 0.78
79 0.83
80 0.81
81 0.81
82 0.79
83 0.79
84 0.79
85 0.82
86 0.81
87 0.8
88 0.79
89 0.77
90 0.75
91 0.71
92 0.63
93 0.6
94 0.6
95 0.54
96 0.55
97 0.55
98 0.52
99 0.48
100 0.46
101 0.43
102 0.41
103 0.41
104 0.37
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.32
109 0.31
110 0.34
111 0.34
112 0.34
113 0.31
114 0.3
115 0.29
116 0.31
117 0.32
118 0.25
119 0.26
120 0.24
121 0.24
122 0.28
123 0.33
124 0.39
125 0.43
126 0.5
127 0.56
128 0.59
129 0.64
130 0.61
131 0.62
132 0.58
133 0.53
134 0.45
135 0.36
136 0.33
137 0.28
138 0.27
139 0.21
140 0.16
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.13
171 0.14
172 0.19
173 0.2
174 0.18
175 0.22
176 0.21
177 0.22
178 0.27
179 0.26
180 0.21
181 0.2
182 0.2
183 0.17
184 0.18
185 0.22
186 0.25
187 0.25
188 0.28
189 0.32
190 0.33
191 0.37
192 0.39
193 0.35
194 0.33
195 0.39
196 0.39
197 0.37
198 0.37
199 0.32
200 0.36
201 0.37
202 0.33
203 0.3
204 0.31
205 0.31
206 0.32
207 0.29
208 0.27
209 0.27
210 0.28
211 0.28
212 0.27
213 0.27
214 0.26
215 0.28
216 0.24
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.22
223 0.25
224 0.31
225 0.39
226 0.4
227 0.42
228 0.49
229 0.58
230 0.6
231 0.57
232 0.59
233 0.6
234 0.65
235 0.65
236 0.64
237 0.63
238 0.56
239 0.56
240 0.5
241 0.43
242 0.36
243 0.32
244 0.26
245 0.18
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.21
267 0.26
268 0.33
269 0.38
270 0.39
271 0.34
272 0.32
273 0.35
274 0.37
275 0.32
276 0.25
277 0.23
278 0.23
279 0.24
280 0.31
281 0.27
282 0.27
283 0.27
284 0.28
285 0.25
286 0.27
287 0.33
288 0.27
289 0.3
290 0.3
291 0.31
292 0.32
293 0.36
294 0.38
295 0.34
296 0.33
297 0.27
298 0.24
299 0.22
300 0.23
301 0.23
302 0.19
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.22
307 0.24
308 0.23
309 0.24
310 0.29
311 0.27
312 0.28
313 0.31
314 0.35
315 0.34
316 0.33
317 0.28
318 0.24
319 0.22
320 0.18
321 0.17
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.2
412 0.19
413 0.25
414 0.29
415 0.28
416 0.29
417 0.3
418 0.36
419 0.41
420 0.41
421 0.4
422 0.45
423 0.5
424 0.59
425 0.66
426 0.69
427 0.67
428 0.71
429 0.71
430 0.68
431 0.69
432 0.61
433 0.57
434 0.51
435 0.44
436 0.4
437 0.34
438 0.3
439 0.23
440 0.21
441 0.18
442 0.16
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.19
451 0.22
452 0.22
453 0.22
454 0.24
455 0.27
456 0.31
457 0.35
458 0.39
459 0.44
460 0.51
461 0.6
462 0.67
463 0.71
464 0.75
465 0.75
466 0.76
467 0.75
468 0.66
469 0.58
470 0.5
471 0.41
472 0.31
473 0.24
474 0.17
475 0.1
476 0.09
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.18
481 0.19
482 0.17
483 0.22
484 0.28
485 0.35
486 0.39
487 0.4
488 0.41
489 0.51
490 0.58
491 0.64
492 0.65
493 0.66
494 0.69
495 0.77
496 0.83
497 0.82
498 0.83
499 0.81
500 0.84
501 0.84
502 0.83
503 0.83
504 0.83
505 0.83
506 0.81
507 0.81
508 0.77
509 0.73
510 0.69
511 0.67
512 0.67
513 0.67
514 0.7
515 0.72
516 0.72
517 0.75
518 0.78
519 0.8
520 0.77
521 0.73
522 0.73
523 0.71
524 0.73
525 0.75
526 0.76
527 0.74
528 0.76
529 0.8
530 0.81
531 0.79
532 0.8
533 0.8
534 0.83
535 0.8
536 0.74
537 0.67
538 0.62
539 0.56
540 0.5
541 0.4
542 0.3
543 0.27
544 0.25
545 0.23
546 0.19
547 0.21
548 0.2
549 0.21
550 0.22
551 0.26
552 0.28
553 0.32
554 0.35
555 0.33
556 0.32
557 0.31
558 0.32
559 0.27
560 0.25
561 0.19
562 0.15
563 0.13
564 0.13
565 0.12
566 0.08
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.11
581 0.15
582 0.18
583 0.22
584 0.29
585 0.37
586 0.46
587 0.56
588 0.63
589 0.69
590 0.77
591 0.84
592 0.88
593 0.91
594 0.92
595 0.89
596 0.84
597 0.8
598 0.79
599 0.79
600 0.78
601 0.77
602 0.78
603 0.75
604 0.74
605 0.68
606 0.66
607 0.65
608 0.65
609 0.66
610 0.66
611 0.64
612 0.64
613 0.65
614 0.67
615 0.68
616 0.69
617 0.68
618 0.69
619 0.7
620 0.75
621 0.82
622 0.84
623 0.83
624 0.81
625 0.79
626 0.76
627 0.77
628 0.76
629 0.76
630 0.73
631 0.72
632 0.72
633 0.74
634 0.76
635 0.82
636 0.84
637 0.8
638 0.82