FuNGI

A0A1X2IJN1

Protein Details

Accession

A0A1X2IJN1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
392-414	GTKSASSKKKSKSPKIDKPYLED	Hydrophilic
427-457	NSIFTDGNKQRRRGRKKIKRKTNTPANDDII	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
389-406	PKPGTKSASSKKKSKSPK
435-447	KQRRRGRKKIKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 15, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045348 CPSF4/Yth1 IPR000571 Znf_CCCH IPR036855 Znf_CCCH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0098789 P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
PROSITE	View protein in PROSITE PS50103 ZF_C3H1

Amino Acid Sequences

MKPAINLSCLEEESSPLSMPSSLSSSSILDSPHTFVDSNFTLSKSFDPFDFTYLNNLIPTTTTKSNTSATCSIPPSLWTIQSGALSYSATNGGDMHDQYGEEDYAETDDHYPPHFLIDLDLLDDNAMGSALMVQSESESNLPSCPANKCRVGASLSPVGVGVGASSGGSAVTGAGAITAAGMINRRLLHLPYLFISSSSSSSSSSSSSSSSSVTGVNIWSNNYYRYLDPFDDDEFDPTQPASPSLSSDISVSPQFTCASPCRQQSTAIDMLTDLIPHYTQQQLALTLSKANYDMDRFLELVSSGDDDAGVPFISYTKKRQVCRHFLSGDCHRQDCRFAHDISIKVCKFWLQGGCLKGPQCEFAHSLEPICIRSQNDTATTTSIASTRSPKPGTKSASSKKKSKSPKIDKPYLEDLHQRQDQCYTLDNSIFTDGNKQRRRGRKKIKRKTNTPANDDIITNNINNCDNTHLSPALIDHPVDDDFPTLLSSSQSPAATGVCPLPMSTPSSSNFAQVVARSKVEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.18
3	0.14
4	0.15
5	0.13
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.14
10	0.15
11	0.16
12	0.16
13	0.17
14	0.18
15	0.17
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.18
20	0.19
21	0.18
22	0.16
23	0.22
24	0.21
25	0.23
26	0.22
27	0.22
28	0.21
29	0.22
30	0.25
31	0.23
32	0.22
33	0.19
34	0.24
35	0.24
36	0.26
37	0.27
38	0.24
39	0.26
40	0.26
41	0.27
42	0.21
43	0.2
44	0.16
45	0.16
46	0.19
47	0.19
48	0.22
49	0.24
50	0.26
51	0.29
52	0.34
53	0.34
54	0.37
55	0.34
56	0.33
57	0.36
58	0.36
59	0.34
60	0.3
61	0.29
62	0.28
63	0.27
64	0.25
65	0.21
66	0.2
67	0.21
68	0.21
69	0.2
70	0.15
71	0.13
72	0.13
73	0.11
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.12
81	0.13
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.14
87	0.12
88	0.1
89	0.09
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.11
96	0.12
97	0.13
98	0.14
99	0.13
100	0.15
101	0.14
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.12
107	0.12
108	0.1
109	0.09
110	0.09
111	0.07
112	0.05
113	0.05
114	0.03
115	0.03
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.06
123	0.07
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.13
131	0.18
132	0.22
133	0.26
134	0.29
135	0.29
136	0.3
137	0.33
138	0.33
139	0.29
140	0.3
141	0.29
142	0.26
143	0.25
144	0.23
145	0.19
146	0.15
147	0.13
148	0.07
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.03
155	0.03
156	0.03
157	0.02
158	0.02
159	0.02
160	0.02
161	0.02
162	0.02
163	0.02
164	0.02
165	0.02
166	0.02
167	0.03
168	0.04
169	0.04
170	0.07
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.11
175	0.15
176	0.15
177	0.16
178	0.14
179	0.17
180	0.15
181	0.14
182	0.15
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.1
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.13
210	0.14
211	0.13
212	0.15
213	0.18
214	0.17
215	0.17
216	0.18
217	0.17
218	0.18
219	0.18
220	0.17
221	0.15
222	0.14
223	0.13
224	0.11
225	0.12
226	0.09
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.09
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.11
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.11
244	0.12
245	0.17
246	0.21
247	0.24
248	0.26
249	0.26
250	0.29
251	0.27
252	0.31
253	0.28
254	0.23
255	0.21
256	0.17
257	0.17
258	0.15
259	0.13
260	0.07
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.11
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.03
298	0.03
299	0.05
300	0.08
301	0.1
302	0.14
303	0.23
304	0.29
305	0.34
306	0.44
307	0.52
308	0.59
309	0.64
310	0.67
311	0.6
312	0.57
313	0.59
314	0.57
315	0.57
316	0.49
317	0.45
318	0.39
319	0.37
320	0.39
321	0.35
322	0.33
323	0.28
324	0.26
325	0.3
326	0.32
327	0.33
328	0.31
329	0.38
330	0.31
331	0.28
332	0.27
333	0.24
334	0.21
335	0.23
336	0.24
337	0.19
338	0.24
339	0.26
340	0.28
341	0.29
342	0.29
343	0.27
344	0.24
345	0.24
346	0.2
347	0.21
348	0.21
349	0.21
350	0.23
351	0.21
352	0.21
353	0.19
354	0.19
355	0.17
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.18
360	0.2
361	0.2
362	0.22
363	0.22
364	0.22
365	0.21
366	0.21
367	0.17
368	0.15
369	0.14
370	0.13
371	0.14
372	0.18
373	0.2
374	0.27
375	0.3
376	0.33
377	0.38
378	0.44
379	0.48
380	0.5
381	0.56
382	0.59
383	0.66
384	0.69
385	0.71
386	0.7
387	0.73
388	0.77
389	0.78
390	0.79
391	0.79
392	0.85
393	0.86
394	0.88
395	0.82
396	0.79
397	0.77
398	0.68
399	0.61
400	0.58
401	0.52
402	0.51
403	0.52
404	0.46
405	0.38
406	0.38
407	0.37
408	0.3
409	0.31
410	0.26
411	0.25
412	0.25
413	0.25
414	0.23
415	0.23
416	0.22
417	0.18
418	0.24
419	0.27
420	0.36
421	0.43
422	0.48
423	0.55
424	0.65
425	0.75
426	0.76
427	0.82
428	0.83
429	0.88
430	0.92
431	0.94
432	0.94
433	0.94
434	0.94
435	0.94
436	0.92
437	0.87
438	0.83
439	0.76
440	0.67
441	0.58
442	0.48
443	0.41
444	0.33
445	0.27
446	0.21
447	0.19
448	0.19
449	0.19
450	0.19
451	0.2
452	0.22
453	0.23
454	0.26
455	0.24
456	0.22
457	0.22
458	0.22
459	0.21
460	0.19
461	0.17
462	0.13
463	0.15
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.09
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.16
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.17
481	0.16
482	0.17
483	0.16
484	0.13
485	0.13
486	0.13
487	0.14
488	0.15
489	0.19
490	0.19
491	0.22
492	0.23
493	0.28
494	0.28
495	0.29
496	0.27
497	0.24
498	0.24
499	0.24
500	0.29
501	0.27

A0A1X2IJN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer