Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IMU0

Protein Details
Accession A0A1X2IMU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EERSCFRNRRDTRYLRPDANHydrophilic
562-588TGNNPGRPYHHSNRQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
591-622QQQQPQPQPQQQQHHHQHQHQHQQHQHQQPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 8, cyto 7.5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045245  Pfs2-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQEPPSKEYGGRQGGRQGNTPFSKMVFDGKRMRKAIQRQTVDYNHSMIKWMEERSCFRNRRDTRYLRPDANFILDLLPPAGYLDHPTNAVTTKFIHTSTNKVRYPINVVRWTPEGRRLITGSSSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSAVRAMDWSHNDNWMVTGDHSGIIKYWQSNMSNLKMFQAHKEAIRDLTFAPSDTRFATCSDDSLIKIWDFNTGVEERALTGHGWDVKCVDWHPYKALLGSGSKDNLIKLWDPKSAKNITTLHGHKNTILALEWNQNGNWLVTAGRDQLIKIFDIRTMKELQIFRGQQKEVCSARWHPQHEKLLATGGSEGSLMFWLAGEDDPIGEQETAHDSNIWSLDWHPVGHILVTGSNDHTTRFWTRPRPGDTSLDKFDASLHRDEKEEEEYIEPPPFRPNNAIMNQSMEPPPFRPANAFPPSPNMNARHDRPSLPPQQQLMDDHQQKQQKQHYKGHGDQPPFFTPSPHQQQQQQQQQQQQQQQHHRPSPPNLQKFRPPPPPPSSQHHHHQQQQDYQRRPPPSQQRYPTGGPMPPPPRNQGRGTGNNPGRPYHHSNRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQPQQQQHHHQHQHQHQQHQHQQPPPPQQQYQQPRSMPLFGNQRPPLHLPRWLHKMGSDRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.57
4 0.5
5 0.5
6 0.51
7 0.5
8 0.43
9 0.37
10 0.36
11 0.31
12 0.36
13 0.32
14 0.36
15 0.43
16 0.5
17 0.58
18 0.59
19 0.62
20 0.62
21 0.68
22 0.71
23 0.71
24 0.69
25 0.65
26 0.71
27 0.72
28 0.7
29 0.61
30 0.54
31 0.46
32 0.39
33 0.38
34 0.29
35 0.28
36 0.26
37 0.28
38 0.3
39 0.33
40 0.38
41 0.41
42 0.51
43 0.52
44 0.53
45 0.6
46 0.61
47 0.65
48 0.71
49 0.74
50 0.74
51 0.79
52 0.81
53 0.78
54 0.73
55 0.68
56 0.6
57 0.56
58 0.46
59 0.36
60 0.3
61 0.23
62 0.21
63 0.17
64 0.14
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.11
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.19
82 0.24
83 0.24
84 0.33
85 0.42
86 0.49
87 0.47
88 0.47
89 0.48
90 0.45
91 0.53
92 0.51
93 0.5
94 0.48
95 0.47
96 0.49
97 0.51
98 0.52
99 0.46
100 0.46
101 0.42
102 0.36
103 0.39
104 0.36
105 0.34
106 0.32
107 0.31
108 0.25
109 0.21
110 0.2
111 0.17
112 0.15
113 0.13
114 0.12
115 0.15
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.18
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.21
146 0.18
147 0.16
148 0.12
149 0.13
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.18
161 0.23
162 0.27
163 0.3
164 0.31
165 0.3
166 0.3
167 0.29
168 0.29
169 0.28
170 0.29
171 0.27
172 0.26
173 0.29
174 0.28
175 0.26
176 0.26
177 0.24
178 0.19
179 0.21
180 0.18
181 0.16
182 0.17
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.13
188 0.14
189 0.18
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.19
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.17
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.18
242 0.23
243 0.25
244 0.26
245 0.32
246 0.34
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.29
251 0.35
252 0.36
253 0.37
254 0.37
255 0.36
256 0.3
257 0.3
258 0.28
259 0.21
260 0.18
261 0.12
262 0.1
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.2
291 0.2
292 0.2
293 0.25
294 0.27
295 0.26
296 0.29
297 0.29
298 0.26
299 0.28
300 0.32
301 0.26
302 0.26
303 0.27
304 0.25
305 0.32
306 0.36
307 0.38
308 0.36
309 0.42
310 0.46
311 0.45
312 0.42
313 0.35
314 0.31
315 0.26
316 0.22
317 0.15
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.06
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.12
367 0.15
368 0.17
369 0.22
370 0.29
371 0.35
372 0.42
373 0.47
374 0.49
375 0.49
376 0.53
377 0.52
378 0.5
379 0.47
380 0.41
381 0.35
382 0.3
383 0.29
384 0.26
385 0.24
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.23
391 0.23
392 0.22
393 0.2
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.17
398 0.19
399 0.17
400 0.14
401 0.2
402 0.2
403 0.19
404 0.22
405 0.24
406 0.29
407 0.32
408 0.34
409 0.27
410 0.3
411 0.29
412 0.29
413 0.27
414 0.2
415 0.18
416 0.17
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.19
422 0.28
423 0.32
424 0.31
425 0.28
426 0.33
427 0.36
428 0.35
429 0.36
430 0.31
431 0.33
432 0.38
433 0.41
434 0.41
435 0.41
436 0.4
437 0.42
438 0.46
439 0.48
440 0.47
441 0.48
442 0.43
443 0.43
444 0.42
445 0.4
446 0.38
447 0.39
448 0.39
449 0.37
450 0.41
451 0.45
452 0.45
453 0.5
454 0.53
455 0.54
456 0.56
457 0.62
458 0.66
459 0.69
460 0.73
461 0.74
462 0.71
463 0.66
464 0.62
465 0.59
466 0.52
467 0.48
468 0.41
469 0.34
470 0.32
471 0.37
472 0.42
473 0.41
474 0.41
475 0.44
476 0.53
477 0.61
478 0.68
479 0.67
480 0.64
481 0.67
482 0.72
483 0.73
484 0.71
485 0.69
486 0.67
487 0.69
488 0.72
489 0.74
490 0.73
491 0.72
492 0.71
493 0.71
494 0.73
495 0.73
496 0.74
497 0.7
498 0.68
499 0.7
500 0.71
501 0.73
502 0.72
503 0.67
504 0.66
505 0.66
506 0.7
507 0.66
508 0.66
509 0.65
510 0.6
511 0.64
512 0.65
513 0.66
514 0.65
515 0.68
516 0.67
517 0.69
518 0.73
519 0.74
520 0.7
521 0.7
522 0.7
523 0.67
524 0.65
525 0.66
526 0.67
527 0.67
528 0.72
529 0.71
530 0.71
531 0.72
532 0.71
533 0.67
534 0.61
535 0.53
536 0.46
537 0.48
538 0.49
539 0.49
540 0.5
541 0.51
542 0.54
543 0.57
544 0.57
545 0.56
546 0.57
547 0.6
548 0.61
549 0.64
550 0.62
551 0.62
552 0.6
553 0.54
554 0.49
555 0.47
556 0.51
557 0.5
558 0.54
559 0.59
560 0.67
561 0.74
562 0.81
563 0.82
564 0.81
565 0.82
566 0.82
567 0.82
568 0.82
569 0.8
570 0.78
571 0.78
572 0.78
573 0.75
574 0.72
575 0.7
576 0.7
577 0.7
578 0.72
579 0.71
580 0.73
581 0.73
582 0.75
583 0.76
584 0.75
585 0.76
586 0.76
587 0.78
588 0.77
589 0.8
590 0.8
591 0.81
592 0.82
593 0.79
594 0.81
595 0.8
596 0.84
597 0.81
598 0.81
599 0.77
600 0.79
601 0.82
602 0.82
603 0.8
604 0.76
605 0.77
606 0.75
607 0.78
608 0.77
609 0.75
610 0.69
611 0.67
612 0.71
613 0.73
614 0.73
615 0.71
616 0.64
617 0.63
618 0.63
619 0.63
620 0.55
621 0.51
622 0.53
623 0.49
624 0.57
625 0.56
626 0.54
627 0.53
628 0.57
629 0.57
630 0.51
631 0.55
632 0.51
633 0.54
634 0.6
635 0.58
636 0.53
637 0.5