FuNGI

A0A1X2I5F3

Protein Details

Accession

A0A1X2I5F3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
193-215	PQPTHRSVFRKHQQQQQQKMEMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 11, nucl 5, mito 5, mito_nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MNRSNIRSNPAHYDRDEDLEQLQREFMNSNEVSSASVSRKAPPSFGSGSKKPSLFAQRRAAAAAAATATTTTARSPSEKKSGITIADLANEGSSSGVAMPGLESASSNMPGLEETSAMPGLSSTTVEDHPNDQGDSAISYEPVVDPNPEPHIPATKKMLDLTSMLGSILGQVTEHSVENVTAPTLTAQHQGFPQPTHRSVFRKHQQQQQQKMEMTTSPASTAVSDNADDESQSKHQHDYQNENDQRIAAMTDDEIQAARDEILGSLSQDSIAYLNQLQGKRAKPLSDIPQQKQQSPRSGETAGNDYTDGAAAGDDDLWAMKNKYFADVPLEGDKLAWIDDRFKAHMDNNKSKEDGAAAGDGEKEDGNVDPVYRQLRFDLQGRVVDPNDVNRARQQELHHHGDQPDQAGYTLAELFYLVRSQVPSQRALILNILTRILEHAKKDPLQKDNKAIIQVFRRRDVAAAVYFRSALDDRHLVVVISAIQALLALATVDRLEDESSSLVTFNTWLGHISQPLLAAPQETTKKWVNKMKSATMGGGHDQQGTDDDAGLAERDMLDALTQMDIFARLRYLMAVDSDVRVSDSTSMERMVELLTCMAELKGEAICEAILANGVFDLALGWVDDQQQHNMDVGSSPEHRLRVLRLVTAVIRGSKKAAMDVKDAVTLLTLPWLATSAATHGDYQVQIESLKILRLLACYGIVVPTLQDLQDTVMQWLAAAINSNKKALDMGDTTRVDNNNRAATVIGLLEVLLHAAADPHKTTPAHAINWHQPSSFLPLITTLLDTTTASMAIGKTKNEMLHGTCLGYLSTWTSYLDKFPPESMDTLKQVWDVMQQQQMNQDQKENTNLSSHWILRYMQLWLYFTKLDGNKTIATPWITASMMEQSRAYWKSLGYLVQQALTHNDFYGRMVYYLWHRIMDSNEELETDGLNAERGDVDDATMGMVVNSLHAGVVETWLARALLRMCVLSCLDKDNTELANELEPFYLNQGNDNDRDEGETRDVRLSKQLMELDGQDISTLCYPRKTGPDAASSVDAWLLSPVDEIYYWDKSQVTQHLLQQQLHDSTEIQSQQQQRGPITTVTNVVINTLQAVWQLHLHHLDHSLLLVSLMKIFLVGDREGQSLMVDGAAAIREIFWDEALATQMDRWMNVLEDQDNKKPLITGLTSLEQAWLTSSDYTRQAHVPFYQFYQAFLSQYASVSLGHRVYSRVLAFVAKKVSDQVDYRHLLLSDYQDILTTLKRQGYSLDLATPSMEQKTNVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.48
3	0.45
4	0.36
5	0.33
6	0.35
7	0.35
8	0.29
9	0.28
10	0.23
11	0.23
12	0.23
13	0.2
14	0.21
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.2
20	0.2
21	0.24
22	0.17
23	0.24
24	0.24
25	0.29
26	0.36
27	0.37
28	0.38
29	0.36
30	0.4
31	0.39
32	0.46
33	0.49
34	0.46
35	0.52
36	0.55
37	0.54
38	0.48
39	0.51
40	0.54
41	0.53
42	0.56
43	0.59
44	0.57
45	0.58
46	0.59
47	0.51
48	0.4
49	0.32
50	0.25
51	0.15
52	0.11
53	0.1
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.1
60	0.12
61	0.18
62	0.23
63	0.3
64	0.39
65	0.42
66	0.42
67	0.46
68	0.48
69	0.44
70	0.42
71	0.38
72	0.29
73	0.27
74	0.27
75	0.21
76	0.16
77	0.14
78	0.12
79	0.09
80	0.07
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.08
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.12
99	0.11
100	0.09
101	0.08
102	0.11
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.09
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.08
111	0.11
112	0.13
113	0.15
114	0.17
115	0.18
116	0.2
117	0.22
118	0.21
119	0.18
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.12
125	0.1
126	0.09
127	0.1
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.16
134	0.22
135	0.22
136	0.23
137	0.23
138	0.32
139	0.32
140	0.35
141	0.39
142	0.36
143	0.38
144	0.39
145	0.38
146	0.29
147	0.28
148	0.27
149	0.21
150	0.18
151	0.16
152	0.13
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.07
157	0.05
158	0.05
159	0.08
160	0.09
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.11
173	0.16
174	0.15
175	0.17
176	0.19
177	0.23
178	0.25
179	0.26
180	0.32
181	0.34
182	0.37
183	0.39
184	0.43
185	0.44
186	0.48
187	0.56
188	0.58
189	0.62
190	0.66
191	0.72
192	0.77
193	0.81
194	0.85
195	0.84
196	0.82
197	0.74
198	0.68
199	0.6
200	0.5
201	0.45
202	0.37
203	0.27
204	0.21
205	0.18
206	0.17
207	0.16
208	0.16
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.15
219	0.19
220	0.2
221	0.22
222	0.28
223	0.35
224	0.39
225	0.44
226	0.48
227	0.55
228	0.57
229	0.55
230	0.5
231	0.43
232	0.37
233	0.29
234	0.22
235	0.12
236	0.09
237	0.08
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.07
261	0.11
262	0.16
263	0.17
264	0.2
265	0.25
266	0.27
267	0.32
268	0.35
269	0.33
270	0.31
271	0.37
272	0.42
273	0.46
274	0.52
275	0.49
276	0.56
277	0.57
278	0.59
279	0.6
280	0.59
281	0.58
282	0.56
283	0.55
284	0.5
285	0.5
286	0.47
287	0.41
288	0.39
289	0.31
290	0.25
291	0.22
292	0.17
293	0.15
294	0.13
295	0.11
296	0.06
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.12
309	0.13
310	0.15
311	0.16
312	0.16
313	0.2
314	0.2
315	0.22
316	0.22
317	0.22
318	0.19
319	0.18
320	0.18
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.08
325	0.11
326	0.15
327	0.18
328	0.19
329	0.19
330	0.21
331	0.24
332	0.31
333	0.37
334	0.43
335	0.45
336	0.47
337	0.46
338	0.44
339	0.39
340	0.33
341	0.25
342	0.17
343	0.14
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.11
358	0.14
359	0.14
360	0.15
361	0.14
362	0.18
363	0.2
364	0.24
365	0.26
366	0.25
367	0.27
368	0.27
369	0.29
370	0.25
371	0.25
372	0.22
373	0.2
374	0.25
375	0.24
376	0.24
377	0.25
378	0.28
379	0.27
380	0.31
381	0.31
382	0.33
383	0.4
384	0.45
385	0.43
386	0.42
387	0.42
388	0.4
389	0.38
390	0.3
391	0.23
392	0.17
393	0.15
394	0.12
395	0.11
396	0.09
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.05
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.07
407	0.09
408	0.15
409	0.17
410	0.18
411	0.19
412	0.23
413	0.23
414	0.23
415	0.23
416	0.19
417	0.18
418	0.17
419	0.16
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.13
424	0.14
425	0.15
426	0.18
427	0.23
428	0.27
429	0.34
430	0.37
431	0.42
432	0.48
433	0.5
434	0.53
435	0.53
436	0.52
437	0.49
438	0.44
439	0.4
440	0.41
441	0.44
442	0.4
443	0.37
444	0.37
445	0.33
446	0.32
447	0.29
448	0.24
449	0.21
450	0.19
451	0.18
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.13
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.13
463	0.11
464	0.1
465	0.1
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.03
474	0.02
475	0.02
476	0.02
477	0.02
478	0.02
479	0.02
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.06
492	0.05
493	0.06
494	0.05
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.11
508	0.13
509	0.13
510	0.17
511	0.22
512	0.26
513	0.32
514	0.38
515	0.38
516	0.43
517	0.47
518	0.47
519	0.45
520	0.43
521	0.37
522	0.32
523	0.29
524	0.23
525	0.21
526	0.18
527	0.14
528	0.13
529	0.12
530	0.12
531	0.11
532	0.1
533	0.07
534	0.06
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.06
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.02
603	0.03
604	0.02
605	0.02
606	0.02
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.09
617	0.09
618	0.07
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.09
623	0.11
624	0.11
625	0.12
626	0.12
627	0.13
628	0.17
629	0.17
630	0.16
631	0.15
632	0.15
633	0.15
634	0.16
635	0.15
636	0.12
637	0.12
638	0.11
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.14
643	0.18
644	0.17
645	0.19
646	0.2
647	0.2
648	0.19
649	0.19
650	0.15
651	0.11
652	0.09
653	0.06
654	0.05
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.08
669	0.09
670	0.08
671	0.07
672	0.06
673	0.06
674	0.07
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.05
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.06
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.06
704	0.04
705	0.05
706	0.06
707	0.11
708	0.12
709	0.13
710	0.12
711	0.12
712	0.13
713	0.12
714	0.14
715	0.11
716	0.13
717	0.19
718	0.2
719	0.21
720	0.23
721	0.24
722	0.22
723	0.23
724	0.25
725	0.19
726	0.19
727	0.18
728	0.16
729	0.14
730	0.14
731	0.1
732	0.07
733	0.05
734	0.05
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.02
739	0.02
740	0.02
741	0.03
742	0.04
743	0.05
744	0.06
745	0.07
746	0.1
747	0.1
748	0.11
749	0.18
750	0.21
751	0.22
752	0.24
753	0.28
754	0.32
755	0.37
756	0.37
757	0.29
758	0.26
759	0.25
760	0.3
761	0.27
762	0.19
763	0.15
764	0.15
765	0.16
766	0.15
767	0.14
768	0.07
769	0.06
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.06
774	0.06
775	0.05
776	0.06
777	0.06
778	0.1
779	0.12
780	0.11
781	0.13
782	0.15
783	0.16
784	0.16
785	0.18
786	0.15
787	0.17
788	0.18
789	0.17
790	0.15
791	0.14
792	0.13
793	0.11
794	0.09
795	0.07
796	0.07
797	0.07
798	0.08
799	0.09
800	0.1
801	0.12
802	0.14
803	0.14
804	0.15
805	0.15
806	0.17
807	0.17
808	0.18
809	0.19
810	0.21
811	0.21
812	0.21
813	0.2
814	0.18
815	0.16
816	0.15
817	0.16
818	0.15
819	0.17
820	0.21
821	0.21
822	0.22
823	0.27
824	0.33
825	0.33
826	0.31
827	0.31
828	0.28
829	0.29
830	0.33
831	0.29
832	0.24
833	0.22
834	0.22
835	0.21
836	0.23
837	0.23
838	0.18
839	0.19
840	0.18
841	0.18
842	0.19
843	0.17
844	0.15
845	0.15
846	0.16
847	0.14
848	0.16
849	0.14
850	0.14
851	0.18
852	0.18
853	0.19
854	0.2
855	0.22
856	0.21
857	0.22
858	0.22
859	0.18
860	0.18
861	0.17
862	0.15
863	0.15
864	0.14
865	0.13
866	0.13
867	0.17
868	0.16
869	0.16
870	0.15
871	0.13
872	0.2
873	0.21
874	0.21
875	0.16
876	0.16
877	0.17
878	0.19
879	0.21
880	0.17
881	0.2
882	0.19
883	0.2
884	0.21
885	0.18
886	0.2
887	0.2
888	0.18
889	0.13
890	0.14
891	0.12
892	0.12
893	0.14
894	0.11
895	0.1
896	0.1
897	0.11
898	0.14
899	0.2
900	0.2
901	0.18
902	0.18
903	0.2
904	0.22
905	0.25
906	0.23
907	0.19
908	0.18
909	0.17
910	0.17
911	0.15
912	0.13
913	0.09
914	0.07
915	0.06
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.08
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.07
927	0.07
928	0.06
929	0.04
930	0.05
931	0.04
932	0.04
933	0.04
934	0.04
935	0.04
936	0.04
937	0.05
938	0.04
939	0.06
940	0.06
941	0.06
942	0.06
943	0.07
944	0.07
945	0.06
946	0.08
947	0.09
948	0.11
949	0.11
950	0.12
951	0.12
952	0.14
953	0.15
954	0.15
955	0.14
956	0.16
957	0.17
958	0.17
959	0.18
960	0.19
961	0.19
962	0.17
963	0.17
964	0.14
965	0.16
966	0.16
967	0.15
968	0.12
969	0.12
970	0.11
971	0.13
972	0.16
973	0.13
974	0.16
975	0.18
976	0.21
977	0.22
978	0.25
979	0.24
980	0.2
981	0.24
982	0.21
983	0.21
984	0.23
985	0.23
986	0.22
987	0.26
988	0.27
989	0.25
990	0.3
991	0.29
992	0.26
993	0.29
994	0.29
995	0.25
996	0.25
997	0.25
998	0.2
999	0.19
1000	0.17
1001	0.12
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.12
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.14
1008	0.16
1009	0.2
1010	0.26
1011	0.29
1012	0.32
1013	0.35
1014	0.39
1015	0.39
1016	0.4
1017	0.37
1018	0.32
1019	0.27
1020	0.21
1021	0.17
1022	0.11
1023	0.1
1024	0.08
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.07
1030	0.09
1031	0.12
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.24
1038	0.28
1039	0.29
1040	0.29
1041	0.34
1042	0.4
1043	0.44
1044	0.44
1045	0.41
1046	0.4
1047	0.36
1048	0.33
1049	0.29
1050	0.22
1051	0.2
1052	0.24
1053	0.23
1054	0.19
1055	0.23
1056	0.27
1057	0.33
1058	0.35
1059	0.37
1060	0.33
1061	0.35
1062	0.36
1063	0.34
1064	0.31
1065	0.27
1066	0.26
1067	0.23
1068	0.24
1069	0.21
1070	0.19
1071	0.16
1072	0.13
1073	0.12
1074	0.1
1075	0.09
1076	0.1
1077	0.11
1078	0.1
1079	0.13
1080	0.14
1081	0.16
1082	0.2
1083	0.21
1084	0.2
1085	0.22
1086	0.21
1087	0.18
1088	0.17
1089	0.15
1090	0.11
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.08
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.07
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.08
1100	0.11
1101	0.11
1102	0.14
1103	0.16
1104	0.17
1105	0.17
1106	0.17
1107	0.15
1108	0.13
1109	0.12
1110	0.08
1111	0.06
1112	0.05
1113	0.06
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.05
1117	0.04
1118	0.05
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.07
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.08
1125	0.1
1126	0.1
1127	0.08
1128	0.09
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.12
1132	0.13
1133	0.12
1134	0.13
1135	0.15
1136	0.18
1137	0.17
1138	0.24
1139	0.29
1140	0.34
1141	0.36
1142	0.35
1143	0.33
1144	0.31
1145	0.29
1146	0.28
1147	0.25
1148	0.22
1149	0.24
1150	0.26
1151	0.26
1152	0.25
1153	0.25
1154	0.19
1155	0.17
1156	0.16
1157	0.12
1158	0.12
1159	0.14
1160	0.15
1161	0.17
1162	0.22
1163	0.24
1164	0.25
1165	0.28
1166	0.28
1167	0.3
1168	0.34
1169	0.34
1170	0.32
1171	0.34
1172	0.39
1173	0.34
1174	0.34
1175	0.35
1176	0.32
1177	0.28
1178	0.27
1179	0.26
1180	0.19
1181	0.2
1182	0.19
1183	0.15
1184	0.14
1185	0.15
1186	0.18
1187	0.17
1188	0.17
1189	0.18
1190	0.18
1191	0.2
1192	0.25
1193	0.24
1194	0.21
1195	0.2
1196	0.25
1197	0.26
1198	0.29
1199	0.32
1200	0.27
1201	0.27
1202	0.29
1203	0.31
1204	0.3
1205	0.31
1206	0.31
1207	0.35
1208	0.37
1209	0.38
1210	0.37
1211	0.34
1212	0.3
1213	0.31
1214	0.3
1215	0.26
1216	0.24
1217	0.23
1218	0.2
1219	0.21
1220	0.21
1221	0.21
1222	0.2
1223	0.21
1224	0.24
1225	0.25
1226	0.25
1227	0.26
1228	0.3
1229	0.31
1230	0.3
1231	0.3
1232	0.26
1233	0.26
1234	0.26
1235	0.26
1236	0.23
1237	0.22
1238	0.22

A0A1X2I5F3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer