Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IDA5

Protein Details
Accession A0A1X2IDA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
488-519PILIARSNRKSKKSHNKKKSFKKLCVCLRCLHHydrophilic
564-586FLLLKRCKLRSRLIGCEKKKNFPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-509SNRKSKKSHNKKKSFK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, cyto 4.5, mito 3, golg 2, plas 1, extr 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045124  Su(sable)-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd14279  CUE  
Amino Acid Sequences MTDSSRLHSNWKTPFLFSPHDGPSLEDLTLLASSKCNSTTTPLPRPLPSSSPYQTQVLRHTSFQPFDPFNADILENTSAKDADLDELSNFLSRQFLDDVDADTLPTTKNISSITTSVSIQSYSPTDTAWRLDGGEKIRKPWSPSFHATSHLTSSSTSSQTTLLSQQDDDTDNTNGGRNTNISNSRTNELLSTPSPPTATWWDRYGNDSEFDPTLPFYQGDQENSSTAVDLPGTINSATCDNNRRMELDGGDNGKQQQRQQQPQELDMTMVALKKLATLFPHLDEKELGQTLAALDYDIERTIETLLPAPPSPQCGTAGITSTSTTPPAIMSTVPATVTATATATGPKVHLIKSPIPSTSPPLRSPTQPAVPAAAATAISLPKKRQVCRHYLAGDCYRKDCWFAHDLDVKPCKFWLQGSCLKGDTCEFAHSLKEMEQVADYHQQQQQYQQISNSSGSGHHHSSQLDHRQQCHHQQQDQHYTPTTVVEFPILIARSNRKSKKSHNKKKSFKKLCVCLRCLHALMCIYTVCVCWFMPWICAYIDETMDFDRAIDAPRPSLEFGRIMFLLLKRCKLRSRLIGCEKKKNFPSIREDHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.53
3 0.53
4 0.48
5 0.47
6 0.42
7 0.43
8 0.4
9 0.37
10 0.35
11 0.31
12 0.28
13 0.21
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.13
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.2
26 0.29
27 0.36
28 0.45
29 0.5
30 0.53
31 0.54
32 0.58
33 0.57
34 0.52
35 0.46
36 0.45
37 0.41
38 0.43
39 0.43
40 0.43
41 0.42
42 0.41
43 0.46
44 0.46
45 0.45
46 0.41
47 0.45
48 0.47
49 0.45
50 0.44
51 0.43
52 0.37
53 0.36
54 0.38
55 0.33
56 0.27
57 0.27
58 0.24
59 0.18
60 0.19
61 0.21
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.14
98 0.16
99 0.17
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.16
106 0.14
107 0.15
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.19
120 0.23
121 0.3
122 0.3
123 0.33
124 0.37
125 0.39
126 0.43
127 0.46
128 0.48
129 0.47
130 0.51
131 0.53
132 0.49
133 0.51
134 0.47
135 0.42
136 0.38
137 0.31
138 0.26
139 0.21
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.18
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.16
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.19
167 0.24
168 0.24
169 0.29
170 0.31
171 0.32
172 0.31
173 0.3
174 0.24
175 0.2
176 0.2
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.18
184 0.22
185 0.25
186 0.23
187 0.25
188 0.28
189 0.28
190 0.31
191 0.31
192 0.24
193 0.23
194 0.21
195 0.2
196 0.17
197 0.16
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.14
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.18
211 0.17
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.16
227 0.17
228 0.2
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.22
234 0.19
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.21
242 0.21
243 0.26
244 0.33
245 0.4
246 0.45
247 0.5
248 0.48
249 0.49
250 0.49
251 0.4
252 0.32
253 0.23
254 0.19
255 0.13
256 0.11
257 0.09
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.13
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.13
337 0.17
338 0.22
339 0.25
340 0.27
341 0.25
342 0.26
343 0.26
344 0.29
345 0.32
346 0.31
347 0.29
348 0.32
349 0.34
350 0.34
351 0.39
352 0.38
353 0.35
354 0.33
355 0.31
356 0.28
357 0.26
358 0.24
359 0.18
360 0.13
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.1
367 0.11
368 0.17
369 0.24
370 0.27
371 0.35
372 0.4
373 0.47
374 0.5
375 0.57
376 0.55
377 0.51
378 0.53
379 0.53
380 0.52
381 0.45
382 0.42
383 0.37
384 0.33
385 0.33
386 0.29
387 0.24
388 0.23
389 0.24
390 0.28
391 0.33
392 0.34
393 0.39
394 0.45
395 0.4
396 0.36
397 0.35
398 0.3
399 0.24
400 0.26
401 0.23
402 0.24
403 0.31
404 0.32
405 0.34
406 0.34
407 0.32
408 0.3
409 0.25
410 0.2
411 0.15
412 0.15
413 0.14
414 0.13
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.13
419 0.15
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.16
425 0.21
426 0.21
427 0.23
428 0.24
429 0.26
430 0.26
431 0.31
432 0.34
433 0.31
434 0.32
435 0.28
436 0.29
437 0.29
438 0.3
439 0.25
440 0.19
441 0.17
442 0.18
443 0.21
444 0.22
445 0.21
446 0.23
447 0.23
448 0.26
449 0.33
450 0.39
451 0.43
452 0.44
453 0.46
454 0.49
455 0.55
456 0.61
457 0.63
458 0.61
459 0.57
460 0.61
461 0.67
462 0.71
463 0.69
464 0.62
465 0.54
466 0.48
467 0.43
468 0.38
469 0.3
470 0.2
471 0.16
472 0.14
473 0.12
474 0.11
475 0.16
476 0.14
477 0.13
478 0.16
479 0.23
480 0.3
481 0.4
482 0.47
483 0.49
484 0.56
485 0.66
486 0.74
487 0.79
488 0.82
489 0.84
490 0.88
491 0.92
492 0.96
493 0.96
494 0.95
495 0.93
496 0.92
497 0.91
498 0.91
499 0.89
500 0.82
501 0.75
502 0.7
503 0.65
504 0.56
505 0.47
506 0.4
507 0.33
508 0.3
509 0.26
510 0.21
511 0.17
512 0.16
513 0.16
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.1
518 0.15
519 0.15
520 0.17
521 0.17
522 0.18
523 0.17
524 0.18
525 0.19
526 0.16
527 0.17
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.14
537 0.17
538 0.17
539 0.19
540 0.21
541 0.23
542 0.24
543 0.26
544 0.26
545 0.24
546 0.23
547 0.26
548 0.24
549 0.22
550 0.24
551 0.25
552 0.31
553 0.33
554 0.39
555 0.39
556 0.45
557 0.51
558 0.53
559 0.6
560 0.61
561 0.65
562 0.69
563 0.75
564 0.8
565 0.8
566 0.85
567 0.8
568 0.8
569 0.78
570 0.78
571 0.74
572 0.72
573 0.74