Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HZU1

Protein Details
Accession A0A1X2HZU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-452DERQARERDQIRRDRQKQREREMRMSHBasic
605-626LDTFLNKAKKGKRTRNDSDSDGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATLSSLLPKPRQTTNKIETTNDSSKQQAFNQLVSKRSTQVIPPYGQRTTFRPRFPEDFGNGGAFPEITLVQYPLDMGRKKGAKTETSGGTLTLQVDSDGNVAYDDIARQGHAQNRIVHTSLKDLVPMKERKDVDVEKLVMDRPGEEEVMSVAEKTKAALERIVQGKIKAAQPKNVVSTNGGGGSGTNKDPTYIRYTPSQGQGNDALNSGAKQRIIRMVDAPVDPMAPPSFLHKKVPRGPPSPPAPVMHSPPRKLSAKEQAEWVIPPCISNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDNFAKFSEALYAADRHAREEVRQRNLMQQKLAQKEKDAEEEKLRDLAQKAREERSGFKPSAAGSSSTEPSSVPSNRPTAASLMPDYDSSDESSGSERSDDEDSDKGSRDKSSRDTGSRTRQELVEEDERQARERDQIRRDRQKQREREMRMSHMGTEAKAKHLAKEHGRDISEKIALGLAKPSASKDSMYDARLFNQSEGISSGFKNDDSYSLYDKPLFNQTSSSIYKFKGNQNDSDILGSTDTEELERSIHQDKFGVKRGFKGAEGATDGAAASGSSGPVEFEKEIMSSASSRSNKDADKDVFGLDTFLNKAKKGKRTRNDSDSDGDDDGRRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.68
4 0.66
5 0.65
6 0.61
7 0.62
8 0.63
9 0.56
10 0.51
11 0.46
12 0.47
13 0.47
14 0.45
15 0.45
16 0.4
17 0.42
18 0.47
19 0.47
20 0.47
21 0.46
22 0.46
23 0.39
24 0.4
25 0.37
26 0.34
27 0.4
28 0.42
29 0.42
30 0.46
31 0.49
32 0.49
33 0.5
34 0.47
35 0.44
36 0.49
37 0.52
38 0.52
39 0.52
40 0.56
41 0.58
42 0.61
43 0.63
44 0.56
45 0.52
46 0.48
47 0.44
48 0.37
49 0.32
50 0.26
51 0.17
52 0.13
53 0.11
54 0.09
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.11
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.28
66 0.32
67 0.33
68 0.4
69 0.43
70 0.39
71 0.44
72 0.49
73 0.44
74 0.43
75 0.42
76 0.36
77 0.31
78 0.28
79 0.23
80 0.17
81 0.13
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.15
98 0.2
99 0.25
100 0.3
101 0.34
102 0.38
103 0.4
104 0.4
105 0.38
106 0.33
107 0.32
108 0.31
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.27
113 0.33
114 0.37
115 0.35
116 0.4
117 0.4
118 0.39
119 0.44
120 0.43
121 0.4
122 0.43
123 0.4
124 0.34
125 0.35
126 0.33
127 0.27
128 0.25
129 0.19
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.23
149 0.26
150 0.3
151 0.27
152 0.25
153 0.27
154 0.29
155 0.32
156 0.35
157 0.34
158 0.37
159 0.4
160 0.44
161 0.44
162 0.43
163 0.39
164 0.32
165 0.31
166 0.25
167 0.21
168 0.17
169 0.13
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.22
180 0.21
181 0.23
182 0.25
183 0.3
184 0.32
185 0.38
186 0.4
187 0.32
188 0.33
189 0.36
190 0.33
191 0.3
192 0.26
193 0.21
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.16
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.13
217 0.19
218 0.2
219 0.28
220 0.32
221 0.4
222 0.48
223 0.57
224 0.59
225 0.57
226 0.58
227 0.59
228 0.6
229 0.56
230 0.5
231 0.42
232 0.39
233 0.38
234 0.4
235 0.42
236 0.42
237 0.39
238 0.39
239 0.43
240 0.41
241 0.4
242 0.42
243 0.43
244 0.43
245 0.42
246 0.42
247 0.38
248 0.36
249 0.34
250 0.29
251 0.2
252 0.15
253 0.14
254 0.12
255 0.18
256 0.18
257 0.23
258 0.27
259 0.31
260 0.35
261 0.36
262 0.39
263 0.32
264 0.34
265 0.34
266 0.37
267 0.33
268 0.34
269 0.35
270 0.32
271 0.31
272 0.31
273 0.26
274 0.18
275 0.18
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.12
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.22
306 0.28
307 0.3
308 0.33
309 0.33
310 0.39
311 0.44
312 0.44
313 0.36
314 0.34
315 0.36
316 0.4
317 0.43
318 0.35
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.36
323 0.31
324 0.27
325 0.27
326 0.29
327 0.28
328 0.26
329 0.24
330 0.2
331 0.19
332 0.23
333 0.24
334 0.28
335 0.3
336 0.31
337 0.35
338 0.34
339 0.37
340 0.39
341 0.39
342 0.33
343 0.31
344 0.29
345 0.26
346 0.27
347 0.24
348 0.18
349 0.14
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.13
355 0.13
356 0.17
357 0.17
358 0.16
359 0.18
360 0.2
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.19
365 0.18
366 0.18
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.19
394 0.19
395 0.22
396 0.25
397 0.31
398 0.35
399 0.37
400 0.42
401 0.46
402 0.54
403 0.57
404 0.54
405 0.48
406 0.44
407 0.42
408 0.38
409 0.36
410 0.33
411 0.28
412 0.27
413 0.3
414 0.29
415 0.29
416 0.29
417 0.23
418 0.24
419 0.3
420 0.36
421 0.41
422 0.51
423 0.59
424 0.69
425 0.78
426 0.81
427 0.84
428 0.86
429 0.87
430 0.87
431 0.87
432 0.83
433 0.83
434 0.78
435 0.74
436 0.7
437 0.61
438 0.52
439 0.46
440 0.39
441 0.3
442 0.32
443 0.26
444 0.23
445 0.28
446 0.27
447 0.27
448 0.32
449 0.39
450 0.39
451 0.45
452 0.47
453 0.46
454 0.46
455 0.45
456 0.4
457 0.38
458 0.31
459 0.24
460 0.21
461 0.17
462 0.16
463 0.15
464 0.15
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.2
474 0.23
475 0.25
476 0.27
477 0.25
478 0.27
479 0.31
480 0.3
481 0.24
482 0.23
483 0.21
484 0.18
485 0.19
486 0.17
487 0.15
488 0.14
489 0.16
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.14
495 0.16
496 0.2
497 0.22
498 0.24
499 0.25
500 0.27
501 0.27
502 0.28
503 0.33
504 0.32
505 0.27
506 0.27
507 0.27
508 0.3
509 0.33
510 0.34
511 0.28
512 0.27
513 0.33
514 0.36
515 0.42
516 0.46
517 0.46
518 0.47
519 0.5
520 0.52
521 0.46
522 0.42
523 0.35
524 0.26
525 0.22
526 0.18
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.12
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.23
540 0.28
541 0.34
542 0.43
543 0.47
544 0.42
545 0.46
546 0.52
547 0.51
548 0.46
549 0.44
550 0.35
551 0.31
552 0.34
553 0.29
554 0.22
555 0.19
556 0.18
557 0.13
558 0.12
559 0.08
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.11
568 0.1
569 0.11
570 0.12
571 0.12
572 0.13
573 0.12
574 0.13
575 0.11
576 0.13
577 0.22
578 0.24
579 0.26
580 0.29
581 0.35
582 0.36
583 0.39
584 0.46
585 0.41
586 0.43
587 0.42
588 0.39
589 0.34
590 0.31
591 0.29
592 0.2
593 0.19
594 0.16
595 0.21
596 0.22
597 0.23
598 0.31
599 0.37
600 0.47
601 0.56
602 0.64
603 0.68
604 0.76
605 0.84
606 0.86
607 0.84
608 0.79
609 0.73
610 0.66
611 0.6
612 0.52
613 0.44
614 0.38