Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IKR0

Protein Details
Accession A0A1X2IKR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-271KKSSSSSKKKSSSSKKKSKRPSTSSSKKEKRKKLQTNTSFTYYHydrophilic
406-428FYIYKQKNYKTLDKQHRTTKVDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-261KVNKSSSKKSSSSSKKKSSSSKKKSKRPSTSSSKKEKRKK
Subcellular Location(s) extr 12, nucl 6, mito 4.5, cyto_mito 4.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd22785  DPBB_MltA-like  
cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MHLPTLSTLGLFVLATAQFVSAQQVITDDVEAAAPQAYSDYYLSAFGDEDAPEADFELVERDDYASDADIPETTIELIKRAECTKHHTVHGNDNCINLSKKYGIKLDQFYSWNPQVNHKCTNLNDGKKYCVGTGSSSSSSSSDKSSSSSGCAKTHKVTSSDTCAKLAKSNGISLNTFYDLNPKVHRGSCDNLDNGKSYCVKAGSKSSDNKSVSDKVTKLGSKVNKSSSKKSSSSSKKKSSSSKKKSKRPSTSSSKKEKRKKLQTNTSFTYYWIATPDSYKTSGKKVTIKSCSGKSLGKVSEDYGDALVMEGSGVLGSKIVNLGGCSCSNYKCFEEVDKKDDPFGLTANGSPLRPYITIAANDLKMGTKVYIPQLVGWSLPGSKKKHNGCALVNDQSWSFGSHHIDFYIYKQKNYKTLDKQHRTTKVDIYEGGSCTIQNYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.08
6 0.09
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.09
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.09
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.19
68 0.22
69 0.22
70 0.31
71 0.38
72 0.41
73 0.44
74 0.49
75 0.49
76 0.56
77 0.59
78 0.58
79 0.51
80 0.47
81 0.44
82 0.39
83 0.38
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.24
88 0.27
89 0.3
90 0.33
91 0.37
92 0.41
93 0.4
94 0.41
95 0.4
96 0.38
97 0.41
98 0.39
99 0.38
100 0.34
101 0.41
102 0.45
103 0.48
104 0.51
105 0.46
106 0.47
107 0.43
108 0.52
109 0.51
110 0.49
111 0.51
112 0.48
113 0.49
114 0.46
115 0.46
116 0.37
117 0.31
118 0.25
119 0.2
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.21
127 0.19
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.15
134 0.18
135 0.23
136 0.24
137 0.26
138 0.29
139 0.3
140 0.31
141 0.35
142 0.35
143 0.31
144 0.32
145 0.32
146 0.37
147 0.41
148 0.38
149 0.35
150 0.33
151 0.32
152 0.31
153 0.3
154 0.26
155 0.2
156 0.23
157 0.24
158 0.25
159 0.25
160 0.22
161 0.22
162 0.18
163 0.18
164 0.14
165 0.17
166 0.17
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.23
172 0.26
173 0.23
174 0.24
175 0.27
176 0.29
177 0.28
178 0.27
179 0.26
180 0.26
181 0.23
182 0.22
183 0.19
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.21
190 0.23
191 0.27
192 0.32
193 0.34
194 0.4
195 0.4
196 0.39
197 0.38
198 0.37
199 0.34
200 0.33
201 0.3
202 0.23
203 0.27
204 0.26
205 0.23
206 0.25
207 0.28
208 0.28
209 0.31
210 0.37
211 0.42
212 0.45
213 0.51
214 0.51
215 0.53
216 0.5
217 0.49
218 0.52
219 0.54
220 0.61
221 0.63
222 0.66
223 0.65
224 0.69
225 0.76
226 0.77
227 0.78
228 0.78
229 0.8
230 0.81
231 0.85
232 0.9
233 0.91
234 0.9
235 0.86
236 0.84
237 0.84
238 0.84
239 0.84
240 0.84
241 0.83
242 0.82
243 0.84
244 0.86
245 0.86
246 0.87
247 0.89
248 0.88
249 0.9
250 0.89
251 0.87
252 0.81
253 0.74
254 0.63
255 0.53
256 0.45
257 0.34
258 0.25
259 0.19
260 0.15
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.23
269 0.27
270 0.3
271 0.36
272 0.4
273 0.46
274 0.5
275 0.54
276 0.53
277 0.52
278 0.51
279 0.47
280 0.42
281 0.36
282 0.37
283 0.33
284 0.3
285 0.28
286 0.25
287 0.25
288 0.23
289 0.21
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.02
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.07
310 0.09
311 0.1
312 0.12
313 0.14
314 0.16
315 0.17
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.27
321 0.35
322 0.37
323 0.41
324 0.43
325 0.41
326 0.41
327 0.41
328 0.34
329 0.25
330 0.23
331 0.19
332 0.15
333 0.15
334 0.18
335 0.18
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.17
342 0.16
343 0.18
344 0.19
345 0.22
346 0.25
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.18
351 0.15
352 0.15
353 0.12
354 0.1
355 0.14
356 0.17
357 0.21
358 0.21
359 0.22
360 0.23
361 0.23
362 0.21
363 0.19
364 0.17
365 0.16
366 0.2
367 0.26
368 0.29
369 0.36
370 0.45
371 0.51
372 0.59
373 0.64
374 0.65
375 0.63
376 0.67
377 0.65
378 0.63
379 0.57
380 0.48
381 0.41
382 0.36
383 0.32
384 0.25
385 0.2
386 0.18
387 0.23
388 0.23
389 0.25
390 0.23
391 0.25
392 0.23
393 0.27
394 0.33
395 0.3
396 0.32
397 0.38
398 0.42
399 0.48
400 0.55
401 0.6
402 0.6
403 0.69
404 0.76
405 0.78
406 0.82
407 0.83
408 0.86
409 0.81
410 0.76
411 0.73
412 0.67
413 0.62
414 0.56
415 0.5
416 0.45
417 0.41
418 0.38
419 0.3
420 0.24