FuNGI

A0A1X2IB80

Protein Details

Accession

A0A1X2IB80

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-101	VKLHRKDYYNRLQQQQHRFNM	Hydrophilic
251-270	VPLDRWYKFQRKRHIRTLNA	Hydrophilic
594-621	TMSTKDFLMRFRKRIKKNERNRDIITSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
464-498	KKKNVVTKPGLKKGPKKKESMSRPIGRPGSPSIRR
606-610	KRIKK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MGGIFNTGRPQSRGRGRGMPAQRPGMSHLQQQRQQQQPQPQAIPYNDFQLLSCARAGSKTNLIDFKDSHKNIDMAEFSRPVKLHRKDYYNRLQQQQHRFNMDNSNSNNLGGDITSDANATNSSTLSGETSSPSKTDTNGPNTPNNNTGGNQQQQYQQQRYDKYQQGPKTGADTSLIAPMGGATRNKQMLFKKRTKQIYLAKEDTRELKEQEHRPWILEDFNGTNSFTGTLEGGQRSDYVLFVLTENGFKVVPLDRWYKFQRKRHIRTLNADEVEEQLKKERKQAKHDSNRWMMLKRDEDSGEGSSSPKSRFKISDHSESRRGGSDTETGGKRHDSDIDDLDFDDVFQDDEEGGNDHEMEDEDIKDGKERIKKEHKGYAPNQEDEDMDDIDEAKLTSEGKQMRKLVRDLEKNRAYESDEDKDPYATSEEELETDSDNDEEGSDKETKDKEKQQQEVSSKSTPSLKKKNVVTKPGLKKGPKKKESMSRPIGRPGSPSIRREASPTRALSSSPIRSGSSSPPPSSPHSDHGGVVKKRKADDHEHRHGKQQRITSPRHTHTSPSSSAASPSSSGGGGSTDDSSLITEEEVVETLRGRTMSTKDFLMRFRKRIKKNERNRDIITSLLKRVARHNVTSDPSVKMLELKPELA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.57
3	0.58
4	0.64
5	0.69
6	0.68
7	0.65
8	0.66
9	0.62
10	0.55
11	0.56
12	0.55
13	0.49
14	0.49
15	0.52
16	0.53
17	0.57
18	0.65
19	0.69
20	0.69
21	0.74
22	0.73
23	0.74
24	0.74
25	0.76
26	0.7
27	0.65
28	0.62
29	0.57
30	0.55
31	0.46
32	0.42
33	0.36
34	0.32
35	0.29
36	0.28
37	0.26
38	0.22
39	0.22
40	0.17
41	0.16
42	0.19
43	0.22
44	0.21
45	0.27
46	0.29
47	0.33
48	0.38
49	0.39
50	0.4
51	0.38
52	0.4
53	0.44
54	0.41
55	0.4
56	0.39
57	0.38
58	0.34
59	0.38
60	0.34
61	0.25
62	0.29
63	0.29
64	0.26
65	0.29
66	0.29
67	0.29
68	0.37
69	0.42
70	0.47
71	0.52
72	0.61
73	0.63
74	0.73
75	0.78
76	0.78
77	0.78
78	0.76
79	0.77
80	0.77
81	0.81
82	0.8
83	0.76
84	0.72
85	0.67
86	0.63
87	0.64
88	0.59
89	0.55
90	0.48
91	0.48
92	0.41
93	0.39
94	0.36
95	0.26
96	0.23
97	0.15
98	0.13
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.08
104	0.08
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.07
109	0.08
110	0.08
111	0.08
112	0.09
113	0.1
114	0.1
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.15
120	0.15
121	0.16
122	0.23
123	0.29
124	0.34
125	0.4
126	0.43
127	0.48
128	0.5
129	0.51
130	0.45
131	0.4
132	0.35
133	0.3
134	0.3
135	0.3
136	0.32
137	0.3
138	0.3
139	0.33
140	0.39
141	0.46
142	0.47
143	0.46
144	0.48
145	0.51
146	0.55
147	0.59
148	0.58
149	0.58
150	0.62
151	0.6
152	0.59
153	0.57
154	0.51
155	0.46
156	0.4
157	0.33
158	0.26
159	0.22
160	0.18
161	0.18
162	0.17
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.15
171	0.19
172	0.2
173	0.25
174	0.31
175	0.39
176	0.48
177	0.55
178	0.59
179	0.64
180	0.71
181	0.69
182	0.71
183	0.69
184	0.7
185	0.69
186	0.66
187	0.6
188	0.55
189	0.53
190	0.49
191	0.43
192	0.37
193	0.3
194	0.31
195	0.36
196	0.4
197	0.45
198	0.47
199	0.44
200	0.43
201	0.43
202	0.38
203	0.31
204	0.25
205	0.21
206	0.15
207	0.16
208	0.16
209	0.14
210	0.13
211	0.11
212	0.12
213	0.1
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.08
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.14
240	0.19
241	0.19
242	0.25
243	0.31
244	0.4
245	0.47
246	0.53
247	0.6
248	0.66
249	0.72
250	0.77
251	0.81
252	0.77
253	0.76
254	0.76
255	0.72
256	0.62
257	0.55
258	0.44
259	0.36
260	0.32
261	0.25
262	0.17
263	0.16
264	0.21
265	0.21
266	0.29
267	0.36
268	0.4
269	0.49
270	0.6
271	0.65
272	0.7
273	0.77
274	0.76
275	0.73
276	0.72
277	0.64
278	0.56
279	0.48
280	0.42
281	0.38
282	0.31
283	0.29
284	0.25
285	0.23
286	0.23
287	0.21
288	0.17
289	0.13
290	0.13
291	0.11
292	0.13
293	0.15
294	0.17
295	0.17
296	0.19
297	0.22
298	0.25
299	0.34
300	0.36
301	0.44
302	0.46
303	0.49
304	0.51
305	0.49
306	0.46
307	0.39
308	0.34
309	0.24
310	0.21
311	0.19
312	0.15
313	0.19
314	0.19
315	0.17
316	0.17
317	0.17
318	0.16
319	0.15
320	0.17
321	0.14
322	0.15
323	0.17
324	0.17
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.11
329	0.09
330	0.07
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.09
352	0.1
353	0.14
354	0.19
355	0.2
356	0.29
357	0.38
358	0.45
359	0.49
360	0.57
361	0.57
362	0.6
363	0.63
364	0.64
365	0.59
366	0.53
367	0.48
368	0.41
369	0.35
370	0.28
371	0.26
372	0.15
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.07
383	0.12
384	0.18
385	0.2
386	0.26
387	0.31
388	0.35
389	0.38
390	0.39
391	0.41
392	0.44
393	0.51
394	0.49
395	0.54
396	0.56
397	0.53
398	0.52
399	0.45
400	0.39
401	0.35
402	0.36
403	0.3
404	0.27
405	0.27
406	0.27
407	0.26
408	0.23
409	0.19
410	0.16
411	0.12
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.15
431	0.18
432	0.23
433	0.29
434	0.38
435	0.44
436	0.51
437	0.57
438	0.6
439	0.65
440	0.65
441	0.63
442	0.59
443	0.53
444	0.45
445	0.41
446	0.42
447	0.4
448	0.44
449	0.5
450	0.5
451	0.55
452	0.62
453	0.7
454	0.7
455	0.72
456	0.7
457	0.7
458	0.73
459	0.75
460	0.75
461	0.71
462	0.73
463	0.76
464	0.8
465	0.76
466	0.73
467	0.73
468	0.75
469	0.78
470	0.79
471	0.78
472	0.75
473	0.72
474	0.74
475	0.7
476	0.6
477	0.53
478	0.5
479	0.5
480	0.48
481	0.46
482	0.44
483	0.43
484	0.43
485	0.46
486	0.46
487	0.42
488	0.43
489	0.42
490	0.4
491	0.37
492	0.37
493	0.35
494	0.36
495	0.34
496	0.29
497	0.3
498	0.28
499	0.29
500	0.32
501	0.33
502	0.36
503	0.37
504	0.36
505	0.37
506	0.4
507	0.43
508	0.48
509	0.45
510	0.4
511	0.4
512	0.4
513	0.38
514	0.41
515	0.46
516	0.43
517	0.47
518	0.46
519	0.45
520	0.46
521	0.5
522	0.5
523	0.51
524	0.57
525	0.6
526	0.67
527	0.72
528	0.71
529	0.75
530	0.77
531	0.75
532	0.69
533	0.67
534	0.65
535	0.64
536	0.69
537	0.69
538	0.71
539	0.68
540	0.69
541	0.62
542	0.59
543	0.58
544	0.59
545	0.51
546	0.45
547	0.43
548	0.37
549	0.37
550	0.33
551	0.27
552	0.21
553	0.2
554	0.17
555	0.14
556	0.13
557	0.11
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.09
576	0.09
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.16
581	0.2
582	0.25
583	0.26
584	0.3
585	0.32
586	0.36
587	0.42
588	0.48
589	0.52
590	0.55
591	0.63
592	0.7
593	0.74
594	0.81
595	0.86
596	0.86
597	0.89
598	0.92
599	0.91
600	0.89
601	0.85
602	0.81
603	0.71
604	0.66
605	0.63
606	0.57
607	0.51
608	0.49
609	0.46
610	0.41
611	0.46
612	0.51
613	0.48
614	0.48
615	0.5
616	0.5
617	0.53
618	0.56
619	0.53
620	0.45
621	0.41
622	0.37
623	0.32
624	0.31
625	0.28
626	0.31

A0A1X2IB80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer