Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IFD4

Protein Details
Accession A0A1X2IFD4    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163QARWQQQQQQRQQQHHHHPTPHydrophilic
289-308IIYPRDKKRLRRTPLLKFSLHydrophilic
565-593ELQKNEKDRLREARRKRRQTRGRRGIILPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
571-589KDRLREARRKRRQTRGRRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MMQKDLTSLQQQQQIAAPYSMPQQQQQGHVSPQSFGPSPGNIYSSPITTSLNDPSRLSQTLRPQQQQQQPGMFMHPPGLTQGTGVVSLGELAPKFSSPLQRHQMNFQSQFQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQIQLQQHQARWQQQQQQRQQQHHHHPTPPPQFPDRSAMVPAVAARPPVMMGVSGSIPRPPPSKPSSISIEAIVVETHVQKENIAQYQQRDRAYQDVLNEQHKRHLLLAQEKKRDIEASQYERKARHQGPKGIMATFGPGYRGLGNGNTGLQSNIIYPRDKKRLRRTPLLKFSLDDMKEQSTKEDDLVPIRLEFEADGYKLRDTFTWNLNEQLVTPEQFAEQLCEDLRLPPASFIPHIARSMKDQVQVYYLHASSMVTKEAPDTEENLTSPTAPSSYHHNTTPPDITLVKREHSPSLPTLDDTNHDVKKTANRNVELRMLIKLDITVDHKALIDQFEWDISCPENSPEQFAEVLTNDLGLGGEFRTAIAHSIREQIHVYIKSLLLVGHEFDGPVVDDDLKHSFLPYLKGVIRDTDAVNLFTPAILELSEAELQKNEKDRLREARRKRRQTRGRRGIILPDREPLKTNRTSHDTQPEQEITDEQFFASVNGGGGAAIGKRGNTPIQEAMHSQRRSALRARANIAAEAAGPGFMHTSFRLYIYIYCVHFYRFVLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.32
4 0.26
5 0.22
6 0.26
7 0.3
8 0.28
9 0.26
10 0.31
11 0.34
12 0.4
13 0.44
14 0.44
15 0.43
16 0.46
17 0.44
18 0.37
19 0.35
20 0.34
21 0.29
22 0.27
23 0.26
24 0.23
25 0.25
26 0.26
27 0.27
28 0.22
29 0.26
30 0.25
31 0.23
32 0.23
33 0.2
34 0.2
35 0.19
36 0.22
37 0.27
38 0.3
39 0.31
40 0.31
41 0.33
42 0.36
43 0.38
44 0.38
45 0.36
46 0.41
47 0.49
48 0.56
49 0.58
50 0.61
51 0.67
52 0.72
53 0.73
54 0.69
55 0.64
56 0.58
57 0.54
58 0.51
59 0.43
60 0.35
61 0.31
62 0.25
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.14
68 0.16
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.14
83 0.24
84 0.25
85 0.35
86 0.42
87 0.48
88 0.5
89 0.56
90 0.61
91 0.6
92 0.61
93 0.56
94 0.54
95 0.49
96 0.54
97 0.51
98 0.51
99 0.45
100 0.51
101 0.55
102 0.58
103 0.63
104 0.64
105 0.69
106 0.69
107 0.73
108 0.72
109 0.71
110 0.7
111 0.72
112 0.72
113 0.72
114 0.72
115 0.72
116 0.72
117 0.72
118 0.71
119 0.7
120 0.66
121 0.63
122 0.59
123 0.57
124 0.53
125 0.5
126 0.52
127 0.48
128 0.47
129 0.48
130 0.5
131 0.51
132 0.54
133 0.56
134 0.57
135 0.59
136 0.67
137 0.7
138 0.74
139 0.75
140 0.75
141 0.77
142 0.77
143 0.82
144 0.83
145 0.79
146 0.74
147 0.73
148 0.76
149 0.76
150 0.72
151 0.66
152 0.6
153 0.57
154 0.53
155 0.52
156 0.44
157 0.37
158 0.32
159 0.28
160 0.23
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.06
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.22
183 0.26
184 0.32
185 0.33
186 0.36
187 0.4
188 0.42
189 0.41
190 0.35
191 0.3
192 0.24
193 0.22
194 0.17
195 0.11
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.12
203 0.17
204 0.19
205 0.21
206 0.21
207 0.24
208 0.33
209 0.38
210 0.37
211 0.34
212 0.32
213 0.34
214 0.34
215 0.32
216 0.26
217 0.27
218 0.28
219 0.34
220 0.36
221 0.32
222 0.34
223 0.34
224 0.33
225 0.28
226 0.28
227 0.26
228 0.33
229 0.43
230 0.45
231 0.5
232 0.49
233 0.49
234 0.47
235 0.42
236 0.33
237 0.31
238 0.31
239 0.32
240 0.39
241 0.41
242 0.43
243 0.43
244 0.46
245 0.47
246 0.45
247 0.47
248 0.48
249 0.53
250 0.53
251 0.59
252 0.57
253 0.48
254 0.43
255 0.33
256 0.27
257 0.2
258 0.17
259 0.1
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.16
279 0.24
280 0.34
281 0.39
282 0.47
283 0.54
284 0.63
285 0.68
286 0.75
287 0.76
288 0.76
289 0.81
290 0.77
291 0.66
292 0.57
293 0.52
294 0.49
295 0.42
296 0.32
297 0.24
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.21
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.12
325 0.14
326 0.17
327 0.2
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.2
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.1
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.16
361 0.18
362 0.24
363 0.23
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.23
368 0.23
369 0.21
370 0.18
371 0.16
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.09
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.13
390 0.11
391 0.11
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.15
397 0.19
398 0.21
399 0.22
400 0.25
401 0.25
402 0.29
403 0.3
404 0.22
405 0.2
406 0.19
407 0.19
408 0.22
409 0.23
410 0.21
411 0.22
412 0.24
413 0.24
414 0.25
415 0.27
416 0.22
417 0.24
418 0.23
419 0.21
420 0.2
421 0.18
422 0.18
423 0.19
424 0.23
425 0.2
426 0.2
427 0.2
428 0.21
429 0.28
430 0.34
431 0.37
432 0.38
433 0.4
434 0.42
435 0.45
436 0.47
437 0.4
438 0.34
439 0.28
440 0.22
441 0.19
442 0.17
443 0.14
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.12
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.14
466 0.14
467 0.18
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.12
474 0.13
475 0.09
476 0.09
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.07
489 0.08
490 0.09
491 0.1
492 0.17
493 0.17
494 0.19
495 0.2
496 0.2
497 0.26
498 0.25
499 0.26
500 0.21
501 0.21
502 0.19
503 0.19
504 0.17
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.1
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.14
524 0.15
525 0.19
526 0.18
527 0.21
528 0.21
529 0.24
530 0.24
531 0.24
532 0.24
533 0.23
534 0.22
535 0.22
536 0.22
537 0.2
538 0.19
539 0.18
540 0.16
541 0.13
542 0.13
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.08
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.13
553 0.15
554 0.19
555 0.25
556 0.27
557 0.29
558 0.33
559 0.4
560 0.49
561 0.58
562 0.65
563 0.69
564 0.75
565 0.82
566 0.89
567 0.91
568 0.92
569 0.92
570 0.93
571 0.94
572 0.93
573 0.91
574 0.87
575 0.8
576 0.79
577 0.77
578 0.73
579 0.63
580 0.58
581 0.52
582 0.46
583 0.46
584 0.4
585 0.39
586 0.4
587 0.42
588 0.43
589 0.48
590 0.51
591 0.55
592 0.62
593 0.58
594 0.52
595 0.56
596 0.5
597 0.44
598 0.41
599 0.36
600 0.29
601 0.27
602 0.26
603 0.18
604 0.16
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.1
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.1
620 0.13
621 0.16
622 0.17
623 0.22
624 0.26
625 0.28
626 0.3
627 0.32
628 0.37
629 0.43
630 0.42
631 0.38
632 0.39
633 0.4
634 0.43
635 0.46
636 0.48
637 0.46
638 0.53
639 0.56
640 0.55
641 0.54
642 0.49
643 0.43
644 0.34
645 0.26
646 0.2
647 0.16
648 0.1
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.1
654 0.1
655 0.13
656 0.14
657 0.15
658 0.16
659 0.17
660 0.18
661 0.21
662 0.26
663 0.24
664 0.25
665 0.25
666 0.26
667 0.27