Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2IR84

Protein Details
Accession A0A1X2IR84    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-222SSDDDSKKQKQRQRHRSPSSSPSPHydrophilic
275-295RDDDRHRRRHDDDRERSSRRHBasic
299-329ESSSSSRHRSRYRSPSRSRSRSSEDRHRHRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-329RHGSSRHHHRDDDRHRRRHDDDRERSSRRHLHGESSSSSRHRSRYRSPSRSRSRSSEDRHRHRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTISGANWIHGRDPQHLIEKIIRERVYDSMYWKEECFGLTAVTLMDKAVELNSIGGEYGSQVPTHFLCLTLKMLQLQPEREILTDLIKQEEFKYLRALAAFYLRIVGQSKEIYQYLEPLLNDYRKLRIRVGSGYTLSHMDEFIDQLLRQDRVCDVILPRLVQRHVLEDNDELEPRVSALEDDLESEQEEQQEQHHSSDDDSKKQKQRQRHRSPSSSPSPERRSSSSRRYHSDSDDSESDHDRRTSHRDSSRRRHDDRDARDDRHGSSRHHHRDDDRHRRRHDDDRERSSRRHLHGESSSSSRHRSRYRSPSRSRSRSSEDRHRHRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.31
4 0.34
5 0.38
6 0.38
7 0.4
8 0.42
9 0.46
10 0.46
11 0.49
12 0.45
13 0.39
14 0.4
15 0.4
16 0.38
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.34
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.26
25 0.25
26 0.23
27 0.16
28 0.13
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.06
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.12
53 0.12
54 0.16
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.19
64 0.25
65 0.28
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.27
70 0.25
71 0.25
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.24
81 0.21
82 0.2
83 0.23
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.2
88 0.13
89 0.15
90 0.15
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.17
113 0.23
114 0.24
115 0.27
116 0.27
117 0.27
118 0.29
119 0.31
120 0.34
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.23
125 0.21
126 0.18
127 0.14
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.24
188 0.25
189 0.28
190 0.32
191 0.4
192 0.47
193 0.54
194 0.58
195 0.59
196 0.68
197 0.72
198 0.79
199 0.82
200 0.83
201 0.83
202 0.84
203 0.82
204 0.8
205 0.77
206 0.7
207 0.68
208 0.66
209 0.63
210 0.6
211 0.57
212 0.55
213 0.54
214 0.6
215 0.6
216 0.6
217 0.6
218 0.63
219 0.62
220 0.6
221 0.6
222 0.52
223 0.48
224 0.43
225 0.39
226 0.35
227 0.34
228 0.3
229 0.26
230 0.25
231 0.2
232 0.23
233 0.29
234 0.32
235 0.37
236 0.44
237 0.51
238 0.6
239 0.7
240 0.78
241 0.79
242 0.78
243 0.77
244 0.79
245 0.79
246 0.78
247 0.77
248 0.73
249 0.67
250 0.69
251 0.64
252 0.56
253 0.55
254 0.51
255 0.44
256 0.46
257 0.54
258 0.58
259 0.61
260 0.63
261 0.61
262 0.68
263 0.76
264 0.78
265 0.77
266 0.77
267 0.77
268 0.8
269 0.79
270 0.78
271 0.78
272 0.78
273 0.78
274 0.78
275 0.83
276 0.8
277 0.77
278 0.76
279 0.73
280 0.68
281 0.67
282 0.59
283 0.58
284 0.59
285 0.61
286 0.55
287 0.51
288 0.51
289 0.45
290 0.49
291 0.45
292 0.47
293 0.5
294 0.55
295 0.6
296 0.66
297 0.74
298 0.79
299 0.84
300 0.87
301 0.9
302 0.91
303 0.88
304 0.85
305 0.83
306 0.83
307 0.82
308 0.82
309 0.82