Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2I3Z4

Protein Details
Accession A0A1X2I3Z4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-60VEDTSKETNTKKRKLDKVKANNNDTIIYPPKNRKQQKKTDFRDVDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MPDTDTKVTAKSVDVEDTSKETNTKKRKLDKVKANNNDTIIYPPKNRKQQKKTDFRDVDDLPEAEYFFEHGLRKVKPYYFVYQAYAKGRWLERTILDVFVEEFRDRNEQYYRYAIEKGLITLNGKQVQTDTLIQNSDIVGHKIHRHEPPVTDSPIKIVFESDDLLVVDKPGGIPVHPAGRYRHNSVVHVLRKERNIPRLFPSNRLDRLTSGLMLISKTSLKASHMEHDMTSGLIRKEYICRVDGEFPTEEIVCDAPIRTISHKMSVNYVHPDGKPCKTIFNRISFDGKTSVVRCKPVTGRTHQIRVHLKYLGYPIGNDPLYGNTTSWASNLHLGESMSEEDAKQLVDKLMEASPFQSGEWDSKTTTSSSTTVTVSSTSASTSITESTTATSETTASSTIAPEVEFTDKTKLLEVESGERCSDCSVALFVDPPRDSLFIWLHAWKYQGNGWEYETELPDWANIDTSSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.26
4 0.28
5 0.28
6 0.26
7 0.27
8 0.29
9 0.37
10 0.45
11 0.52
12 0.58
13 0.66
14 0.75
15 0.82
16 0.87
17 0.89
18 0.89
19 0.91
20 0.92
21 0.88
22 0.82
23 0.73
24 0.64
25 0.54
26 0.49
27 0.44
28 0.39
29 0.4
30 0.45
31 0.52
32 0.62
33 0.71
34 0.75
35 0.79
36 0.86
37 0.89
38 0.9
39 0.89
40 0.9
41 0.86
42 0.79
43 0.77
44 0.66
45 0.61
46 0.54
47 0.46
48 0.36
49 0.31
50 0.27
51 0.19
52 0.17
53 0.13
54 0.1
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.22
59 0.23
60 0.28
61 0.33
62 0.35
63 0.38
64 0.42
65 0.44
66 0.44
67 0.45
68 0.44
69 0.42
70 0.44
71 0.42
72 0.38
73 0.34
74 0.33
75 0.33
76 0.34
77 0.32
78 0.31
79 0.27
80 0.3
81 0.3
82 0.26
83 0.24
84 0.2
85 0.18
86 0.16
87 0.18
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.18
92 0.18
93 0.21
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.32
98 0.32
99 0.29
100 0.31
101 0.27
102 0.24
103 0.23
104 0.21
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.23
110 0.25
111 0.24
112 0.23
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.19
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.18
129 0.21
130 0.26
131 0.27
132 0.3
133 0.32
134 0.34
135 0.39
136 0.4
137 0.4
138 0.36
139 0.32
140 0.31
141 0.31
142 0.29
143 0.22
144 0.17
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.11
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.14
163 0.15
164 0.18
165 0.19
166 0.28
167 0.32
168 0.35
169 0.4
170 0.36
171 0.36
172 0.38
173 0.44
174 0.4
175 0.41
176 0.4
177 0.37
178 0.38
179 0.45
180 0.46
181 0.46
182 0.44
183 0.43
184 0.44
185 0.5
186 0.49
187 0.47
188 0.46
189 0.45
190 0.45
191 0.45
192 0.41
193 0.32
194 0.34
195 0.28
196 0.24
197 0.17
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.11
209 0.12
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.19
233 0.18
234 0.18
235 0.16
236 0.14
237 0.09
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.14
247 0.15
248 0.19
249 0.22
250 0.22
251 0.24
252 0.25
253 0.26
254 0.25
255 0.26
256 0.25
257 0.22
258 0.27
259 0.28
260 0.28
261 0.29
262 0.26
263 0.32
264 0.31
265 0.4
266 0.4
267 0.44
268 0.45
269 0.43
270 0.47
271 0.39
272 0.39
273 0.31
274 0.27
275 0.22
276 0.21
277 0.26
278 0.24
279 0.27
280 0.26
281 0.29
282 0.32
283 0.37
284 0.4
285 0.39
286 0.46
287 0.48
288 0.55
289 0.52
290 0.56
291 0.56
292 0.54
293 0.52
294 0.45
295 0.4
296 0.34
297 0.35
298 0.31
299 0.23
300 0.19
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.13
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.13
362 0.13
363 0.11
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.11
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.2
394 0.21
395 0.22
396 0.24
397 0.23
398 0.21
399 0.24
400 0.25
401 0.28
402 0.3
403 0.31
404 0.28
405 0.28
406 0.27
407 0.24
408 0.22
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.14
416 0.21
417 0.21
418 0.22
419 0.23
420 0.24
421 0.23
422 0.26
423 0.27
424 0.23
425 0.27
426 0.28
427 0.27
428 0.28
429 0.3
430 0.25
431 0.25
432 0.25
433 0.28
434 0.28
435 0.28
436 0.29
437 0.29
438 0.3
439 0.3
440 0.29
441 0.23
442 0.21
443 0.19
444 0.17
445 0.17
446 0.15
447 0.14
448 0.11