Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HY15

Protein Details
Accession A0A1X2HY15    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-40LSQAHKPATPYKKQNQHKKWKRGMDNRKNGRGAQHydrophilic
283-313GNTSHRPYKSSMKTHNPRKLQHNYKYQSHQHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-33QHKKWKRGMDNR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5, mito 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MINNEPLSQAHKPATPYKKQNQHKKWKRGMDNRKNGRGAQAICRNNTNHDGVSDISKSPDSNVVEVASNLVGNYVQATVKNGAQFQGKLSETSTITYDHLELILKDACKIRHGHKKNDLAFSARTETLTINHGDLKDIVLVKPMKWKNVFKVNQEIGDNGARQERHLQQWQPTTELLEETSLVDSELNHSDSSNSTSTDIASWTQFTSNDFKEGLNTAKLDQSTPDFKDCEQKAIVHGNEIQQSSSSNAHVLEERSCIITNKTWDEDDHYVAANKNSTNDINGNTSHRPYKSSMKTHNPRKLQHNYKYQSHQHWQSNVLDQKECEQRQIQHYSTQQQLLKYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.52
3 0.6
4 0.65
5 0.73
6 0.79
7 0.86
8 0.88
9 0.9
10 0.91
11 0.92
12 0.92
13 0.92
14 0.93
15 0.93
16 0.93
17 0.93
18 0.93
19 0.92
20 0.91
21 0.84
22 0.75
23 0.7
24 0.66
25 0.58
26 0.57
27 0.56
28 0.53
29 0.51
30 0.55
31 0.5
32 0.48
33 0.49
34 0.42
35 0.33
36 0.28
37 0.28
38 0.24
39 0.26
40 0.23
41 0.19
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.18
54 0.12
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.1
65 0.12
66 0.14
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.17
94 0.17
95 0.19
96 0.23
97 0.28
98 0.36
99 0.42
100 0.49
101 0.55
102 0.64
103 0.66
104 0.68
105 0.62
106 0.54
107 0.5
108 0.43
109 0.38
110 0.28
111 0.23
112 0.19
113 0.18
114 0.15
115 0.16
116 0.14
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.23
130 0.24
131 0.28
132 0.32
133 0.35
134 0.36
135 0.46
136 0.49
137 0.43
138 0.51
139 0.47
140 0.44
141 0.42
142 0.36
143 0.28
144 0.26
145 0.22
146 0.14
147 0.15
148 0.12
149 0.12
150 0.18
151 0.18
152 0.21
153 0.26
154 0.28
155 0.3
156 0.36
157 0.36
158 0.33
159 0.3
160 0.26
161 0.21
162 0.19
163 0.14
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.14
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.15
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.17
201 0.17
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.16
210 0.19
211 0.2
212 0.22
213 0.2
214 0.2
215 0.29
216 0.29
217 0.29
218 0.26
219 0.25
220 0.25
221 0.32
222 0.31
223 0.24
224 0.26
225 0.25
226 0.27
227 0.27
228 0.24
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.14
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.19
247 0.21
248 0.24
249 0.26
250 0.25
251 0.25
252 0.3
253 0.31
254 0.29
255 0.26
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.24
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.19
264 0.19
265 0.2
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.26
271 0.26
272 0.3
273 0.32
274 0.31
275 0.32
276 0.33
277 0.42
278 0.46
279 0.53
280 0.58
281 0.64
282 0.73
283 0.81
284 0.86
285 0.83
286 0.81
287 0.81
288 0.83
289 0.82
290 0.81
291 0.81
292 0.79
293 0.79
294 0.81
295 0.79
296 0.77
297 0.76
298 0.76
299 0.73
300 0.7
301 0.66
302 0.62
303 0.63
304 0.6
305 0.54
306 0.48
307 0.41
308 0.44
309 0.5
310 0.46
311 0.42
312 0.43
313 0.45
314 0.5
315 0.58
316 0.53
317 0.51
318 0.56
319 0.57
320 0.56
321 0.57
322 0.52