Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XTL9

Protein Details
Accession A0A1Y1XTL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38SSPAVATPSKKQKKAKKSKELSEEIVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-30KKQKKAKKSK
274-276KRH
280-294DGDKSTKKKKKAKKI
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 11.166, cyto_nucl 10.166, mito 8, cyto_mito 7.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAKRKESVTLESSPAVATPSKKQKKAKKSKELSEEIVSLETENVDQPEAPATPTKKRTFFKSPIPITKPYPDLERNNASASPFAETCIKMYITLPPCFCNNPLQGINEQLNSFLMRYVPQVDGIVLAHSDLQILEKTGRIMYDSPYSHFWITVNLLIWKPKKGIKLVGIINLQSQDHIGLLLYNTFNASIPAECIPKTKYEWRQETTEASESEEAPVTGEWVFKHNGTPIGTDGWLEFTVEDLVKANDMITVSGSLIPTEEAPQDVGETPANKKRHAEQDGDKSTKKKKKAKKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.24
6 0.35
7 0.44
8 0.52
9 0.61
10 0.7
11 0.78
12 0.86
13 0.88
14 0.88
15 0.89
16 0.9
17 0.91
18 0.87
19 0.81
20 0.74
21 0.63
22 0.53
23 0.44
24 0.35
25 0.25
26 0.19
27 0.13
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.17
38 0.2
39 0.27
40 0.36
41 0.42
42 0.47
43 0.5
44 0.57
45 0.6
46 0.63
47 0.65
48 0.67
49 0.69
50 0.71
51 0.73
52 0.69
53 0.64
54 0.63
55 0.56
56 0.47
57 0.46
58 0.43
59 0.43
60 0.45
61 0.45
62 0.42
63 0.41
64 0.4
65 0.34
66 0.28
67 0.24
68 0.2
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.14
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.25
82 0.24
83 0.26
84 0.27
85 0.28
86 0.26
87 0.23
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.25
92 0.27
93 0.27
94 0.22
95 0.21
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.18
133 0.2
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.15
144 0.17
145 0.16
146 0.17
147 0.19
148 0.22
149 0.23
150 0.27
151 0.26
152 0.32
153 0.32
154 0.35
155 0.32
156 0.29
157 0.28
158 0.24
159 0.2
160 0.13
161 0.12
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.19
185 0.27
186 0.34
187 0.42
188 0.49
189 0.51
190 0.54
191 0.53
192 0.52
193 0.48
194 0.43
195 0.34
196 0.29
197 0.27
198 0.23
199 0.22
200 0.19
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.15
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.21
257 0.28
258 0.31
259 0.32
260 0.35
261 0.41
262 0.48
263 0.51
264 0.54
265 0.55
266 0.63
267 0.71
268 0.73
269 0.69
270 0.65
271 0.7
272 0.71
273 0.72
274 0.71