Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XZN4

Protein Details
Accession A0A1Y1XZN4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-43AEAARLAKKNKYRRDKPWDTDDIDHydrophilic
243-277SWDRFLPKFKKRNIQPKKKVSKKKGDKKDYTPFPPBasic
328-353IAPKEEIPEKKKRKHKETLEEEKKSIBasic
378-397VDDYLVKKEKKSKKAKKEKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-270LPKFKKRNIQPKKKVSKKKGDKK
331-344KEEIPEKKKRKHKE
384-397KKEKKSKKAKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MSSEPQEPTLTQEEQAKAEAEAARLAKKNKYRRDKPWDTDDIDKWKIEPWKDEDNTLPFTEESSFATLFPKYRENYLREIWPHLTTALKKYGINCVLDLVEGSMTVKTTRKTFDPYSIINARDLIKLLARSVPFPQAIKIMEDTMACDIVKIGNIIHNKERFVKRRQRLIGPNGNTLKAIELLTKCYIMVQGNTVAVMGTHKGLKECRRIILDCMNNIHPIYHIKELMIKRELAKDEKLKNESWDRFLPKFKKRNIQPKKKVSKKKGDKKDYTPFPPAQTPSKIDLQLESGEYFLKPAEKAMREMEKKKEAQAATSASNQAEREKAFIAPKEEIPEKKKRKHKETLEEEKKSIDELRNKIKDQAAKRNATSGAPQDSVDDYLVKKEKKSKKAKKEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.28
4 0.23
5 0.26
6 0.26
7 0.19
8 0.22
9 0.22
10 0.26
11 0.3
12 0.34
13 0.37
14 0.44
15 0.54
16 0.6
17 0.69
18 0.73
19 0.79
20 0.86
21 0.89
22 0.87
23 0.87
24 0.84
25 0.77
26 0.75
27 0.71
28 0.68
29 0.6
30 0.53
31 0.44
32 0.42
33 0.44
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.45
38 0.46
39 0.48
40 0.48
41 0.46
42 0.47
43 0.4
44 0.36
45 0.25
46 0.25
47 0.24
48 0.2
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.18
56 0.2
57 0.24
58 0.22
59 0.29
60 0.36
61 0.38
62 0.42
63 0.44
64 0.48
65 0.44
66 0.48
67 0.43
68 0.37
69 0.34
70 0.29
71 0.3
72 0.26
73 0.28
74 0.29
75 0.28
76 0.29
77 0.29
78 0.37
79 0.36
80 0.35
81 0.3
82 0.25
83 0.23
84 0.22
85 0.2
86 0.12
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.19
98 0.26
99 0.28
100 0.34
101 0.36
102 0.36
103 0.41
104 0.42
105 0.4
106 0.34
107 0.34
108 0.28
109 0.24
110 0.23
111 0.16
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.16
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.1
141 0.12
142 0.15
143 0.2
144 0.22
145 0.23
146 0.3
147 0.38
148 0.39
149 0.47
150 0.55
151 0.56
152 0.64
153 0.67
154 0.68
155 0.68
156 0.71
157 0.7
158 0.63
159 0.64
160 0.56
161 0.51
162 0.43
163 0.35
164 0.27
165 0.19
166 0.16
167 0.12
168 0.11
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.11
191 0.17
192 0.24
193 0.25
194 0.28
195 0.3
196 0.31
197 0.33
198 0.38
199 0.35
200 0.29
201 0.3
202 0.28
203 0.26
204 0.25
205 0.22
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.2
213 0.21
214 0.25
215 0.24
216 0.22
217 0.21
218 0.26
219 0.28
220 0.25
221 0.29
222 0.32
223 0.35
224 0.4
225 0.42
226 0.38
227 0.4
228 0.46
229 0.43
230 0.4
231 0.41
232 0.41
233 0.41
234 0.48
235 0.51
236 0.52
237 0.58
238 0.6
239 0.64
240 0.67
241 0.76
242 0.78
243 0.82
244 0.83
245 0.85
246 0.9
247 0.91
248 0.92
249 0.91
250 0.91
251 0.91
252 0.91
253 0.91
254 0.91
255 0.89
256 0.87
257 0.87
258 0.84
259 0.79
260 0.75
261 0.67
262 0.6
263 0.57
264 0.51
265 0.47
266 0.42
267 0.4
268 0.37
269 0.4
270 0.37
271 0.32
272 0.29
273 0.26
274 0.24
275 0.22
276 0.18
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.1
283 0.08
284 0.12
285 0.19
286 0.2
287 0.22
288 0.28
289 0.37
290 0.42
291 0.47
292 0.52
293 0.53
294 0.53
295 0.54
296 0.56
297 0.46
298 0.42
299 0.42
300 0.38
301 0.33
302 0.34
303 0.32
304 0.25
305 0.28
306 0.26
307 0.23
308 0.23
309 0.2
310 0.2
311 0.19
312 0.22
313 0.24
314 0.27
315 0.29
316 0.28
317 0.3
318 0.33
319 0.38
320 0.41
321 0.42
322 0.5
323 0.55
324 0.62
325 0.69
326 0.74
327 0.78
328 0.82
329 0.87
330 0.87
331 0.88
332 0.9
333 0.91
334 0.86
335 0.77
336 0.69
337 0.58
338 0.49
339 0.44
340 0.41
341 0.39
342 0.41
343 0.51
344 0.56
345 0.57
346 0.6
347 0.61
348 0.61
349 0.61
350 0.65
351 0.63
352 0.63
353 0.62
354 0.62
355 0.58
356 0.52
357 0.48
358 0.44
359 0.4
360 0.35
361 0.34
362 0.3
363 0.3
364 0.3
365 0.25
366 0.21
367 0.16
368 0.23
369 0.31
370 0.31
371 0.34
372 0.43
373 0.52
374 0.6
375 0.71
376 0.74
377 0.78