Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XAH5

Protein Details
Accession A0A1Y1XAH5    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-229GSSRRDERRSYRSRSRSRDRYRYDRGYSRBasic
242-293SYSRSFSKDRRSRSRSYSRDRRSRSRSYSKDRRSRSRSPRRGSYKSEGRDRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-292KAPSRRSRSREEDRDRGSSRRDERRSYRSRSRSRDRYRYDRGYSRRDEYRSRDREGRSYSRSFSKDRRSRSRSYSRDRRSRSRSYSKDRRSRSRSPRRGSYKSEGRDR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MKPSNKLETWGNETTMNLNNIVFQNVQASPYFKSLYELKTYHEVIDEIYNQVDNLEPFLRGTTASTAFCLLFKLWTLRLTVKQVNGVITHKDSPYIRALGFLYLRYVCKPAYLWEWFEPYLEDPEEIQTTRGPRPVNTTIGKLCLELLTEPKFLGTILPRIPVPIAREINEKLKDRVGDKYEDEKAPSRRSRSREEDRDRGSSRRDERRSYRSRSRSRDRYRYDRGYSRRDEYRSRDREGRSYSRSFSKDRRSRSRSYSRDRRSRSRSYSKDRRSRSRSPRRGSYKSEGRDRGTRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.3
4 0.23
5 0.2
6 0.21
7 0.21
8 0.23
9 0.19
10 0.14
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.16
15 0.18
16 0.17
17 0.21
18 0.22
19 0.18
20 0.21
21 0.24
22 0.26
23 0.31
24 0.3
25 0.3
26 0.34
27 0.35
28 0.33
29 0.29
30 0.26
31 0.2
32 0.24
33 0.22
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.09
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.11
58 0.09
59 0.11
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.17
64 0.19
65 0.23
66 0.28
67 0.3
68 0.29
69 0.31
70 0.31
71 0.29
72 0.28
73 0.26
74 0.23
75 0.22
76 0.23
77 0.19
78 0.22
79 0.2
80 0.21
81 0.23
82 0.22
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.19
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.17
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.24
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.12
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.13
117 0.14
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.23
122 0.26
123 0.3
124 0.28
125 0.29
126 0.26
127 0.28
128 0.28
129 0.2
130 0.17
131 0.12
132 0.11
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.22
155 0.23
156 0.3
157 0.33
158 0.33
159 0.27
160 0.29
161 0.29
162 0.28
163 0.32
164 0.28
165 0.26
166 0.27
167 0.31
168 0.32
169 0.31
170 0.32
171 0.32
172 0.35
173 0.4
174 0.42
175 0.44
176 0.46
177 0.51
178 0.57
179 0.6
180 0.65
181 0.68
182 0.71
183 0.72
184 0.7
185 0.73
186 0.67
187 0.61
188 0.55
189 0.53
190 0.53
191 0.55
192 0.56
193 0.56
194 0.6
195 0.68
196 0.71
197 0.72
198 0.74
199 0.74
200 0.79
201 0.8
202 0.83
203 0.84
204 0.86
205 0.88
206 0.86
207 0.85
208 0.85
209 0.84
210 0.81
211 0.79
212 0.76
213 0.74
214 0.71
215 0.67
216 0.65
217 0.61
218 0.61
219 0.6
220 0.64
221 0.61
222 0.62
223 0.63
224 0.59
225 0.63
226 0.63
227 0.64
228 0.59
229 0.58
230 0.56
231 0.57
232 0.57
233 0.55
234 0.56
235 0.59
236 0.6
237 0.65
238 0.72
239 0.71
240 0.74
241 0.78
242 0.8
243 0.79
244 0.82
245 0.84
246 0.83
247 0.87
248 0.88
249 0.88
250 0.86
251 0.86
252 0.85
253 0.85
254 0.85
255 0.85
256 0.88
257 0.88
258 0.9
259 0.89
260 0.9
261 0.87
262 0.88
263 0.89
264 0.89
265 0.89
266 0.88
267 0.89
268 0.88
269 0.88
270 0.85
271 0.84
272 0.83
273 0.81
274 0.82
275 0.78
276 0.74