FuNGI

A0A1Y1YS12

Protein Details

Accession

A0A1Y1YS12

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
290-337	VEPSNTDSKKRKRQKKVPESAEANEAVQEDKKKKKKKQKAVEEIPEAV	Hydrophilic
356-378	EPVQVEEPKKKKKQKVAEEPAAA	Hydrophilic
384-403	AQPVKAKTGKKQKKQAIVEE	Hydrophilic
416-439	IEEPVKKLSKKSKKQKIVEPETAV	Hydrophilic
445-465	EVTLKKSKKVKAEKEVTPKLV	Hydrophilic
504-528	VASDRKPMKSALKKSKRSVAANPKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
298-308	KKRKRQKKVPE
319-328	DKKKKKKKQK
350-350	K
362-371	EPKKKKKQKV
389-396	AKTGKKQK
422-429	KLSKKSKK
508-521	RKPMKSALKKSKRS

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 12.5, mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MTTTQPASNSFAKRLAHTDKKIRDKAVKALGKWLSSREDLDQLELLKLWKGLFYCFWMSDKPLIQQQLSNTLATMILDLPQTIAIPFVKAFWEIIVREWNGIDRYRLDKFYLLLRRYVNSTCTLLMNSSWDTELVEQYVDMMKSGVFNPSNLQIPNSVRTHVADLFLEELDKVVPTEKSEEVPMEKILEPFFYFIARNPNKLVYTRLQENLLQPLSERIQSEESEQRRYNYASIIESLAELAADAETTGVKRRRINQFLQAIGGTPKEPEVLEDDSMDVEEPEIVEDDVVEPSNTDSKKRKRQKKVPESAEANEAVQEDKKKKKKKQKAVEEIPEAVSEPVQEEEPKKVKKQKVVEPVQVEEPKKKKKQKVAEEPAAAEPIEVAQPVKAKTGKKQKKQAIVEEAAEPLAVEETITIEEPVKKLSKKSKKQKIVEPETAVEAPEVEVTLKKSKKVKAEKEVTPKLVEPSTPLSSASKKSVQWGLENNSVKRFKKQLPVSPMPSPVASDRKPMKSALKKSKRSVAANPKSSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.48
3	0.51
4	0.55
5	0.62
6	0.66
7	0.75
8	0.79
9	0.78
10	0.77
11	0.72
12	0.73
13	0.73
14	0.7
15	0.61
16	0.63
17	0.6
18	0.55
19	0.52
20	0.46
21	0.41
22	0.37
23	0.38
24	0.32
25	0.34
26	0.32
27	0.32
28	0.31
29	0.27
30	0.25
31	0.23
32	0.21
33	0.16
34	0.17
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.16
39	0.17
40	0.21
41	0.23
42	0.23
43	0.25
44	0.25
45	0.27
46	0.3
47	0.31
48	0.3
49	0.32
50	0.34
51	0.33
52	0.34
53	0.33
54	0.36
55	0.35
56	0.31
57	0.25
58	0.22
59	0.21
60	0.18
61	0.17
62	0.08
63	0.08
64	0.08
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.07
70	0.09
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.1
79	0.14
80	0.13
81	0.15
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.2
86	0.22
87	0.21
88	0.22
89	0.22
90	0.19
91	0.24
92	0.26
93	0.28
94	0.27
95	0.26
96	0.26
97	0.32
98	0.38
99	0.34
100	0.35
101	0.35
102	0.35
103	0.37
104	0.38
105	0.31
106	0.26
107	0.26
108	0.22
109	0.22
110	0.21
111	0.18
112	0.16
113	0.17
114	0.14
115	0.13
116	0.12
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.07
124	0.08
125	0.11
126	0.1
127	0.09
128	0.08
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.14
133	0.12
134	0.13
135	0.14
136	0.17
137	0.2
138	0.19
139	0.19
140	0.18
141	0.2
142	0.26
143	0.25
144	0.24
145	0.21
146	0.22
147	0.25
148	0.21
149	0.2
150	0.15
151	0.14
152	0.14
153	0.13
154	0.12
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.07
162	0.08
163	0.12
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.16
168	0.16
169	0.17
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.15
175	0.15
176	0.13
177	0.12
178	0.12
179	0.1
180	0.09
181	0.1
182	0.21
183	0.21
184	0.23
185	0.24
186	0.26
187	0.27
188	0.28
189	0.3
190	0.24
191	0.27
192	0.29
193	0.29
194	0.28
195	0.28
196	0.29
197	0.3
198	0.25
199	0.2
200	0.17
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.16
205	0.13
206	0.15
207	0.15
208	0.19
209	0.23
210	0.24
211	0.29
212	0.29
213	0.28
214	0.29
215	0.3
216	0.26
217	0.21
218	0.21
219	0.15
220	0.15
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.07
226	0.05
227	0.04
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.03
234	0.03
235	0.09
236	0.13
237	0.16
238	0.2
239	0.27
240	0.36
241	0.41
242	0.45
243	0.47
244	0.48
245	0.45
246	0.43
247	0.36
248	0.27
249	0.23
250	0.2
251	0.12
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.05
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.1
281	0.11
282	0.14
283	0.23
284	0.32
285	0.43
286	0.53
287	0.63
288	0.69
289	0.79
290	0.86
291	0.89
292	0.91
293	0.87
294	0.85
295	0.79
296	0.69
297	0.62
298	0.51
299	0.4
300	0.3
301	0.23
302	0.15
303	0.13
304	0.16
305	0.18
306	0.27
307	0.36
308	0.45
309	0.54
310	0.65
311	0.74
312	0.81
313	0.86
314	0.88
315	0.9
316	0.91
317	0.89
318	0.82
319	0.73
320	0.63
321	0.52
322	0.41
323	0.3
324	0.2
325	0.11
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.09
330	0.09
331	0.16
332	0.24
333	0.27
334	0.33
335	0.41
336	0.46
337	0.52
338	0.59
339	0.62
340	0.65
341	0.7
342	0.7
343	0.64
344	0.61
345	0.6
346	0.57
347	0.5
348	0.47
349	0.47
350	0.5
351	0.56
352	0.64
353	0.65
354	0.69
355	0.78
356	0.81
357	0.85
358	0.85
359	0.84
360	0.78
361	0.72
362	0.63
363	0.53
364	0.42
365	0.3
366	0.2
367	0.12
368	0.09
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.1
373	0.11
374	0.16
375	0.2
376	0.21
377	0.3
378	0.42
379	0.51
380	0.57
381	0.67
382	0.7
383	0.76
384	0.8
385	0.8
386	0.77
387	0.7
388	0.63
389	0.54
390	0.46
391	0.36
392	0.29
393	0.2
394	0.11
395	0.08
396	0.06
397	0.04
398	0.03
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.08
404	0.1
405	0.11
406	0.15
407	0.2
408	0.21
409	0.28
410	0.38
411	0.47
412	0.56
413	0.67
414	0.74
415	0.79
416	0.85
417	0.88
418	0.88
419	0.86
420	0.84
421	0.77
422	0.68
423	0.61
424	0.54
425	0.45
426	0.33
427	0.24
428	0.16
429	0.12
430	0.11
431	0.07
432	0.09
433	0.12
434	0.21
435	0.23
436	0.28
437	0.35
438	0.41
439	0.5
440	0.59
441	0.66
442	0.68
443	0.75
444	0.78
445	0.82
446	0.84
447	0.77
448	0.69
449	0.61
450	0.54
451	0.47
452	0.38
453	0.32
454	0.3
455	0.3
456	0.27
457	0.27
458	0.27
459	0.3
460	0.33
461	0.35
462	0.34
463	0.32
464	0.37
465	0.42
466	0.41
467	0.42
468	0.46
469	0.46
470	0.5
471	0.55
472	0.52
473	0.54
474	0.59
475	0.55
476	0.55
477	0.56
478	0.55
479	0.59
480	0.66
481	0.67
482	0.7
483	0.77
484	0.75
485	0.72
486	0.69
487	0.61
488	0.52
489	0.45
490	0.42
491	0.41
492	0.37
493	0.41
494	0.45
495	0.49
496	0.5
497	0.53
498	0.57
499	0.58
500	0.68
501	0.7
502	0.73
503	0.76
504	0.81
505	0.86
506	0.84
507	0.8
508	0.8
509	0.8
510	0.8

A0A1Y1YS12

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer