Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PID8

Protein Details
Accession B8PID8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
396-421LLTLPGYKRLRRTKMRREMLRDTVEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-144RARKIKRFEK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 4, cyto 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_103678  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
Amino Acid Sequences MTPFISLVGLDWASRQAVGPNEHERLREISPIDRRQKAAEMCLRPIGGQAKWYIYDQQCTKYLQYKLDSSLCLLLTRPPPRHLRMLHDISAITPLYRSFRRQIRLLPTVYLREYFKLKTRDDVRAILDTKKADLRARKIKRFEKELRKITLANQGIEKKFEHVLDLAYGRKGKLKWELINPLLTDPSIPPPERIIPAVEKSRPPVYSKELTALLTSKVSHKNKPLGHTAIRRPPTLPARADPNSEDARLLGPLSKRREVNIYWRFYTEQVKRVYPPFQMILEERDSPGETRHLTDKVALHRAGIRVGGVQGEGVYEEIETLANAPSPSQAGGTSGTDIFQASPLRPRFLRRRFASLLGRTPVLLKDFQGSSKYPFHVTPVIMIYEIPRIIFQKPMLLTLPGYKRLRRTKMRREMLRDTVEQRDWRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.19
5 0.23
6 0.28
7 0.33
8 0.37
9 0.39
10 0.4
11 0.38
12 0.37
13 0.35
14 0.34
15 0.3
16 0.33
17 0.41
18 0.5
19 0.56
20 0.56
21 0.56
22 0.55
23 0.61
24 0.56
25 0.56
26 0.55
27 0.51
28 0.5
29 0.51
30 0.48
31 0.4
32 0.41
33 0.36
34 0.27
35 0.25
36 0.24
37 0.24
38 0.25
39 0.26
40 0.3
41 0.28
42 0.35
43 0.36
44 0.38
45 0.38
46 0.39
47 0.42
48 0.41
49 0.43
50 0.41
51 0.42
52 0.41
53 0.43
54 0.44
55 0.41
56 0.35
57 0.34
58 0.29
59 0.25
60 0.22
61 0.23
62 0.27
63 0.34
64 0.36
65 0.39
66 0.45
67 0.49
68 0.57
69 0.54
70 0.54
71 0.56
72 0.58
73 0.54
74 0.49
75 0.45
76 0.36
77 0.36
78 0.28
79 0.19
80 0.13
81 0.12
82 0.15
83 0.18
84 0.21
85 0.25
86 0.33
87 0.38
88 0.41
89 0.47
90 0.51
91 0.55
92 0.52
93 0.48
94 0.44
95 0.43
96 0.41
97 0.36
98 0.29
99 0.24
100 0.26
101 0.25
102 0.3
103 0.33
104 0.32
105 0.38
106 0.42
107 0.47
108 0.47
109 0.49
110 0.44
111 0.43
112 0.44
113 0.38
114 0.36
115 0.29
116 0.28
117 0.27
118 0.27
119 0.26
120 0.31
121 0.37
122 0.45
123 0.53
124 0.59
125 0.66
126 0.71
127 0.72
128 0.75
129 0.76
130 0.77
131 0.78
132 0.77
133 0.72
134 0.67
135 0.61
136 0.55
137 0.55
138 0.46
139 0.37
140 0.34
141 0.35
142 0.33
143 0.34
144 0.31
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.18
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.13
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.25
161 0.3
162 0.33
163 0.38
164 0.43
165 0.41
166 0.43
167 0.39
168 0.32
169 0.26
170 0.21
171 0.16
172 0.11
173 0.13
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.19
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.24
188 0.26
189 0.25
190 0.25
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.27
195 0.26
196 0.24
197 0.23
198 0.21
199 0.19
200 0.14
201 0.11
202 0.11
203 0.13
204 0.21
205 0.23
206 0.27
207 0.31
208 0.38
209 0.4
210 0.43
211 0.45
212 0.41
213 0.44
214 0.47
215 0.48
216 0.49
217 0.48
218 0.46
219 0.4
220 0.42
221 0.41
222 0.4
223 0.36
224 0.29
225 0.34
226 0.35
227 0.36
228 0.31
229 0.3
230 0.26
231 0.25
232 0.23
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.12
239 0.18
240 0.24
241 0.27
242 0.27
243 0.28
244 0.33
245 0.32
246 0.39
247 0.41
248 0.41
249 0.38
250 0.39
251 0.39
252 0.36
253 0.43
254 0.36
255 0.35
256 0.34
257 0.35
258 0.35
259 0.37
260 0.39
261 0.31
262 0.3
263 0.26
264 0.23
265 0.23
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.14
277 0.16
278 0.19
279 0.19
280 0.19
281 0.22
282 0.25
283 0.27
284 0.32
285 0.29
286 0.27
287 0.29
288 0.29
289 0.26
290 0.22
291 0.17
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.2
330 0.22
331 0.27
332 0.28
333 0.36
334 0.43
335 0.51
336 0.6
337 0.56
338 0.63
339 0.62
340 0.68
341 0.69
342 0.65
343 0.63
344 0.55
345 0.52
346 0.43
347 0.41
348 0.36
349 0.29
350 0.24
351 0.17
352 0.19
353 0.2
354 0.22
355 0.25
356 0.24
357 0.26
358 0.31
359 0.33
360 0.31
361 0.3
362 0.32
363 0.34
364 0.32
365 0.3
366 0.27
367 0.26
368 0.23
369 0.22
370 0.19
371 0.18
372 0.18
373 0.15
374 0.14
375 0.16
376 0.17
377 0.21
378 0.2
379 0.23
380 0.24
381 0.27
382 0.27
383 0.26
384 0.26
385 0.3
386 0.36
387 0.38
388 0.42
389 0.43
390 0.51
391 0.59
392 0.68
393 0.71
394 0.76
395 0.78
396 0.84
397 0.91
398 0.91
399 0.89
400 0.88
401 0.86
402 0.82
403 0.77
404 0.7
405 0.68
406 0.64