Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PAA1

Protein Details
Accession B8PAA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-66AKYGIKKETKSTARRPDRQPDSSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_87988  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MQRKLEDAIHNLDEAVGPCATPLSQQPPAKRPRTGKSLYATLAKYGIKKETKSTARRPDRQPDSSLSKAAPHLAAILARTALRTRKALPFKLAPAAPPTKGATASTTEYRPSSMQSFLNRLSTFKLATYANKPSAIDAVAAARLVCGICDISWVVAGREGMSRDAANALVEKQRAQLVDMHKDGCPWKTRQCDASIYRIPLQAPLAMAREVKMRAVALDAVLQGVKIKHPLTTTQTQSLCSTISSVTVPTFAVPRLQEADNVHDNLAPPLTTLEASETGIITALFGWAILPPAPPSERSRTHSYCRASSVAPATPTRALSRAPSVMSLRESTPTPTTPRRSPSIAPSSPGRTGTLAKADTTLLHCALCQRRIGLWAFISPSVTNGTITPDASTVSSTRKAQPCRQLDVLREHRSYCPYVVRSTTVPSLPAPPTDAGTSALISQSAAAQPDNQAGAMEGWRAMLTVVLRHGLARRQRLNGLSNGRRISNDENTQQEGTPMEVDRVEAMVAGVKSRGGKDLLKYVKGLLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.12
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.15
10 0.2
11 0.28
12 0.34
13 0.42
14 0.5
15 0.6
16 0.65
17 0.68
18 0.69
19 0.68
20 0.73
21 0.71
22 0.68
23 0.65
24 0.65
25 0.6
26 0.59
27 0.51
28 0.43
29 0.43
30 0.38
31 0.35
32 0.32
33 0.38
34 0.37
35 0.38
36 0.42
37 0.48
38 0.55
39 0.61
40 0.67
41 0.7
42 0.74
43 0.81
44 0.84
45 0.85
46 0.84
47 0.8
48 0.75
49 0.71
50 0.68
51 0.63
52 0.57
53 0.47
54 0.41
55 0.37
56 0.36
57 0.29
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.18
69 0.21
70 0.23
71 0.27
72 0.35
73 0.44
74 0.47
75 0.5
76 0.51
77 0.51
78 0.54
79 0.51
80 0.43
81 0.42
82 0.41
83 0.35
84 0.33
85 0.31
86 0.26
87 0.27
88 0.26
89 0.21
90 0.2
91 0.24
92 0.24
93 0.23
94 0.23
95 0.23
96 0.24
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.23
102 0.25
103 0.3
104 0.3
105 0.36
106 0.33
107 0.31
108 0.31
109 0.29
110 0.26
111 0.21
112 0.22
113 0.18
114 0.22
115 0.26
116 0.3
117 0.3
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.28
122 0.24
123 0.19
124 0.13
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.19
164 0.2
165 0.26
166 0.27
167 0.27
168 0.25
169 0.27
170 0.28
171 0.26
172 0.27
173 0.24
174 0.3
175 0.35
176 0.38
177 0.39
178 0.41
179 0.45
180 0.43
181 0.48
182 0.44
183 0.41
184 0.4
185 0.38
186 0.35
187 0.29
188 0.27
189 0.19
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.15
218 0.2
219 0.25
220 0.27
221 0.3
222 0.31
223 0.3
224 0.3
225 0.28
226 0.22
227 0.16
228 0.15
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.12
243 0.12
244 0.14
245 0.14
246 0.19
247 0.19
248 0.2
249 0.19
250 0.16
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.14
283 0.2
284 0.24
285 0.29
286 0.37
287 0.4
288 0.44
289 0.49
290 0.49
291 0.44
292 0.43
293 0.4
294 0.32
295 0.3
296 0.28
297 0.23
298 0.22
299 0.2
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.18
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.17
309 0.16
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.16
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.22
322 0.27
323 0.32
324 0.36
325 0.39
326 0.4
327 0.42
328 0.42
329 0.45
330 0.48
331 0.43
332 0.41
333 0.4
334 0.4
335 0.38
336 0.37
337 0.3
338 0.21
339 0.22
340 0.22
341 0.24
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.17
353 0.22
354 0.23
355 0.21
356 0.21
357 0.21
358 0.25
359 0.26
360 0.23
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.18
365 0.19
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.1
381 0.13
382 0.17
383 0.19
384 0.27
385 0.34
386 0.4
387 0.46
388 0.55
389 0.57
390 0.59
391 0.64
392 0.6
393 0.57
394 0.61
395 0.63
396 0.61
397 0.56
398 0.52
399 0.49
400 0.49
401 0.46
402 0.39
403 0.37
404 0.32
405 0.34
406 0.34
407 0.34
408 0.31
409 0.33
410 0.33
411 0.26
412 0.25
413 0.23
414 0.26
415 0.24
416 0.24
417 0.23
418 0.2
419 0.21
420 0.2
421 0.2
422 0.16
423 0.16
424 0.15
425 0.13
426 0.12
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.12
436 0.14
437 0.15
438 0.13
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.17
457 0.22
458 0.29
459 0.36
460 0.4
461 0.44
462 0.49
463 0.53
464 0.54
465 0.56
466 0.58
467 0.55
468 0.57
469 0.55
470 0.52
471 0.48
472 0.48
473 0.47
474 0.46
475 0.46
476 0.45
477 0.46
478 0.49
479 0.5
480 0.45
481 0.39
482 0.31
483 0.25
484 0.23
485 0.19
486 0.16
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.09
493 0.09
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.16
500 0.17
501 0.2
502 0.19
503 0.23
504 0.26
505 0.36
506 0.41
507 0.41
508 0.41