Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XXP3

Protein Details
Accession A0A1Y1XXP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48LSQPKTSGGKKEKRFVRCKTYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-422K
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MNGIVRSAEQLTLFDEEDKLINELLELSQPKTSGGKKEKRFVRCKTYELPSGTAISSWKFTEYLYSQDPCPFPTLARGLFTTTLEGHHKIVIRGYDKFFNIGEVKQTEWDWIQQNTQGPYEVTIKENGCIIFVSSLPSGGLLVTSKHAWGPNENRTISHSEKGQEWLLKHLRTKGKTLDDFDDFLHQHDITAVFELCDDTFEEHVLEYPMESSGMYLHGINSNSVKLNTWTSAEVRACAQEFGFLEVSSVTKEQVSEVRAFVDEIRESGVYQGRAIEGFVVRCRRTDKNQVHFFKVKYDEPYLMYREWREVTLRIIRGQPYKHRYELTKDYGIWVKYMLDTEPELFTTFTQGIGIIKIRNMFLEYKKNPNMSLVVEKPKGPKKTLIFSVAIPGCGKTTLFLALSKLFGFKCVQNDNLGSKKKKKIAFEKAVMAEFEQNDIVLADKNNHIPGNREGLTNVFLSKYPGSSVIAVHWSIGANPPDKIYDLVYRRLLSRGENHQSLTPMRTKGFPSILGRFLNEYVPVDPNQDADSLITEVIQLDPFADAETNLQTALDTLCPLLDRQKPGGAKIKAALHHAIHYKPNFRKDQNSFTSLKIGYFAILLNHIPDVLRVYFTQHPDVDATFFHKLVSEDRIKIPHHITLVHRRDGQRSLKDQKLFDYYENFMKDNAKPSVTVTASHLIWNDKLMVLKARLRHENMPAVSKLLHITVGTISNEVKPYEAASVLRSVFPSGEHPKQIPDHHVVAIEPPLELEGLLEVFLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.16
7 0.13
8 0.12
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.18
16 0.18
17 0.2
18 0.25
19 0.29
20 0.33
21 0.42
22 0.5
23 0.57
24 0.66
25 0.73
26 0.78
27 0.83
28 0.81
29 0.81
30 0.78
31 0.76
32 0.74
33 0.73
34 0.7
35 0.65
36 0.59
37 0.5
38 0.46
39 0.4
40 0.33
41 0.28
42 0.22
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.21
49 0.21
50 0.25
51 0.28
52 0.29
53 0.3
54 0.36
55 0.36
56 0.31
57 0.32
58 0.27
59 0.22
60 0.27
61 0.31
62 0.27
63 0.28
64 0.28
65 0.27
66 0.28
67 0.28
68 0.24
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.23
73 0.21
74 0.23
75 0.25
76 0.24
77 0.27
78 0.29
79 0.29
80 0.32
81 0.35
82 0.37
83 0.35
84 0.36
85 0.33
86 0.31
87 0.3
88 0.26
89 0.28
90 0.24
91 0.24
92 0.24
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.26
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.27
101 0.32
102 0.31
103 0.31
104 0.27
105 0.23
106 0.24
107 0.27
108 0.24
109 0.21
110 0.24
111 0.23
112 0.22
113 0.25
114 0.22
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.11
119 0.11
120 0.14
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.15
135 0.16
136 0.23
137 0.3
138 0.37
139 0.44
140 0.44
141 0.42
142 0.43
143 0.48
144 0.44
145 0.4
146 0.34
147 0.29
148 0.31
149 0.33
150 0.34
151 0.31
152 0.28
153 0.33
154 0.36
155 0.38
156 0.39
157 0.44
158 0.48
159 0.47
160 0.52
161 0.5
162 0.53
163 0.54
164 0.55
165 0.52
166 0.46
167 0.45
168 0.4
169 0.39
170 0.3
171 0.26
172 0.25
173 0.2
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.18
223 0.19
224 0.18
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.12
229 0.15
230 0.15
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.14
249 0.14
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.15
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.09
266 0.13
267 0.18
268 0.17
269 0.19
270 0.24
271 0.27
272 0.33
273 0.42
274 0.48
275 0.53
276 0.62
277 0.64
278 0.66
279 0.66
280 0.6
281 0.56
282 0.5
283 0.43
284 0.37
285 0.36
286 0.31
287 0.29
288 0.31
289 0.28
290 0.25
291 0.24
292 0.2
293 0.21
294 0.2
295 0.18
296 0.17
297 0.15
298 0.19
299 0.23
300 0.24
301 0.23
302 0.25
303 0.27
304 0.3
305 0.32
306 0.37
307 0.37
308 0.39
309 0.4
310 0.4
311 0.39
312 0.41
313 0.45
314 0.42
315 0.4
316 0.35
317 0.35
318 0.37
319 0.35
320 0.28
321 0.2
322 0.15
323 0.12
324 0.13
325 0.11
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.14
350 0.24
351 0.25
352 0.32
353 0.35
354 0.36
355 0.35
356 0.33
357 0.31
358 0.23
359 0.26
360 0.22
361 0.24
362 0.24
363 0.26
364 0.3
365 0.35
366 0.36
367 0.33
368 0.35
369 0.33
370 0.37
371 0.39
372 0.38
373 0.32
374 0.29
375 0.34
376 0.28
377 0.25
378 0.2
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.16
398 0.17
399 0.18
400 0.18
401 0.2
402 0.23
403 0.28
404 0.32
405 0.32
406 0.38
407 0.43
408 0.48
409 0.51
410 0.55
411 0.58
412 0.62
413 0.67
414 0.63
415 0.62
416 0.57
417 0.53
418 0.46
419 0.36
420 0.28
421 0.19
422 0.16
423 0.1
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.1
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.15
437 0.17
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.19
442 0.19
443 0.21
444 0.18
445 0.16
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.12
464 0.13
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.13
472 0.18
473 0.19
474 0.24
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.28
479 0.27
480 0.22
481 0.25
482 0.3
483 0.33
484 0.33
485 0.34
486 0.33
487 0.34
488 0.33
489 0.3
490 0.26
491 0.23
492 0.22
493 0.24
494 0.24
495 0.26
496 0.26
497 0.27
498 0.27
499 0.29
500 0.32
501 0.3
502 0.29
503 0.26
504 0.25
505 0.22
506 0.18
507 0.16
508 0.13
509 0.15
510 0.14
511 0.15
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.13
516 0.11
517 0.09
518 0.1
519 0.09
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.14
548 0.18
549 0.21
550 0.23
551 0.29
552 0.3
553 0.34
554 0.43
555 0.38
556 0.35
557 0.36
558 0.39
559 0.35
560 0.37
561 0.37
562 0.28
563 0.31
564 0.33
565 0.32
566 0.33
567 0.35
568 0.4
569 0.42
570 0.49
571 0.53
572 0.52
573 0.6
574 0.59
575 0.65
576 0.62
577 0.62
578 0.56
579 0.5
580 0.52
581 0.43
582 0.36
583 0.28
584 0.22
585 0.17
586 0.15
587 0.14
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.11
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.16
601 0.21
602 0.24
603 0.28
604 0.25
605 0.26
606 0.26
607 0.26
608 0.22
609 0.18
610 0.2
611 0.17
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.16
616 0.18
617 0.25
618 0.25
619 0.26
620 0.3
621 0.35
622 0.35
623 0.39
624 0.39
625 0.35
626 0.32
627 0.33
628 0.36
629 0.42
630 0.47
631 0.47
632 0.5
633 0.49
634 0.52
635 0.56
636 0.58
637 0.56
638 0.58
639 0.61
640 0.62
641 0.65
642 0.62
643 0.58
644 0.56
645 0.5
646 0.44
647 0.41
648 0.36
649 0.38
650 0.39
651 0.35
652 0.3
653 0.31
654 0.32
655 0.34
656 0.35
657 0.29
658 0.27
659 0.28
660 0.35
661 0.31
662 0.3
663 0.27
664 0.28
665 0.27
666 0.29
667 0.29
668 0.23
669 0.23
670 0.23
671 0.2
672 0.16
673 0.17
674 0.17
675 0.21
676 0.23
677 0.27
678 0.32
679 0.37
680 0.43
681 0.47
682 0.5
683 0.52
684 0.56
685 0.54
686 0.54
687 0.47
688 0.42
689 0.37
690 0.33
691 0.28
692 0.2
693 0.18
694 0.13
695 0.14
696 0.14
697 0.17
698 0.17
699 0.17
700 0.17
701 0.19
702 0.21
703 0.2
704 0.19
705 0.15
706 0.16
707 0.17
708 0.18
709 0.15
710 0.15
711 0.2
712 0.2
713 0.21
714 0.2
715 0.19
716 0.18
717 0.18
718 0.24
719 0.27
720 0.32
721 0.36
722 0.36
723 0.41
724 0.46
725 0.5
726 0.48
727 0.47
728 0.44
729 0.41
730 0.4
731 0.35
732 0.32
733 0.31
734 0.25
735 0.18
736 0.15
737 0.14
738 0.13
739 0.12
740 0.09
741 0.07
742 0.07