Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z9K4

Protein Details
Accession A0A1Y1Z9K4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78IKQLSIHRKGRKHREEKETFSVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-66R
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033570  SCNM1  
IPR031625  SCNM1_acidic  
IPR031622  Znf-SCNM1  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15805  SCNM1_acidic  
PF15803  zf-SCNM1  
Amino Acid Sequences MFKLTGERSRSENNRHTKRLTDELLAEKISPKEATLLANGKYKCLVCRWKPILDDIKQLSIHRKGRKHREEKETFSVKQLPIVKVQEETSSSTPLLSSTQEKMTKALLPGPRYNPLSTKKSERVDNRSIFQPQFTRQQPKPKAKPIVATTYSSQDYVFPWMVQGPKITKGKQSVIVGDDQTPVSPEEVHRIALEKYHLQLAQAGWKRDENGEFVKDESVEFDSDEELPLPPPPPPGLPSQKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.71
4 0.69
5 0.67
6 0.66
7 0.61
8 0.54
9 0.49
10 0.48
11 0.47
12 0.41
13 0.35
14 0.3
15 0.27
16 0.26
17 0.21
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.2
23 0.23
24 0.24
25 0.3
26 0.3
27 0.28
28 0.3
29 0.29
30 0.26
31 0.3
32 0.37
33 0.36
34 0.47
35 0.51
36 0.53
37 0.53
38 0.58
39 0.59
40 0.52
41 0.54
42 0.46
43 0.46
44 0.42
45 0.42
46 0.41
47 0.41
48 0.45
49 0.46
50 0.51
51 0.56
52 0.66
53 0.75
54 0.79
55 0.79
56 0.82
57 0.82
58 0.82
59 0.81
60 0.77
61 0.66
62 0.61
63 0.57
64 0.47
65 0.45
66 0.43
67 0.35
68 0.34
69 0.35
70 0.31
71 0.27
72 0.27
73 0.23
74 0.19
75 0.22
76 0.18
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.17
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.19
93 0.23
94 0.21
95 0.23
96 0.26
97 0.28
98 0.31
99 0.31
100 0.31
101 0.3
102 0.32
103 0.33
104 0.32
105 0.36
106 0.37
107 0.39
108 0.45
109 0.46
110 0.48
111 0.52
112 0.52
113 0.47
114 0.44
115 0.44
116 0.38
117 0.34
118 0.29
119 0.23
120 0.29
121 0.31
122 0.36
123 0.36
124 0.46
125 0.53
126 0.61
127 0.66
128 0.67
129 0.69
130 0.64
131 0.67
132 0.6
133 0.6
134 0.52
135 0.47
136 0.39
137 0.36
138 0.34
139 0.28
140 0.24
141 0.16
142 0.14
143 0.16
144 0.15
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.16
151 0.14
152 0.2
153 0.25
154 0.26
155 0.29
156 0.33
157 0.36
158 0.39
159 0.39
160 0.34
161 0.32
162 0.33
163 0.29
164 0.25
165 0.23
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.21
181 0.17
182 0.17
183 0.21
184 0.21
185 0.19
186 0.22
187 0.2
188 0.26
189 0.3
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.32
194 0.33
195 0.33
196 0.29
197 0.28
198 0.29
199 0.27
200 0.27
201 0.26
202 0.23
203 0.21
204 0.19
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.19
221 0.21
222 0.3