Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1XTU1

Protein Details
Accession A0A1Y1XTU1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
507-531VDNNRPPLTQHKKKVRECYQGLQDVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 12.833, nucl 10.5, cyto_pero 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028021  Katanin_C-terminal  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005856  C:cytoskeleton  
GO:0008017  F:microtubule binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13925  Katanin_con80  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSSTVDQLEENFVAHSSGVNCLKFGTKSGRVFVSGGNDSLVKVWIVGKSESEMSLSGLRAPVKTVGLDSYELIAGGGTIDGEIKLWDLVRAKAIRTFNASKTAIQSLEFHPFGGFLASASKSTIKVWDIRERKCIQTYKDATNTLKMSPDGRLIITGGVDSSVKIWDLTAGKILKTFSGHTSPVTSVAIHPHECLLATSELSGCVKFWDIDRFEMVGSLDPHSGDLDASKAVNSIQFGPDGSSLVGVGQNVMKMYGWEPAQCYSRITPPWTNLADFSITKANQFIGANIVNDTINTWAMDMMDLMKYPEDQNDLEDQVAVSTITKKLDEIAVNSPAPSTASAPRSPFDHHHSLEKPVLNSPAPLNTPTSNPSPDQRSPKPHSSISIGTQSWQSEEDFVEHLSNGHASVADQMAKRLEDVRALRATWDEAGVTRALKMLPTIKDTAVYVDLLKIFTLNPKLLNIEASITILPLVTELLFEPYENYIITASTVIKQIIRNHQIAIKNIVDNNRPPLTQHKKKVRECYQGLQDVKVLLMDLKNTPGQVGAAVRDALNEFSTLPHC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.1
4 0.17
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.26
10 0.24
11 0.28
12 0.3
13 0.33
14 0.37
15 0.41
16 0.42
17 0.4
18 0.41
19 0.39
20 0.37
21 0.31
22 0.27
23 0.24
24 0.22
25 0.2
26 0.2
27 0.18
28 0.11
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.18
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.17
43 0.16
44 0.18
45 0.19
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.09
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.03
65 0.03
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.1
74 0.12
75 0.13
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.28
80 0.3
81 0.3
82 0.35
83 0.39
84 0.35
85 0.42
86 0.42
87 0.37
88 0.38
89 0.39
90 0.32
91 0.28
92 0.29
93 0.23
94 0.29
95 0.27
96 0.24
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.16
101 0.13
102 0.06
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.17
111 0.16
112 0.21
113 0.26
114 0.35
115 0.41
116 0.44
117 0.52
118 0.52
119 0.54
120 0.56
121 0.57
122 0.51
123 0.54
124 0.56
125 0.54
126 0.57
127 0.56
128 0.5
129 0.5
130 0.47
131 0.38
132 0.35
133 0.29
134 0.24
135 0.22
136 0.23
137 0.19
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.16
165 0.19
166 0.2
167 0.19
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.19
172 0.16
173 0.12
174 0.16
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.09
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.14
251 0.18
252 0.19
253 0.23
254 0.23
255 0.23
256 0.28
257 0.27
258 0.26
259 0.22
260 0.21
261 0.19
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.12
327 0.16
328 0.18
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.24
333 0.26
334 0.28
335 0.31
336 0.3
337 0.35
338 0.36
339 0.38
340 0.4
341 0.39
342 0.33
343 0.28
344 0.3
345 0.23
346 0.23
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.22
356 0.21
357 0.21
358 0.24
359 0.28
360 0.33
361 0.4
362 0.43
363 0.49
364 0.54
365 0.61
366 0.62
367 0.56
368 0.53
369 0.49
370 0.46
371 0.4
372 0.39
373 0.31
374 0.28
375 0.28
376 0.26
377 0.22
378 0.2
379 0.16
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.18
405 0.2
406 0.24
407 0.24
408 0.24
409 0.24
410 0.23
411 0.24
412 0.18
413 0.16
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.11
424 0.16
425 0.17
426 0.21
427 0.23
428 0.22
429 0.23
430 0.23
431 0.23
432 0.18
433 0.17
434 0.13
435 0.13
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.1
440 0.09
441 0.14
442 0.17
443 0.17
444 0.17
445 0.18
446 0.2
447 0.2
448 0.21
449 0.17
450 0.15
451 0.13
452 0.14
453 0.12
454 0.11
455 0.1
456 0.09
457 0.08
458 0.06
459 0.06
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.11
470 0.12
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.11
477 0.13
478 0.13
479 0.16
480 0.2
481 0.27
482 0.36
483 0.4
484 0.4
485 0.4
486 0.45
487 0.47
488 0.46
489 0.45
490 0.38
491 0.36
492 0.38
493 0.41
494 0.4
495 0.39
496 0.43
497 0.4
498 0.36
499 0.35
500 0.42
501 0.48
502 0.53
503 0.6
504 0.64
505 0.71
506 0.8
507 0.88
508 0.88
509 0.88
510 0.84
511 0.83
512 0.81
513 0.79
514 0.73
515 0.64
516 0.55
517 0.45
518 0.38
519 0.29
520 0.21
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.17
526 0.19
527 0.19
528 0.18
529 0.17
530 0.16
531 0.16
532 0.16
533 0.15
534 0.16
535 0.17
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.17
540 0.15
541 0.14
542 0.12