Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YBE8

Protein Details
Accession A0A1Y1YBE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38DEWHRLRRESHKEVERRRRETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-127KKKARKE
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR047206  bHLHzip_scCBP1-like  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11398  bHLHzip_scCBP1  
Amino Acid Sequences MDSNSGELPKQKPPVGSDEWHRLRRESHKEVERRRRETINEGINEIAKLVPGCEKNKGSILSRAVQYIQQLKDNESTNIEKWTLEKLLTDQAINELSNQVEILKAENEQLRAQLEELSPSKKKARKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.44
4 0.44
5 0.48
6 0.53
7 0.56
8 0.54
9 0.49
10 0.5
11 0.56
12 0.59
13 0.55
14 0.56
15 0.6
16 0.67
17 0.76
18 0.81
19 0.81
20 0.77
21 0.75
22 0.7
23 0.65
24 0.63
25 0.6
26 0.56
27 0.48
28 0.43
29 0.39
30 0.34
31 0.3
32 0.23
33 0.15
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.1
38 0.13
39 0.14
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.24
44 0.26
45 0.23
46 0.25
47 0.26
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.18
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.22
63 0.23
64 0.19
65 0.21
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.18
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.15
94 0.18
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.21
103 0.23
104 0.27
105 0.28
106 0.32
107 0.4