Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Y1N1

Protein Details
Accession A0A1Y1Y1N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-459NHKDQGSRSSRRTRKRTSRERSRKTAKPAEPKDYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
433-454RSSRRTRKRTSRERSRKTAKPA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MSKERVSYYYDADVGNYTYGPGHPMKPHRMRMTHNLVVNYGLHKKMEILRPPRASKSQMTRFHSDEYIDFLQKVTTENMDNLVAHQNRFLSGDDCPVFDGLYEFCSISAGGSIAGANKLNRGESDIVINWSGGLHHAKKTEASGFCYVNDIVLAILELLRHHQRVLYIDIDCHHGDGVEEAFYTTDRVMSVSFHKYGEYFPGTGDLDDIGIGKGKNYAVNFPLRDGIDDESYKVVFESVISHVMEWYRPGAVVMQCGTDSLAGDRLGCFNLSMKGHGHCVKFMRTFNVPLIFVGGGGYTIRNVSRTWAYETGVILNEELDENLPYNDYYEYFGPDYKLGVPSNNMENLNTREYLEKIRTKVIENLRQIPFAPSVQMQEVPRDFSSDEEEEADPDVRVSTQQYDARVVPETELSDSDDDDHRRDETNHKDQGSRSSRRTRKRTSRERSRKTAKPAEPKDYSVKSEHSGFPLTGSSTRFDKDSSFVEEEEESSGKAAPTADRHPIVRDSNAVTVKSEPDDEHKMDVDEELETEDDGDGDGDGEVQSGAEPARDPSAQTPTPMEVEVETPDHQSAQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.16
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.15
8 0.16
9 0.2
10 0.27
11 0.35
12 0.45
13 0.53
14 0.63
15 0.67
16 0.71
17 0.73
18 0.75
19 0.76
20 0.72
21 0.67
22 0.59
23 0.51
24 0.47
25 0.41
26 0.36
27 0.32
28 0.27
29 0.23
30 0.22
31 0.25
32 0.3
33 0.37
34 0.42
35 0.44
36 0.52
37 0.6
38 0.65
39 0.68
40 0.66
41 0.63
42 0.62
43 0.65
44 0.66
45 0.67
46 0.68
47 0.67
48 0.64
49 0.63
50 0.57
51 0.48
52 0.39
53 0.36
54 0.34
55 0.3
56 0.27
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.21
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.25
70 0.24
71 0.22
72 0.23
73 0.22
74 0.21
75 0.23
76 0.22
77 0.15
78 0.14
79 0.22
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.18
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.1
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.21
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.2
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.1
120 0.14
121 0.15
122 0.18
123 0.19
124 0.2
125 0.21
126 0.24
127 0.29
128 0.26
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.28
133 0.3
134 0.27
135 0.19
136 0.17
137 0.12
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.08
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.17
152 0.2
153 0.2
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.22
158 0.2
159 0.17
160 0.14
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.12
178 0.15
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.13
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.15
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.22
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.16
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.21
267 0.24
268 0.26
269 0.26
270 0.26
271 0.23
272 0.24
273 0.24
274 0.24
275 0.2
276 0.16
277 0.16
278 0.13
279 0.11
280 0.09
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.08
291 0.1
292 0.12
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.14
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.14
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.14
329 0.17
330 0.19
331 0.18
332 0.15
333 0.18
334 0.2
335 0.21
336 0.19
337 0.18
338 0.16
339 0.17
340 0.21
341 0.24
342 0.25
343 0.25
344 0.29
345 0.29
346 0.3
347 0.37
348 0.41
349 0.43
350 0.43
351 0.49
352 0.45
353 0.45
354 0.43
355 0.38
356 0.31
357 0.23
358 0.21
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.18
363 0.16
364 0.19
365 0.2
366 0.21
367 0.2
368 0.21
369 0.19
370 0.17
371 0.22
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.15
377 0.17
378 0.16
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.07
383 0.07
384 0.09
385 0.1
386 0.15
387 0.17
388 0.19
389 0.21
390 0.22
391 0.23
392 0.23
393 0.21
394 0.16
395 0.16
396 0.15
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.16
404 0.17
405 0.17
406 0.18
407 0.17
408 0.19
409 0.22
410 0.28
411 0.32
412 0.4
413 0.44
414 0.44
415 0.46
416 0.45
417 0.54
418 0.54
419 0.52
420 0.51
421 0.56
422 0.63
423 0.7
424 0.78
425 0.79
426 0.81
427 0.85
428 0.89
429 0.89
430 0.92
431 0.93
432 0.93
433 0.92
434 0.9
435 0.87
436 0.86
437 0.85
438 0.83
439 0.82
440 0.81
441 0.79
442 0.73
443 0.69
444 0.68
445 0.61
446 0.55
447 0.48
448 0.44
449 0.38
450 0.39
451 0.37
452 0.32
453 0.31
454 0.27
455 0.25
456 0.23
457 0.22
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.19
462 0.2
463 0.2
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.21
468 0.25
469 0.25
470 0.24
471 0.26
472 0.25
473 0.24
474 0.24
475 0.21
476 0.14
477 0.12
478 0.13
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.17
484 0.22
485 0.28
486 0.29
487 0.3
488 0.33
489 0.38
490 0.38
491 0.35
492 0.35
493 0.31
494 0.36
495 0.38
496 0.35
497 0.31
498 0.29
499 0.29
500 0.28
501 0.26
502 0.21
503 0.23
504 0.3
505 0.3
506 0.31
507 0.3
508 0.29
509 0.27
510 0.26
511 0.21
512 0.14
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.08
535 0.09
536 0.14
537 0.14
538 0.16
539 0.2
540 0.28
541 0.28
542 0.3
543 0.32
544 0.3
545 0.32
546 0.3
547 0.27
548 0.19
549 0.2
550 0.2
551 0.2
552 0.19
553 0.19
554 0.19