Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1XGU5

Protein Details
Accession A0A1Y1XGU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-154EKKTEYSKAKYIKKKEKKFKKVFTPVKPNLYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-143KAKYIKKKEKKFKK
400-401KG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MEDIPIIKEGENVFIEMPSGNVKVVSLKANSIVNMGKFGNFQVNDLIGKPFGHSYEVIGKNKIQVTRHAGLSVITETTANNREIVDNNASQKLSQEDVEKLKETGLEGGAIVETLVENHASFEKKTEYSKAKYIKKKEKKFKKVFTPVKPNLYSLCDYFFKKNPTKIRDLRIDTLSQMLNMGNIRAHSKILVVDDTQGLVICGLMERMAGYGSILGIHDGDNHNYDTMRYMNFPTHTRDMLKVLSWAYVSKDSAPEPFQEQDTSAMEEREVIAYNRKKKAHERLSGAQNMLWEGDFDALLIASQYAPDSILEELLPYVAGSRPIVVYSPNKEVLVNTYNYMKKSMECLNPQITESWLREYQVLPGRTHPTMNTSGSGGYLLNAIKVIDCPAEPMNANRRKGARKLAKAANTNDDMKVDVETSQPIEAESNVAKRTKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.13
4 0.14
5 0.12
6 0.12
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.13
11 0.16
12 0.2
13 0.18
14 0.19
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.24
19 0.25
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.2
26 0.25
27 0.22
28 0.22
29 0.21
30 0.23
31 0.22
32 0.23
33 0.23
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.15
41 0.17
42 0.26
43 0.33
44 0.34
45 0.35
46 0.35
47 0.38
48 0.42
49 0.43
50 0.35
51 0.35
52 0.41
53 0.43
54 0.43
55 0.38
56 0.33
57 0.29
58 0.3
59 0.23
60 0.15
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.14
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.17
70 0.19
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.28
76 0.28
77 0.26
78 0.26
79 0.24
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.25
85 0.28
86 0.28
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.18
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.06
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.13
110 0.16
111 0.18
112 0.21
113 0.27
114 0.31
115 0.34
116 0.42
117 0.48
118 0.54
119 0.61
120 0.69
121 0.72
122 0.77
123 0.83
124 0.86
125 0.89
126 0.91
127 0.92
128 0.91
129 0.91
130 0.91
131 0.9
132 0.89
133 0.89
134 0.83
135 0.81
136 0.73
137 0.63
138 0.54
139 0.49
140 0.4
141 0.3
142 0.28
143 0.22
144 0.23
145 0.26
146 0.29
147 0.32
148 0.36
149 0.43
150 0.48
151 0.51
152 0.58
153 0.6
154 0.62
155 0.63
156 0.63
157 0.59
158 0.53
159 0.48
160 0.39
161 0.36
162 0.29
163 0.2
164 0.16
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.14
220 0.16
221 0.2
222 0.21
223 0.22
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.19
229 0.16
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.13
239 0.12
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.16
260 0.22
261 0.3
262 0.36
263 0.39
264 0.42
265 0.49
266 0.6
267 0.61
268 0.63
269 0.63
270 0.64
271 0.68
272 0.68
273 0.6
274 0.5
275 0.4
276 0.33
277 0.25
278 0.18
279 0.1
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.12
313 0.16
314 0.19
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.25
320 0.27
321 0.27
322 0.24
323 0.2
324 0.25
325 0.27
326 0.28
327 0.3
328 0.25
329 0.22
330 0.25
331 0.32
332 0.32
333 0.34
334 0.39
335 0.42
336 0.42
337 0.42
338 0.38
339 0.33
340 0.31
341 0.28
342 0.28
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.24
347 0.29
348 0.32
349 0.34
350 0.29
351 0.33
352 0.37
353 0.37
354 0.38
355 0.31
356 0.29
357 0.31
358 0.32
359 0.27
360 0.23
361 0.22
362 0.21
363 0.21
364 0.15
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.13
377 0.13
378 0.16
379 0.17
380 0.23
381 0.31
382 0.38
383 0.4
384 0.43
385 0.49
386 0.53
387 0.59
388 0.64
389 0.64
390 0.65
391 0.73
392 0.76
393 0.77
394 0.77
395 0.75
396 0.72
397 0.66
398 0.6
399 0.52
400 0.43
401 0.36
402 0.29
403 0.26
404 0.19
405 0.15
406 0.14
407 0.15
408 0.16
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.16
415 0.18
416 0.21
417 0.24
418 0.26