Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZDM3

Protein Details
Accession A0A1Y1ZDM3    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-103QKSASKPVTTSKRGRPKKALSKADEVAHydrophilic
126-147TDVPVTPSRRGRPRKIVPIESDHydrophilic
149-174LAIPQTPRTRGRPRKQPTEVKKEPATHydrophilic
247-271DEFQQTRTPRGKKPKPPATPKSVLGHydrophilic
702-721EVKSKKVKKAGKESVKKAKEBasic
994-1020KLVELRKKFEEDKKKIQHLKTARRFLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-95NEKAAQKSASKPVTTSKRGRPKKA
157-170TRGRPRKQPTEVKK
255-276PRGKKPKPPATPKSVLGRRRLK
704-720KSKKVKKAGKESVKKAK
999-1008RKKFEEDKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041083  AAA_lid_10  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR015163  Cdc6_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR024326  RRP7_C  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17872  AAA_lid_10  
PF09079  Cdc6_C  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd00009  AAA  
cd12293  dRRM_Rrp7p  
cd12951  RRP7_Rrp7A  
Amino Acid Sequences MNNSDKSSEPVIQDDELSMRTPLRRSARTAAREEKNAITNNIETPKTRGRSTQRPTRSVGASTQTPATARKNEKAAQKSASKPVTTSKRGRPKKALSKADEVADDPTEAIKCELEAEEENQDILATDVPVTPSRRGRPRKIVPIESDELAIPQTPRTRGRPRKQPTEVKKEPATATRKSSRLVKVEDSTPTAELNKTLPRSAKGTRRKSVVKQDPSSDEFEDNNESEDEDALPTTPRDETSTDESADEFQQTRTPRGKKPKPPATPKSVLGRRRLKTLAPITPLRRRQIQQLDTDNHFEQARQNLHVSAVPLTLPCREDEFAEILAHVESSLEDETGTCVYISGVPGTGKTATVHEVIRNLQGKAEEGDIAEFQFVEINGMKLTEPSYAYTLLYEALTGERVTAKHASDLLEKMFTSPSNDRKPCLVLMDELDLLVTRKQTVMYNFFEWPNRPNSRLIVIAVANTMDLPERILSNKISSRLGLTRINFQPYSHQQLYSIIQSRLVGNNTFDSDAMEFCARKVSAVSGDARRALDICRRAVELVETAHRGGQAAANGQPITQVTMSMVDKAIKEMYASSNVKFIQNASLHQKMFLVALNHQLRKAGLPEVEFGEVANQHIQICRMNNLEPPNTSDLAAICASLGAARCLLVEAGRLDLHQRIRLNVAEEDVTMALRADSFFRKMWSDFCEFPTLETLLKMPAEVKSKKVKKAGKESVKKAKEEALPLEQISGFSILPVEMPASSVSSSVTHYFYFKKHNVRQENPLTPEDRTLFLLNLPADTTENHIKHLFRHVGKIERVSFNMTERQMEEKILELQMNDTSEASSGKKGKKSDKEEPAEVEPNCTLLPTGSFAHVIFLEELGLTKAMNMTKKKRVWGLPETPAAEKHLVGLEKYEHLYQRNRLDPETLQTRIDNFMKKFNEAQQEAAKAEAALYNVPDEDGFITVTRKGRRNNNTDGKISVTAIKAEEAQNLKPKKKELVDFYRFQMREAKRDKLVELRKKFEEDKKKIQHLKTARRFLPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.2
8 0.22
9 0.29
10 0.36
11 0.39
12 0.44
13 0.53
14 0.59
15 0.63
16 0.69
17 0.7
18 0.68
19 0.69
20 0.67
21 0.63
22 0.6
23 0.56
24 0.5
25 0.44
26 0.39
27 0.4
28 0.41
29 0.38
30 0.32
31 0.35
32 0.42
33 0.42
34 0.43
35 0.46
36 0.49
37 0.58
38 0.66
39 0.7
40 0.7
41 0.7
42 0.73
43 0.71
44 0.66
45 0.58
46 0.54
47 0.49
48 0.43
49 0.41
50 0.37
51 0.32
52 0.29
53 0.31
54 0.32
55 0.36
56 0.39
57 0.42
58 0.48
59 0.52
60 0.6
61 0.62
62 0.62
63 0.59
64 0.61
65 0.61
66 0.64
67 0.64
68 0.55
69 0.5
70 0.54
71 0.57
72 0.58
73 0.6
74 0.61
75 0.66
76 0.75
77 0.82
78 0.83
79 0.84
80 0.86
81 0.88
82 0.88
83 0.83
84 0.82
85 0.76
86 0.69
87 0.6
88 0.5
89 0.42
90 0.33
91 0.27
92 0.19
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.16
108 0.15
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.11
116 0.15
117 0.18
118 0.23
119 0.29
120 0.37
121 0.47
122 0.55
123 0.62
124 0.69
125 0.76
126 0.82
127 0.83
128 0.83
129 0.78
130 0.77
131 0.7
132 0.6
133 0.51
134 0.4
135 0.32
136 0.24
137 0.21
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.22
142 0.27
143 0.35
144 0.46
145 0.55
146 0.64
147 0.71
148 0.75
149 0.81
150 0.86
151 0.89
152 0.88
153 0.88
154 0.85
155 0.81
156 0.77
157 0.71
158 0.65
159 0.62
160 0.58
161 0.52
162 0.53
163 0.53
164 0.51
165 0.49
166 0.54
167 0.52
168 0.54
169 0.54
170 0.52
171 0.48
172 0.5
173 0.5
174 0.45
175 0.39
176 0.33
177 0.29
178 0.25
179 0.21
180 0.18
181 0.19
182 0.22
183 0.22
184 0.25
185 0.27
186 0.28
187 0.33
188 0.39
189 0.45
190 0.5
191 0.57
192 0.59
193 0.64
194 0.69
195 0.72
196 0.76
197 0.76
198 0.76
199 0.71
200 0.7
201 0.68
202 0.65
203 0.6
204 0.51
205 0.42
206 0.33
207 0.31
208 0.29
209 0.23
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.17
227 0.22
228 0.25
229 0.24
230 0.23
231 0.23
232 0.22
233 0.22
234 0.19
235 0.14
236 0.12
237 0.16
238 0.17
239 0.23
240 0.3
241 0.35
242 0.41
243 0.52
244 0.61
245 0.67
246 0.76
247 0.81
248 0.83
249 0.88
250 0.87
251 0.85
252 0.81
253 0.75
254 0.74
255 0.72
256 0.67
257 0.66
258 0.68
259 0.6
260 0.61
261 0.59
262 0.5
263 0.51
264 0.53
265 0.49
266 0.45
267 0.5
268 0.49
269 0.56
270 0.61
271 0.55
272 0.55
273 0.51
274 0.55
275 0.58
276 0.57
277 0.55
278 0.58
279 0.59
280 0.54
281 0.57
282 0.48
283 0.4
284 0.35
285 0.28
286 0.23
287 0.25
288 0.25
289 0.23
290 0.23
291 0.22
292 0.23
293 0.24
294 0.21
295 0.15
296 0.13
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.07
315 0.05
316 0.04
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.13
341 0.14
342 0.13
343 0.15
344 0.15
345 0.21
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.17
352 0.17
353 0.12
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.1
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.16
396 0.17
397 0.16
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.14
404 0.18
405 0.25
406 0.34
407 0.35
408 0.35
409 0.36
410 0.37
411 0.33
412 0.3
413 0.23
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.14
418 0.12
419 0.11
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.06
426 0.07
427 0.1
428 0.13
429 0.18
430 0.2
431 0.22
432 0.24
433 0.25
434 0.26
435 0.24
436 0.24
437 0.26
438 0.25
439 0.25
440 0.25
441 0.25
442 0.25
443 0.25
444 0.23
445 0.17
446 0.15
447 0.13
448 0.12
449 0.1
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.06
459 0.08
460 0.08
461 0.11
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.17
467 0.17
468 0.2
469 0.2
470 0.19
471 0.24
472 0.26
473 0.29
474 0.27
475 0.25
476 0.29
477 0.28
478 0.36
479 0.29
480 0.28
481 0.24
482 0.27
483 0.28
484 0.26
485 0.26
486 0.17
487 0.17
488 0.17
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.14
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.11
512 0.15
513 0.13
514 0.15
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.14
520 0.16
521 0.17
522 0.17
523 0.17
524 0.17
525 0.17
526 0.17
527 0.16
528 0.12
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.08
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.08
546 0.09
547 0.08
548 0.07
549 0.06
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.15
563 0.16
564 0.16
565 0.19
566 0.19
567 0.2
568 0.19
569 0.18
570 0.17
571 0.17
572 0.19
573 0.22
574 0.26
575 0.25
576 0.25
577 0.25
578 0.19
579 0.18
580 0.18
581 0.14
582 0.1
583 0.19
584 0.23
585 0.23
586 0.23
587 0.23
588 0.21
589 0.21
590 0.22
591 0.16
592 0.12
593 0.13
594 0.14
595 0.15
596 0.15
597 0.14
598 0.12
599 0.11
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.1
607 0.11
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.18
613 0.22
614 0.23
615 0.21
616 0.24
617 0.24
618 0.23
619 0.23
620 0.19
621 0.16
622 0.16
623 0.15
624 0.11
625 0.08
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.05
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.13
644 0.15
645 0.18
646 0.18
647 0.18
648 0.2
649 0.22
650 0.23
651 0.2
652 0.19
653 0.15
654 0.14
655 0.14
656 0.12
657 0.1
658 0.07
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.06
664 0.08
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.16
669 0.17
670 0.19
671 0.22
672 0.25
673 0.24
674 0.26
675 0.29
676 0.26
677 0.26
678 0.26
679 0.22
680 0.18
681 0.17
682 0.15
683 0.11
684 0.11
685 0.11
686 0.09
687 0.12
688 0.19
689 0.2
690 0.25
691 0.34
692 0.4
693 0.47
694 0.55
695 0.56
696 0.58
697 0.67
698 0.73
699 0.73
700 0.76
701 0.78
702 0.8
703 0.79
704 0.71
705 0.62
706 0.59
707 0.52
708 0.47
709 0.42
710 0.36
711 0.33
712 0.32
713 0.31
714 0.24
715 0.2
716 0.17
717 0.14
718 0.09
719 0.07
720 0.08
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.04
726 0.05
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.1
734 0.12
735 0.13
736 0.12
737 0.14
738 0.17
739 0.19
740 0.26
741 0.3
742 0.39
743 0.44
744 0.53
745 0.6
746 0.63
747 0.69
748 0.7
749 0.71
750 0.66
751 0.62
752 0.54
753 0.46
754 0.45
755 0.37
756 0.3
757 0.26
758 0.22
759 0.19
760 0.17
761 0.21
762 0.16
763 0.15
764 0.14
765 0.12
766 0.12
767 0.12
768 0.16
769 0.21
770 0.21
771 0.23
772 0.26
773 0.26
774 0.27
775 0.36
776 0.38
777 0.31
778 0.38
779 0.4
780 0.45
781 0.47
782 0.52
783 0.48
784 0.43
785 0.43
786 0.41
787 0.37
788 0.33
789 0.36
790 0.3
791 0.27
792 0.26
793 0.29
794 0.26
795 0.25
796 0.22
797 0.18
798 0.2
799 0.19
800 0.18
801 0.14
802 0.14
803 0.16
804 0.16
805 0.15
806 0.12
807 0.11
808 0.11
809 0.12
810 0.12
811 0.16
812 0.22
813 0.27
814 0.32
815 0.38
816 0.47
817 0.56
818 0.63
819 0.68
820 0.71
821 0.73
822 0.71
823 0.7
824 0.66
825 0.63
826 0.54
827 0.47
828 0.37
829 0.31
830 0.27
831 0.23
832 0.16
833 0.1
834 0.11
835 0.1
836 0.12
837 0.12
838 0.13
839 0.13
840 0.14
841 0.14
842 0.15
843 0.12
844 0.1
845 0.1
846 0.08
847 0.09
848 0.08
849 0.08
850 0.06
851 0.06
852 0.09
853 0.12
854 0.19
855 0.26
856 0.32
857 0.42
858 0.46
859 0.52
860 0.57
861 0.6
862 0.62
863 0.64
864 0.65
865 0.63
866 0.64
867 0.61
868 0.55
869 0.5
870 0.46
871 0.37
872 0.29
873 0.23
874 0.22
875 0.21
876 0.19
877 0.21
878 0.19
879 0.2
880 0.22
881 0.24
882 0.23
883 0.27
884 0.34
885 0.38
886 0.44
887 0.49
888 0.5
889 0.48
890 0.49
891 0.45
892 0.47
893 0.46
894 0.4
895 0.34
896 0.32
897 0.32
898 0.34
899 0.37
900 0.37
901 0.32
902 0.39
903 0.4
904 0.42
905 0.44
906 0.46
907 0.5
908 0.44
909 0.48
910 0.45
911 0.45
912 0.42
913 0.39
914 0.32
915 0.22
916 0.21
917 0.17
918 0.13
919 0.11
920 0.11
921 0.11
922 0.11
923 0.11
924 0.1
925 0.09
926 0.09
927 0.09
928 0.09
929 0.09
930 0.11
931 0.15
932 0.22
933 0.28
934 0.34
935 0.41
936 0.5
937 0.59
938 0.65
939 0.72
940 0.76
941 0.75
942 0.71
943 0.66
944 0.6
945 0.52
946 0.46
947 0.4
948 0.3
949 0.26
950 0.24
951 0.23
952 0.22
953 0.21
954 0.26
955 0.25
956 0.28
957 0.36
958 0.42
959 0.47
960 0.49
961 0.52
962 0.55
963 0.59
964 0.63
965 0.64
966 0.67
967 0.69
968 0.68
969 0.67
970 0.69
971 0.61
972 0.54
973 0.53
974 0.47
975 0.49
976 0.52
977 0.54
978 0.51
979 0.54
980 0.56
981 0.57
982 0.63
983 0.64
984 0.66
985 0.66
986 0.64
987 0.67
988 0.72
989 0.71
990 0.72
991 0.71
992 0.73
993 0.76
994 0.82
995 0.85
996 0.82
997 0.82
998 0.81
999 0.84
1000 0.83
1001 0.83