Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1YCH1

Protein Details
Accession A0A1Y1YCH1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-183TDLDCTPQTPHKRRRKSKTLADIKEHydrophilic
346-373ASMIPGRTQKHVKYKFKREELHNLQRINHydrophilic
383-402VAVVKEKPPVGRKKNPSAERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-174KRRRK
208-229KRGKPTKAFIEKEKAKVERRKR
388-399EKPPVGRKKNPS
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR039467  TFIIIB_B''_Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF15963  Myb_DNA-bind_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSTPNIISIRVDKGQKRFTPTIKQRAARRATLANTPPPESQPDHVEKQPEEELAVKTPIRCAPTKSFQSTLTIEFTPDGQHTTFLSETPLLTSLANNPSFATTTTTTTPTPMHIVPTKPTPVHTPTKGTLISVPSSIAKSPTPDNHEPTHGSVTKHPSTDLDCTPQTPHKRRRKSKTLADIKELEDYDREEQPDYSQVPLYVFCKDTKRGKPTKAFIEKEKAKVERRKRTQQATPPATPESTHGRDGSEPLRESPGPQLQESPYAPQMRVVDGKLVLDDTSLFVEHRQLSNSQGQNLDVVEESAADRYVNSGTYLKRIKSQRWTPQETEMFYQGLAKWGTDFSLVASMIPGRTQKHVKYKFKREELHNLQRINEALLRRNPGVAVVKEKPPVGRKKNPSAER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.63
4 0.65
5 0.66
6 0.7
7 0.74
8 0.76
9 0.76
10 0.78
11 0.77
12 0.8
13 0.79
14 0.72
15 0.68
16 0.64
17 0.58
18 0.6
19 0.58
20 0.56
21 0.53
22 0.52
23 0.49
24 0.44
25 0.46
26 0.4
27 0.38
28 0.37
29 0.4
30 0.42
31 0.43
32 0.46
33 0.41
34 0.43
35 0.43
36 0.35
37 0.3
38 0.28
39 0.27
40 0.24
41 0.28
42 0.24
43 0.22
44 0.25
45 0.28
46 0.28
47 0.29
48 0.32
49 0.36
50 0.44
51 0.51
52 0.52
53 0.51
54 0.48
55 0.51
56 0.47
57 0.42
58 0.36
59 0.29
60 0.24
61 0.22
62 0.21
63 0.18
64 0.16
65 0.16
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.15
81 0.2
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.15
90 0.17
91 0.19
92 0.21
93 0.2
94 0.21
95 0.21
96 0.18
97 0.2
98 0.17
99 0.2
100 0.22
101 0.24
102 0.25
103 0.29
104 0.32
105 0.29
106 0.3
107 0.3
108 0.32
109 0.38
110 0.38
111 0.38
112 0.35
113 0.39
114 0.38
115 0.33
116 0.3
117 0.25
118 0.24
119 0.18
120 0.18
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.21
129 0.28
130 0.31
131 0.35
132 0.35
133 0.37
134 0.37
135 0.35
136 0.37
137 0.32
138 0.29
139 0.3
140 0.35
141 0.34
142 0.33
143 0.31
144 0.26
145 0.26
146 0.29
147 0.26
148 0.23
149 0.21
150 0.21
151 0.24
152 0.29
153 0.35
154 0.4
155 0.49
156 0.55
157 0.66
158 0.75
159 0.82
160 0.86
161 0.86
162 0.86
163 0.86
164 0.86
165 0.79
166 0.73
167 0.66
168 0.56
169 0.51
170 0.41
171 0.31
172 0.21
173 0.2
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.15
192 0.19
193 0.27
194 0.33
195 0.41
196 0.46
197 0.52
198 0.58
199 0.6
200 0.65
201 0.66
202 0.61
203 0.57
204 0.6
205 0.57
206 0.55
207 0.55
208 0.5
209 0.49
210 0.56
211 0.62
212 0.62
213 0.67
214 0.72
215 0.74
216 0.76
217 0.76
218 0.76
219 0.77
220 0.73
221 0.67
222 0.59
223 0.53
224 0.46
225 0.38
226 0.32
227 0.29
228 0.25
229 0.25
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.24
234 0.24
235 0.21
236 0.19
237 0.18
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.25
242 0.27
243 0.24
244 0.24
245 0.26
246 0.23
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.24
253 0.24
254 0.24
255 0.22
256 0.24
257 0.21
258 0.19
259 0.17
260 0.17
261 0.14
262 0.14
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.11
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.19
277 0.27
278 0.29
279 0.27
280 0.26
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.2
285 0.12
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.13
299 0.13
300 0.21
301 0.26
302 0.26
303 0.33
304 0.38
305 0.44
306 0.5
307 0.6
308 0.62
309 0.67
310 0.74
311 0.7
312 0.73
313 0.71
314 0.63
315 0.57
316 0.49
317 0.39
318 0.31
319 0.31
320 0.22
321 0.22
322 0.19
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.13
328 0.13
329 0.09
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.16
338 0.14
339 0.21
340 0.28
341 0.35
342 0.45
343 0.55
344 0.64
345 0.72
346 0.81
347 0.85
348 0.87
349 0.88
350 0.85
351 0.85
352 0.85
353 0.85
354 0.81
355 0.73
356 0.65
357 0.6
358 0.53
359 0.46
360 0.39
361 0.32
362 0.33
363 0.37
364 0.41
365 0.38
366 0.38
367 0.34
368 0.35
369 0.39
370 0.34
371 0.37
372 0.36
373 0.41
374 0.43
375 0.45
376 0.46
377 0.48
378 0.56
379 0.58
380 0.63
381 0.67
382 0.75