Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XQ05

Protein Details
Accession A0A1Y1XQ05    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
453-485QEKHSKKPLFDDKPRSSRKSKRGRGSGKYGREGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-488KHSKKPLFDDKPRSSRKSKRGRGSGKYGREGRLK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 1, cyto 1, golg 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028802  SMG8  
IPR019354  SMG8/SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10220  Smg8_Smg9  
Amino Acid Sequences MDSEPNDNNAEEKKNPEQAYREWFKEFIRQNGIPLDARYTVIAIVDFTSTPFRDTSNSVLRLLQGTEAEDNPINQDSQQRSPPDLERLKVYCDASDCIMYLSITLNLTAQDLSPLAGVKDNSMVEKDILSLLEHQNFRTLLFTFLTSDVVVILNDSRLLTTAITSTLRLLSALKRKIFPLLGHLEEKLFGTDADSSQVEIGQGFSYFIRKVPVLSFVFHGIPSTITTPQFQQNLESRIQLLFRACGMENYDRLYKHDGRQLFFLPPSSLSYSFVHFSSWKVESNPVTDLLSHYFCGFETEKPSWEEAGQDHPNIHFGHVNALRNQLLEWAKKSYELKNKNQRNFAENTVLEIDSWINASAFLFAKIFIPVFNADRKKSVEEVVYRRLKEYIELDRQVSLSHCKQAMNKSIDWYIAGCPPHYTEQLHEHKVKSKRNNSSGTVASKEDNVNRKDQEKHSKKPLFDDKPRSSRKSKRGRGSGKYGREGRLKPNGYLGIEYDNTTNGSPINAQLQRIIIVTPGAPISCVLSPSVKIELDEHTVTIPLCDKEGFVLPKESVVVLRLPYIYYDGQTPISPPTEELKAKFNLAKHFLSTHINEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.49
4 0.5
5 0.51
6 0.58
7 0.58
8 0.55
9 0.49
10 0.49
11 0.45
12 0.49
13 0.49
14 0.47
15 0.49
16 0.45
17 0.46
18 0.47
19 0.49
20 0.42
21 0.37
22 0.33
23 0.26
24 0.26
25 0.23
26 0.2
27 0.16
28 0.14
29 0.13
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.15
39 0.16
40 0.18
41 0.21
42 0.27
43 0.32
44 0.34
45 0.34
46 0.34
47 0.34
48 0.33
49 0.31
50 0.25
51 0.17
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.18
59 0.18
60 0.16
61 0.15
62 0.22
63 0.24
64 0.28
65 0.35
66 0.35
67 0.37
68 0.41
69 0.44
70 0.46
71 0.46
72 0.43
73 0.43
74 0.42
75 0.43
76 0.44
77 0.4
78 0.33
79 0.3
80 0.3
81 0.25
82 0.24
83 0.2
84 0.16
85 0.16
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.16
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.19
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.15
158 0.23
159 0.29
160 0.31
161 0.32
162 0.33
163 0.36
164 0.37
165 0.31
166 0.3
167 0.29
168 0.3
169 0.3
170 0.29
171 0.25
172 0.23
173 0.23
174 0.16
175 0.11
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.19
200 0.18
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.2
205 0.18
206 0.18
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.19
216 0.2
217 0.19
218 0.21
219 0.24
220 0.26
221 0.27
222 0.25
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.17
227 0.13
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.17
237 0.2
238 0.18
239 0.2
240 0.26
241 0.25
242 0.27
243 0.31
244 0.32
245 0.3
246 0.32
247 0.32
248 0.28
249 0.25
250 0.22
251 0.18
252 0.15
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.18
269 0.17
270 0.19
271 0.19
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.19
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.11
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.18
300 0.17
301 0.17
302 0.11
303 0.1
304 0.17
305 0.2
306 0.22
307 0.2
308 0.22
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.21
319 0.24
320 0.26
321 0.33
322 0.39
323 0.47
324 0.56
325 0.64
326 0.67
327 0.71
328 0.66
329 0.6
330 0.56
331 0.49
332 0.46
333 0.37
334 0.33
335 0.28
336 0.26
337 0.21
338 0.18
339 0.15
340 0.08
341 0.09
342 0.07
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.17
359 0.2
360 0.2
361 0.23
362 0.26
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.26
367 0.29
368 0.33
369 0.39
370 0.43
371 0.41
372 0.4
373 0.39
374 0.34
375 0.3
376 0.3
377 0.29
378 0.3
379 0.31
380 0.31
381 0.31
382 0.31
383 0.28
384 0.25
385 0.23
386 0.18
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.26
391 0.33
392 0.4
393 0.39
394 0.38
395 0.36
396 0.36
397 0.35
398 0.31
399 0.25
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.14
404 0.14
405 0.16
406 0.19
407 0.2
408 0.19
409 0.18
410 0.27
411 0.34
412 0.39
413 0.4
414 0.39
415 0.45
416 0.52
417 0.58
418 0.59
419 0.61
420 0.65
421 0.7
422 0.74
423 0.69
424 0.67
425 0.63
426 0.56
427 0.49
428 0.41
429 0.34
430 0.31
431 0.3
432 0.31
433 0.34
434 0.32
435 0.35
436 0.37
437 0.41
438 0.45
439 0.5
440 0.55
441 0.56
442 0.62
443 0.67
444 0.7
445 0.67
446 0.69
447 0.72
448 0.7
449 0.72
450 0.74
451 0.73
452 0.77
453 0.83
454 0.8
455 0.79
456 0.79
457 0.8
458 0.8
459 0.81
460 0.81
461 0.84
462 0.87
463 0.85
464 0.85
465 0.85
466 0.81
467 0.8
468 0.75
469 0.7
470 0.68
471 0.64
472 0.61
473 0.62
474 0.57
475 0.49
476 0.51
477 0.49
478 0.42
479 0.39
480 0.33
481 0.27
482 0.25
483 0.25
484 0.19
485 0.16
486 0.16
487 0.15
488 0.14
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.18
494 0.19
495 0.2
496 0.21
497 0.22
498 0.22
499 0.21
500 0.2
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.13
514 0.14
515 0.16
516 0.2
517 0.18
518 0.17
519 0.19
520 0.21
521 0.24
522 0.24
523 0.21
524 0.18
525 0.19
526 0.18
527 0.18
528 0.18
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.22
535 0.24
536 0.22
537 0.26
538 0.24
539 0.25
540 0.26
541 0.24
542 0.18
543 0.17
544 0.17
545 0.14
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.15
550 0.19
551 0.18
552 0.16
553 0.18
554 0.18
555 0.19
556 0.19
557 0.2
558 0.19
559 0.21
560 0.21
561 0.2
562 0.22
563 0.28
564 0.32
565 0.32
566 0.35
567 0.34
568 0.39
569 0.41
570 0.41
571 0.42
572 0.44
573 0.45
574 0.41
575 0.41
576 0.39
577 0.42
578 0.4