Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X8Z9

Protein Details
Accession A0A1Y1X8Z9    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-314ELSNADSKKRKRQKKSQDPIEAHDHydrophilic
319-342ASEPVQEGKKKKKKQKAVEEILEAHydrophilic
344-369SEPVQVEEPKKKKKKQKVAEKTAISEHydrophilic
375-394QPVKVKASKKPKKQVVTEEAHydrophilic
404-429ATTEEPVKKTSKKSKKQRVVEPEATVHydrophilic
435-455EAPAKKSKKVKAEKEVTPKLAHydrophilic
494-515VASDRKPIKSALKKSKRSVAATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-305KKRKRQKK
326-334GKKKKKKQK
352-362PKKKKKKQKVA
380-386KASKKPK
415-419KKSKK
439-445KKSKKVK
498-510RKPIKSALKKSKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 13.5, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR010301  RRP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05997  Nop52  
Amino Acid Sequences MTTTQPASNSFAKRLAHTDKKIRDKAVKALGKWLSSREDIDQLELLKLWKGLFYCFWMSDKPLIQQQLSNTLATMILSLPEKIAIPFAQAFWEIIVREWNGIDRYRLDKFYLLLRRYVNSTLTLLMNKDWDAELVEQYVEMMKSGVFNPSNLQVPNSVRTHIADLFLEELEKVVPAEKSQEIPMEKVLEPFVHFIARNPNKLVYTRLQENLFQPLSERMQNEEPEQHRYNYASIIELLAELAVDAETTGIKRRRINQFLQAIGGTPDEPQALKDDSTDVEEPESVDDEVVELSNADSKKRKRQKKSQDPIEAHDVAEVASEPVQEGKKKKKKQKAVEEILEAISEPVQVEEPKKKKKKQKVAEKTAISEPVEVAQPVKVKASKKPKKQVVTEEAVEPMVVEEAATTEEPVKKTSKKSKKQRVVEPEATVETPEVEAPAKKSKKVKAEKEVTPKLAEPSTPLSSASKKSVQWGLENNSVKRFKKQLPVSPMPSPVASDRKPIKSALKKSKRSVAATPKSSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.51
4 0.55
5 0.62
6 0.66
7 0.75
8 0.79
9 0.78
10 0.77
11 0.72
12 0.73
13 0.73
14 0.7
15 0.61
16 0.63
17 0.6
18 0.55
19 0.52
20 0.46
21 0.41
22 0.37
23 0.38
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.32
28 0.31
29 0.27
30 0.25
31 0.23
32 0.21
33 0.16
34 0.17
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.16
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.27
46 0.3
47 0.31
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.33
52 0.34
53 0.33
54 0.36
55 0.35
56 0.31
57 0.25
58 0.22
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.12
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.12
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.23
92 0.26
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.25
97 0.32
98 0.37
99 0.34
100 0.35
101 0.35
102 0.35
103 0.36
104 0.38
105 0.3
106 0.24
107 0.23
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.07
131 0.08
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.2
142 0.25
143 0.25
144 0.23
145 0.21
146 0.22
147 0.24
148 0.21
149 0.2
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.18
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.19
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.23
183 0.26
184 0.27
185 0.28
186 0.29
187 0.28
188 0.3
189 0.32
190 0.26
191 0.27
192 0.28
193 0.3
194 0.29
195 0.29
196 0.3
197 0.31
198 0.27
199 0.22
200 0.19
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.2
205 0.17
206 0.21
207 0.22
208 0.23
209 0.26
210 0.26
211 0.3
212 0.31
213 0.29
214 0.26
215 0.26
216 0.25
217 0.2
218 0.19
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.09
236 0.13
237 0.16
238 0.19
239 0.27
240 0.36
241 0.41
242 0.44
243 0.46
244 0.47
245 0.45
246 0.43
247 0.35
248 0.27
249 0.22
250 0.19
251 0.11
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.13
264 0.13
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.16
284 0.2
285 0.31
286 0.41
287 0.51
288 0.57
289 0.68
290 0.78
291 0.83
292 0.9
293 0.89
294 0.9
295 0.83
296 0.76
297 0.72
298 0.62
299 0.5
300 0.39
301 0.29
302 0.18
303 0.16
304 0.12
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.07
310 0.09
311 0.13
312 0.18
313 0.29
314 0.39
315 0.48
316 0.58
317 0.66
318 0.74
319 0.81
320 0.87
321 0.87
322 0.86
323 0.82
324 0.74
325 0.65
326 0.55
327 0.44
328 0.33
329 0.22
330 0.13
331 0.08
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.11
337 0.2
338 0.28
339 0.38
340 0.48
341 0.56
342 0.65
343 0.75
344 0.83
345 0.84
346 0.88
347 0.89
348 0.9
349 0.91
350 0.83
351 0.76
352 0.68
353 0.62
354 0.51
355 0.4
356 0.3
357 0.22
358 0.2
359 0.16
360 0.13
361 0.11
362 0.13
363 0.13
364 0.16
365 0.19
366 0.21
367 0.29
368 0.4
369 0.47
370 0.56
371 0.66
372 0.71
373 0.75
374 0.8
375 0.81
376 0.78
377 0.75
378 0.67
379 0.57
380 0.49
381 0.41
382 0.33
383 0.23
384 0.15
385 0.08
386 0.06
387 0.05
388 0.03
389 0.04
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.09
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.22
398 0.26
399 0.35
400 0.46
401 0.53
402 0.6
403 0.71
404 0.8
405 0.85
406 0.9
407 0.91
408 0.9
409 0.89
410 0.85
411 0.77
412 0.69
413 0.61
414 0.52
415 0.42
416 0.31
417 0.22
418 0.16
419 0.13
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.14
424 0.24
425 0.27
426 0.32
427 0.4
428 0.46
429 0.55
430 0.64
431 0.7
432 0.71
433 0.77
434 0.8
435 0.83
436 0.84
437 0.76
438 0.69
439 0.61
440 0.54
441 0.47
442 0.38
443 0.32
444 0.3
445 0.3
446 0.27
447 0.27
448 0.27
449 0.29
450 0.33
451 0.35
452 0.34
453 0.32
454 0.37
455 0.42
456 0.4
457 0.42
458 0.46
459 0.46
460 0.5
461 0.55
462 0.51
463 0.54
464 0.59
465 0.55
466 0.55
467 0.56
468 0.55
469 0.59
470 0.66
471 0.67
472 0.7
473 0.77
474 0.75
475 0.72
476 0.69
477 0.61
478 0.52
479 0.45
480 0.42
481 0.41
482 0.37
483 0.41
484 0.45
485 0.49
486 0.5
487 0.53
488 0.57
489 0.58
490 0.68
491 0.7
492 0.73
493 0.76
494 0.81
495 0.86
496 0.83
497 0.79
498 0.78
499 0.78
500 0.77