Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z5J4

Protein Details
Accession A0A1Y1Z5J4    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-309QQHGKRESRKEPNHYRNPRTBasic
383-404EQERGKQAKRPSKKHLPRMPGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
386-419RGKQAKRPSKKHLPRMPGSNPQDKQERKKLQEGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSNGTIANGGAETSAPPSSTPQQQPRNPSEAVLVNKGKEPIEQAEPQSLQQTLKQQVEEYFTREKLASDASLVSQMNSELFVPISVVAELEVVKSLTTDMDLLMEVLKESSQLTVDPTGTRVKPNFTVQRNTIVLRDIPPEVSEEEIKGIFSGDGNPAVRSANPDFGNTWFVTFGTEEETLNMLTFIRGRTFQGKPIAGRIKSENILKGFYKPDTNLAIPPAAFASANNPNHPHSYMANTPSLAPDTNPYRSYKYGHYYKTQYPNDKYPIPGTVPRQHEHSDQSSRHSGQQHGKRESRKEPNHYRNPRTEQDHQLHPHNSRHHNHQNHPIYHHRPHYDYKHTQLNQKKGFKDSQELNQSSEPTSSFESDHKHRASQSPKSDTEQERGKQAKRPSKKHLPRMPGSNPQDKQERKKLQEGKIPHSPEKMEPEHKPGSEHFPPLPSKSGSATPTQQDIKPYSSPIAISEIVKSLRPGDFKAANRKSEPGKESSGRDAETSGSLATSSGQKKQNSCQGPKAFDKPQSPESQCKLGTSEINAPSDDDFLPTKSTSVDSNEQKANGSASSVSYAQALGQKQQKKAGAKSATNVKVEKVSDLPTPESDTVVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.16
5 0.21
6 0.3
7 0.39
8 0.46
9 0.55
10 0.61
11 0.7
12 0.71
13 0.72
14 0.63
15 0.55
16 0.5
17 0.47
18 0.45
19 0.45
20 0.41
21 0.37
22 0.4
23 0.41
24 0.36
25 0.31
26 0.31
27 0.27
28 0.3
29 0.33
30 0.32
31 0.37
32 0.38
33 0.37
34 0.35
35 0.33
36 0.28
37 0.27
38 0.33
39 0.32
40 0.35
41 0.35
42 0.34
43 0.36
44 0.4
45 0.38
46 0.36
47 0.34
48 0.31
49 0.32
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.25
54 0.2
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.21
106 0.21
107 0.27
108 0.26
109 0.28
110 0.31
111 0.4
112 0.46
113 0.46
114 0.52
115 0.48
116 0.54
117 0.52
118 0.49
119 0.41
120 0.35
121 0.31
122 0.26
123 0.27
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.27
155 0.22
156 0.2
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.07
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.18
178 0.2
179 0.24
180 0.3
181 0.32
182 0.31
183 0.38
184 0.44
185 0.38
186 0.39
187 0.37
188 0.35
189 0.35
190 0.37
191 0.33
192 0.27
193 0.29
194 0.27
195 0.27
196 0.25
197 0.24
198 0.24
199 0.2
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.22
204 0.21
205 0.21
206 0.17
207 0.17
208 0.13
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.11
213 0.18
214 0.19
215 0.21
216 0.22
217 0.24
218 0.26
219 0.27
220 0.24
221 0.16
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.14
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.28
240 0.28
241 0.32
242 0.36
243 0.38
244 0.41
245 0.43
246 0.48
247 0.55
248 0.56
249 0.56
250 0.53
251 0.56
252 0.55
253 0.51
254 0.45
255 0.36
256 0.33
257 0.28
258 0.29
259 0.28
260 0.31
261 0.34
262 0.33
263 0.36
264 0.35
265 0.35
266 0.35
267 0.35
268 0.34
269 0.3
270 0.34
271 0.34
272 0.34
273 0.35
274 0.34
275 0.34
276 0.35
277 0.42
278 0.47
279 0.49
280 0.53
281 0.54
282 0.58
283 0.61
284 0.63
285 0.62
286 0.63
287 0.67
288 0.72
289 0.78
290 0.8
291 0.77
292 0.74
293 0.74
294 0.7
295 0.66
296 0.61
297 0.58
298 0.54
299 0.55
300 0.5
301 0.49
302 0.47
303 0.44
304 0.44
305 0.43
306 0.46
307 0.42
308 0.49
309 0.53
310 0.56
311 0.57
312 0.62
313 0.63
314 0.58
315 0.59
316 0.58
317 0.55
318 0.53
319 0.54
320 0.46
321 0.42
322 0.45
323 0.48
324 0.49
325 0.46
326 0.45
327 0.49
328 0.48
329 0.53
330 0.54
331 0.57
332 0.57
333 0.6
334 0.57
335 0.52
336 0.54
337 0.48
338 0.47
339 0.41
340 0.41
341 0.43
342 0.42
343 0.4
344 0.38
345 0.37
346 0.32
347 0.29
348 0.21
349 0.14
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.18
355 0.21
356 0.28
357 0.28
358 0.28
359 0.29
360 0.35
361 0.4
362 0.44
363 0.48
364 0.48
365 0.49
366 0.5
367 0.56
368 0.51
369 0.5
370 0.49
371 0.42
372 0.44
373 0.47
374 0.46
375 0.45
376 0.51
377 0.55
378 0.58
379 0.64
380 0.66
381 0.72
382 0.78
383 0.82
384 0.82
385 0.81
386 0.76
387 0.77
388 0.73
389 0.72
390 0.69
391 0.67
392 0.6
393 0.55
394 0.59
395 0.56
396 0.58
397 0.59
398 0.62
399 0.57
400 0.66
401 0.71
402 0.69
403 0.71
404 0.68
405 0.64
406 0.63
407 0.64
408 0.57
409 0.52
410 0.47
411 0.43
412 0.44
413 0.44
414 0.41
415 0.39
416 0.43
417 0.45
418 0.43
419 0.42
420 0.36
421 0.39
422 0.37
423 0.38
424 0.31
425 0.32
426 0.34
427 0.34
428 0.36
429 0.29
430 0.27
431 0.26
432 0.29
433 0.26
434 0.28
435 0.29
436 0.27
437 0.31
438 0.32
439 0.31
440 0.31
441 0.32
442 0.32
443 0.3
444 0.3
445 0.26
446 0.24
447 0.23
448 0.2
449 0.21
450 0.18
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.16
458 0.18
459 0.2
460 0.2
461 0.24
462 0.3
463 0.35
464 0.46
465 0.49
466 0.5
467 0.5
468 0.53
469 0.53
470 0.54
471 0.52
472 0.46
473 0.47
474 0.46
475 0.48
476 0.5
477 0.47
478 0.4
479 0.36
480 0.32
481 0.27
482 0.23
483 0.2
484 0.13
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.09
489 0.15
490 0.16
491 0.23
492 0.3
493 0.34
494 0.38
495 0.45
496 0.53
497 0.55
498 0.58
499 0.61
500 0.61
501 0.63
502 0.66
503 0.66
504 0.63
505 0.61
506 0.62
507 0.58
508 0.58
509 0.61
510 0.6
511 0.62
512 0.6
513 0.6
514 0.54
515 0.49
516 0.45
517 0.39
518 0.37
519 0.33
520 0.36
521 0.33
522 0.34
523 0.33
524 0.31
525 0.28
526 0.28
527 0.24
528 0.18
529 0.15
530 0.15
531 0.18
532 0.17
533 0.17
534 0.15
535 0.17
536 0.17
537 0.22
538 0.29
539 0.32
540 0.38
541 0.41
542 0.4
543 0.4
544 0.39
545 0.34
546 0.26
547 0.22
548 0.16
549 0.14
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.18
557 0.18
558 0.22
559 0.3
560 0.36
561 0.39
562 0.46
563 0.51
564 0.53
565 0.57
566 0.61
567 0.61
568 0.58
569 0.62
570 0.65
571 0.65
572 0.62
573 0.57
574 0.5
575 0.47
576 0.44
577 0.41
578 0.33
579 0.3
580 0.3
581 0.33
582 0.34
583 0.3
584 0.35
585 0.32