Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PHE2

Protein Details
Accession B8PHE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-440DDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-446RGRGRGRNRYPPGRDGGGRRDDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGRDDRGPWA
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_105562  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSSRGFKIPSTLAQDLQIISGLIGDITPSKPPTPPRVPPRDDGPDSDTDSEREVEEDILGGVDDEESPSTTAPPSVSATDSGSSSDSDVDSHDSDSDEKAKKAPPTSGKLEMLLDDEDETGPAVTSEAQTRTKNEIPETEAKVIIPDIEEVGSDEVLEKVGEVMSIFDKVVIVKGSASEYTNRASERALDSDTLLVFEDRKVLGYIYETFGPTSQPLYQIKFNEKYPLNPERVQLSRPVFHVPQRSNFVFVGQLRRLKGSDASNVYDEEPADEELDFSDDEAEAAHKRALTERRRGQSVTSSRHATPTPSQMRDQDMADDSYGANPYDTSGPYNDMDFGAGPSRPAPIPYDDPYSDSYGVDDAQLPSVEGESRSPVTSRRREDDDDASIDGHINDRGRGRGRNRYPPGRDGGGRRDDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGRDDRGPWAGHERGRQPSSFSDAQDAPAPRPLSPTSLAIARATGQYADGTAVGSDAQSQASGWSHPQYTADQQYNFSFGYQNQYVQPHINPRFASNFGMNFGFQQGNQYMPYGYNGVGYSGGGNPSWDQEYSRNTGAQRLNNGGGSPRTEEPTGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.28
4 0.23
5 0.14
6 0.11
7 0.1
8 0.08
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.12
15 0.15
16 0.17
17 0.21
18 0.28
19 0.38
20 0.45
21 0.53
22 0.6
23 0.68
24 0.72
25 0.72
26 0.74
27 0.74
28 0.68
29 0.63
30 0.57
31 0.52
32 0.51
33 0.5
34 0.42
35 0.33
36 0.33
37 0.29
38 0.24
39 0.19
40 0.16
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.17
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.26
87 0.31
88 0.35
89 0.37
90 0.43
91 0.43
92 0.47
93 0.52
94 0.55
95 0.51
96 0.47
97 0.44
98 0.37
99 0.31
100 0.25
101 0.19
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.1
114 0.14
115 0.19
116 0.21
117 0.24
118 0.31
119 0.34
120 0.36
121 0.35
122 0.35
123 0.36
124 0.42
125 0.43
126 0.39
127 0.35
128 0.32
129 0.3
130 0.26
131 0.2
132 0.14
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.17
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.14
203 0.16
204 0.19
205 0.23
206 0.25
207 0.31
208 0.32
209 0.32
210 0.35
211 0.33
212 0.34
213 0.37
214 0.4
215 0.39
216 0.37
217 0.38
218 0.35
219 0.36
220 0.33
221 0.33
222 0.3
223 0.27
224 0.26
225 0.29
226 0.26
227 0.29
228 0.36
229 0.32
230 0.34
231 0.38
232 0.37
233 0.35
234 0.34
235 0.3
236 0.26
237 0.25
238 0.26
239 0.23
240 0.26
241 0.24
242 0.25
243 0.25
244 0.22
245 0.25
246 0.21
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.24
252 0.23
253 0.2
254 0.17
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.13
276 0.21
277 0.26
278 0.34
279 0.41
280 0.43
281 0.45
282 0.45
283 0.41
284 0.42
285 0.44
286 0.4
287 0.37
288 0.37
289 0.35
290 0.37
291 0.36
292 0.3
293 0.25
294 0.29
295 0.32
296 0.31
297 0.32
298 0.32
299 0.35
300 0.33
301 0.31
302 0.23
303 0.19
304 0.17
305 0.15
306 0.14
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.17
336 0.19
337 0.24
338 0.22
339 0.25
340 0.26
341 0.27
342 0.24
343 0.19
344 0.17
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.16
363 0.24
364 0.32
365 0.36
366 0.39
367 0.43
368 0.46
369 0.5
370 0.49
371 0.44
372 0.38
373 0.34
374 0.29
375 0.24
376 0.21
377 0.16
378 0.12
379 0.1
380 0.09
381 0.11
382 0.12
383 0.16
384 0.19
385 0.26
386 0.3
387 0.39
388 0.45
389 0.54
390 0.6
391 0.66
392 0.67
393 0.65
394 0.65
395 0.58
396 0.55
397 0.49
398 0.5
399 0.49
400 0.46
401 0.44
402 0.44
403 0.45
404 0.47
405 0.51
406 0.5
407 0.49
408 0.54
409 0.6
410 0.63
411 0.69
412 0.72
413 0.74
414 0.77
415 0.79
416 0.81
417 0.82
418 0.82
419 0.82
420 0.82
421 0.8
422 0.78
423 0.76
424 0.77
425 0.74
426 0.74
427 0.66
428 0.64
429 0.6
430 0.53
431 0.46
432 0.43
433 0.42
434 0.37
435 0.39
436 0.37
437 0.42
438 0.43
439 0.42
440 0.38
441 0.36
442 0.4
443 0.37
444 0.33
445 0.3
446 0.28
447 0.29
448 0.32
449 0.3
450 0.25
451 0.28
452 0.28
453 0.23
454 0.26
455 0.26
456 0.24
457 0.25
458 0.25
459 0.21
460 0.22
461 0.23
462 0.19
463 0.19
464 0.16
465 0.15
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.08
484 0.09
485 0.1
486 0.12
487 0.15
488 0.15
489 0.16
490 0.18
491 0.2
492 0.25
493 0.32
494 0.35
495 0.33
496 0.35
497 0.36
498 0.36
499 0.33
500 0.27
501 0.22
502 0.17
503 0.24
504 0.22
505 0.24
506 0.25
507 0.27
508 0.28
509 0.3
510 0.33
511 0.35
512 0.38
513 0.41
514 0.38
515 0.4
516 0.42
517 0.41
518 0.41
519 0.35
520 0.32
521 0.29
522 0.29
523 0.26
524 0.22
525 0.23
526 0.2
527 0.16
528 0.2
529 0.18
530 0.19
531 0.19
532 0.19
533 0.17
534 0.17
535 0.19
536 0.15
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.14
541 0.14
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.15
550 0.17
551 0.16
552 0.17
553 0.21
554 0.27
555 0.31
556 0.34
557 0.34
558 0.33
559 0.4
560 0.44
561 0.45
562 0.45
563 0.45
564 0.45
565 0.42
566 0.43
567 0.39
568 0.35
569 0.32
570 0.31
571 0.28
572 0.29