Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PDY8

Protein Details
Accession B8PDY8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61LVHARARRRFQRGLKRRPMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-74RARRRFQRGLKRRPMGLIKKLRKAKKEAL
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, mito_nucl 9.666, nucl 9.5, cyto 9, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002222  Ribosomal_S19  
IPR023575  Ribosomal_S19_S15_SF  
IPR005713  Ribosomal_S19A/S15e  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_95913  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00203  Ribosomal_S19  
Amino Acid Sequences MADSGVTDPALAAELKKKRTFRTFSYRGVELDKLLDLGNDELVHARARRRFQRGLKRRPMGLIKKLRKAKKEALPNEKPPVVKTHLRDMIIVPEMIGSVVGIYNGKVFNSVEIKPEMTGHYLAEFSCSYRPVKHGRPGIGATHYIRTLRESTIELASENEPMQLSSSLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.28
3 0.35
4 0.4
5 0.46
6 0.55
7 0.6
8 0.61
9 0.65
10 0.65
11 0.67
12 0.68
13 0.62
14 0.54
15 0.52
16 0.45
17 0.34
18 0.29
19 0.21
20 0.16
21 0.14
22 0.13
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.11
31 0.12
32 0.16
33 0.2
34 0.28
35 0.35
36 0.42
37 0.49
38 0.57
39 0.66
40 0.72
41 0.78
42 0.81
43 0.77
44 0.72
45 0.69
46 0.69
47 0.65
48 0.64
49 0.64
50 0.6
51 0.64
52 0.71
53 0.71
54 0.67
55 0.66
56 0.65
57 0.62
58 0.66
59 0.65
60 0.67
61 0.68
62 0.68
63 0.65
64 0.59
65 0.52
66 0.42
67 0.38
68 0.33
69 0.31
70 0.29
71 0.32
72 0.34
73 0.34
74 0.33
75 0.29
76 0.27
77 0.24
78 0.21
79 0.13
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.03
85 0.02
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.09
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.16
117 0.21
118 0.26
119 0.33
120 0.4
121 0.45
122 0.46
123 0.5
124 0.5
125 0.5
126 0.45
127 0.41
128 0.35
129 0.32
130 0.3
131 0.26
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.21
139 0.23
140 0.23
141 0.19
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.14