Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XA87

Protein Details
Accession A0A1Y1XA87    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
547-574LEKDREFRAKRRQKEKEKKAEKRKLEGPBasic
759-778SDPSKKKKPNPSQEVANQKTHydrophilic
851-874ADPLKLVDRKKERKQNADEKSRIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
541-571EKREKRLEKDREFRAKRRQKEKEKKAEKRKL
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSVSSDSSSSDEMEIQEFELDPGLEKKVSELREQLGGNPHQYELHVEYINTLRSLSVFEELKEAREKMHQYFPLTESLWLEWLQDEIAVAVDVEEKERVLTLFEKAVDDYLSIEIWLRYINYMTEEYKAMDGSSSEALQTVFHLDKVREVYHRAVNATGHHYKLSHVIWNPFKDFEMGLLESNHSVVQYNRVKELYLKRISTPHEDLENTFAQYSTLVTNYSNQDYEAEMIAANSIYTKAMNLCTQLEQYEAAIAQNANDLSSYRAYIEYLKKNKEIDVFYVKTTYERALQIHCLDPTLWDEYIVYLLGHFRIQSVVPKVCERSVRNCPWSGDLWSHVVRTTESFRGVEIDINAIVEKSLQSGLLQSNIEELMKLSFGYCDFIRHRFQQNKDAESLRNGFLYILQTITNAFPDGDPYCRVEYNWINTETRIVEDIVKARKLWDSLIKRKGGESDVWLRYIEFEKQHNAVSKVQSIFKQACQKQMDWPERIFEAWLSFEHEAGSIESLELAYSRIMQQRKILQQREEQTRLIEADALQRESEKREKRLEKDREFRAKRRQKEKEKKAEKRKLEGPMAEDKPDEHDENSASKKQKLSKTRKDDFTLFVSNLNPDTDEVELAEFFKDCGSVVDVRIVKDKEGASKGYAYVEFASEEQAQTAQSKDGHTLNGRDISTHVSPEKTSDPKTIFVCNFSRTIEENWIRELFKSFGEIEEIRMPLTKEGRSRCFAYVQFKHSQSAESAVSLNGQEFEPGKPLSVAISDPSKKKKPNPSQEVANQKTLFVANFPLKTTKEELESLFQQYGALQEVRIVPNEDGKSKGCGFVEYQDENCARTALSLNEYNFNGRHITVTVADPLKLVDRKKERKQNADEKSRIESHSVYVKGLSEQTTIVTLRAEFKKYGNIRNARLIPEKNAAIVEYFEESDVGKAVLGLNETVIDGQTIHVEPSNSDLAKLSNQIPKPSPAMPVPTALLPRRIQRPATKLSTQKPRVVAKAHPLASPPTTSSSATSSKSNSDFRDLFLASRQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.18
14 0.23
15 0.26
16 0.29
17 0.31
18 0.31
19 0.37
20 0.37
21 0.38
22 0.4
23 0.41
24 0.39
25 0.36
26 0.34
27 0.29
28 0.29
29 0.29
30 0.24
31 0.26
32 0.24
33 0.22
34 0.24
35 0.27
36 0.29
37 0.24
38 0.2
39 0.15
40 0.15
41 0.17
42 0.15
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.23
47 0.24
48 0.27
49 0.3
50 0.29
51 0.25
52 0.32
53 0.36
54 0.34
55 0.43
56 0.44
57 0.43
58 0.47
59 0.47
60 0.45
61 0.42
62 0.39
63 0.31
64 0.28
65 0.26
66 0.21
67 0.2
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.09
72 0.08
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.19
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.18
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.11
129 0.13
130 0.17
131 0.16
132 0.2
133 0.25
134 0.27
135 0.25
136 0.29
137 0.32
138 0.34
139 0.37
140 0.34
141 0.31
142 0.3
143 0.31
144 0.34
145 0.33
146 0.29
147 0.27
148 0.26
149 0.25
150 0.29
151 0.28
152 0.27
153 0.27
154 0.34
155 0.4
156 0.44
157 0.45
158 0.4
159 0.39
160 0.34
161 0.29
162 0.23
163 0.21
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.18
175 0.23
176 0.25
177 0.28
178 0.28
179 0.29
180 0.35
181 0.43
182 0.43
183 0.43
184 0.43
185 0.42
186 0.48
187 0.51
188 0.52
189 0.47
190 0.41
191 0.39
192 0.38
193 0.37
194 0.36
195 0.34
196 0.27
197 0.23
198 0.19
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.13
207 0.17
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.14
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.17
255 0.24
256 0.31
257 0.38
258 0.41
259 0.44
260 0.44
261 0.47
262 0.46
263 0.41
264 0.37
265 0.38
266 0.36
267 0.33
268 0.34
269 0.3
270 0.26
271 0.25
272 0.21
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.22
278 0.23
279 0.25
280 0.23
281 0.2
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.08
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.13
302 0.18
303 0.21
304 0.22
305 0.25
306 0.27
307 0.29
308 0.35
309 0.33
310 0.35
311 0.42
312 0.47
313 0.49
314 0.5
315 0.48
316 0.45
317 0.43
318 0.38
319 0.3
320 0.25
321 0.25
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.18
326 0.16
327 0.17
328 0.19
329 0.17
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.13
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.08
358 0.08
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.12
368 0.14
369 0.19
370 0.22
371 0.27
372 0.35
373 0.4
374 0.44
375 0.48
376 0.51
377 0.5
378 0.5
379 0.47
380 0.4
381 0.36
382 0.35
383 0.27
384 0.22
385 0.19
386 0.16
387 0.14
388 0.15
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.18
408 0.2
409 0.24
410 0.27
411 0.27
412 0.25
413 0.25
414 0.27
415 0.22
416 0.19
417 0.15
418 0.11
419 0.1
420 0.11
421 0.16
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.18
427 0.17
428 0.18
429 0.23
430 0.28
431 0.36
432 0.42
433 0.43
434 0.42
435 0.42
436 0.42
437 0.35
438 0.28
439 0.24
440 0.26
441 0.25
442 0.25
443 0.24
444 0.22
445 0.21
446 0.22
447 0.2
448 0.14
449 0.15
450 0.17
451 0.18
452 0.21
453 0.23
454 0.24
455 0.24
456 0.24
457 0.26
458 0.25
459 0.26
460 0.24
461 0.25
462 0.24
463 0.25
464 0.32
465 0.3
466 0.36
467 0.37
468 0.36
469 0.39
470 0.46
471 0.48
472 0.41
473 0.4
474 0.33
475 0.31
476 0.3
477 0.24
478 0.15
479 0.1
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.03
498 0.04
499 0.06
500 0.11
501 0.12
502 0.13
503 0.17
504 0.23
505 0.31
506 0.39
507 0.41
508 0.39
509 0.44
510 0.51
511 0.55
512 0.52
513 0.44
514 0.37
515 0.33
516 0.3
517 0.25
518 0.18
519 0.11
520 0.13
521 0.14
522 0.13
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.16
527 0.24
528 0.24
529 0.27
530 0.36
531 0.42
532 0.47
533 0.57
534 0.64
535 0.64
536 0.68
537 0.72
538 0.74
539 0.73
540 0.74
541 0.75
542 0.74
543 0.74
544 0.77
545 0.78
546 0.79
547 0.85
548 0.88
549 0.88
550 0.91
551 0.92
552 0.92
553 0.91
554 0.85
555 0.81
556 0.76
557 0.72
558 0.66
559 0.57
560 0.49
561 0.49
562 0.45
563 0.39
564 0.32
565 0.25
566 0.25
567 0.26
568 0.23
569 0.15
570 0.15
571 0.15
572 0.19
573 0.22
574 0.23
575 0.22
576 0.24
577 0.28
578 0.33
579 0.4
580 0.47
581 0.55
582 0.6
583 0.68
584 0.73
585 0.75
586 0.72
587 0.67
588 0.59
589 0.54
590 0.47
591 0.37
592 0.3
593 0.25
594 0.21
595 0.19
596 0.16
597 0.12
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.14
617 0.16
618 0.16
619 0.22
620 0.21
621 0.19
622 0.22
623 0.23
624 0.22
625 0.23
626 0.24
627 0.19
628 0.2
629 0.2
630 0.18
631 0.18
632 0.14
633 0.12
634 0.11
635 0.1
636 0.09
637 0.12
638 0.1
639 0.1
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.1
645 0.09
646 0.1
647 0.11
648 0.13
649 0.14
650 0.16
651 0.18
652 0.19
653 0.19
654 0.23
655 0.22
656 0.2
657 0.19
658 0.22
659 0.2
660 0.21
661 0.19
662 0.16
663 0.16
664 0.18
665 0.23
666 0.22
667 0.24
668 0.27
669 0.28
670 0.31
671 0.33
672 0.36
673 0.31
674 0.32
675 0.32
676 0.28
677 0.28
678 0.25
679 0.25
680 0.21
681 0.23
682 0.27
683 0.28
684 0.27
685 0.29
686 0.3
687 0.28
688 0.26
689 0.27
690 0.19
691 0.16
692 0.17
693 0.15
694 0.13
695 0.17
696 0.16
697 0.16
698 0.18
699 0.18
700 0.16
701 0.17
702 0.17
703 0.16
704 0.2
705 0.2
706 0.23
707 0.29
708 0.34
709 0.36
710 0.39
711 0.38
712 0.39
713 0.4
714 0.43
715 0.43
716 0.43
717 0.46
718 0.44
719 0.45
720 0.4
721 0.37
722 0.29
723 0.27
724 0.22
725 0.16
726 0.15
727 0.13
728 0.13
729 0.12
730 0.12
731 0.09
732 0.08
733 0.09
734 0.09
735 0.1
736 0.12
737 0.12
738 0.13
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.09
745 0.17
746 0.2
747 0.25
748 0.33
749 0.4
750 0.45
751 0.53
752 0.62
753 0.65
754 0.73
755 0.77
756 0.75
757 0.76
758 0.78
759 0.8
760 0.73
761 0.69
762 0.58
763 0.49
764 0.44
765 0.37
766 0.29
767 0.19
768 0.21
769 0.18
770 0.18
771 0.2
772 0.23
773 0.23
774 0.26
775 0.29
776 0.26
777 0.25
778 0.26
779 0.27
780 0.28
781 0.29
782 0.28
783 0.25
784 0.22
785 0.19
786 0.17
787 0.16
788 0.14
789 0.12
790 0.09
791 0.11
792 0.15
793 0.16
794 0.18
795 0.19
796 0.16
797 0.23
798 0.26
799 0.25
800 0.24
801 0.24
802 0.28
803 0.26
804 0.29
805 0.22
806 0.22
807 0.22
808 0.24
809 0.29
810 0.26
811 0.26
812 0.28
813 0.28
814 0.28
815 0.26
816 0.22
817 0.15
818 0.14
819 0.16
820 0.13
821 0.17
822 0.2
823 0.21
824 0.25
825 0.26
826 0.27
827 0.25
828 0.24
829 0.22
830 0.17
831 0.17
832 0.14
833 0.15
834 0.14
835 0.15
836 0.2
837 0.19
838 0.19
839 0.17
840 0.17
841 0.22
842 0.24
843 0.24
844 0.28
845 0.38
846 0.48
847 0.58
848 0.68
849 0.71
850 0.77
851 0.86
852 0.86
853 0.86
854 0.87
855 0.81
856 0.74
857 0.71
858 0.66
859 0.57
860 0.5
861 0.4
862 0.34
863 0.37
864 0.34
865 0.29
866 0.25
867 0.25
868 0.23
869 0.25
870 0.23
871 0.16
872 0.15
873 0.15
874 0.17
875 0.16
876 0.15
877 0.13
878 0.12
879 0.19
880 0.23
881 0.25
882 0.24
883 0.25
884 0.34
885 0.39
886 0.47
887 0.49
888 0.52
889 0.53
890 0.61
891 0.63
892 0.6
893 0.62
894 0.56
895 0.52
896 0.51
897 0.47
898 0.39
899 0.35
900 0.3
901 0.23
902 0.21
903 0.17
904 0.13
905 0.13
906 0.12
907 0.12
908 0.11
909 0.11
910 0.11
911 0.09
912 0.07
913 0.07
914 0.08
915 0.09
916 0.1
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.09
921 0.09
922 0.08
923 0.07
924 0.06
925 0.06
926 0.09
927 0.1
928 0.1
929 0.12
930 0.13
931 0.13
932 0.17
933 0.23
934 0.2
935 0.2
936 0.2
937 0.2
938 0.22
939 0.26
940 0.27
941 0.29
942 0.32
943 0.37
944 0.4
945 0.42
946 0.43
947 0.42
948 0.41
949 0.37
950 0.4
951 0.36
952 0.35
953 0.33
954 0.32
955 0.36
956 0.34
957 0.37
958 0.34
959 0.39
960 0.45
961 0.48
962 0.51
963 0.54
964 0.59
965 0.61
966 0.65
967 0.66
968 0.66
969 0.7
970 0.74
971 0.72
972 0.71
973 0.7
974 0.69
975 0.68
976 0.64
977 0.61
978 0.6
979 0.63
980 0.59
981 0.53
982 0.48
983 0.47
984 0.45
985 0.41
986 0.34
987 0.29
988 0.3
989 0.29
990 0.29
991 0.3
992 0.32
993 0.31
994 0.33
995 0.31
996 0.34
997 0.39
998 0.43
999 0.41
1000 0.45
1001 0.43
1002 0.42
1003 0.46
1004 0.4
1005 0.36