Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YND0

Protein Details
Accession A0A1Y1YND0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-85SKQPAKKQKVNAKPANSPRQAHydrophilic
300-357KNPVKNTDKSKKDAKKPRAKMVKPKTQQEGERAVKEKKPRVRARTQAWKKTGKKPAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-89KATKKEAEKRKEPEAEEGSKQPAKKQKVNAKPANSPRQADKKA
302-357PVKNTDKSKKDAKKPRAKMVKPKTQQEGERAVKEKKPRVRARTQAWKKTGKKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 10, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MSNYVPGQLTQSLLGGGKIDSKLDDLFKNSAGASALPPPVLVTREIKATKKEAEKRKEPEAEEGSKQPAKKQKVNAKPANSPRQADKKAPLEQKDEAKPAVKEDDPEKIARTIFVGNLSVSVINKAEYKQLKTRFAEFGEIESIRFRSVAFAELMPRKAAFINKNLHPERNSVNAYIVYKEKASAEAALKSNGTMFLERHLRVDKSDNTGSQDRKTSVFVGNLAFDADEEDLWKYFSQCGEVINVRIIRDKTTNVGKGFGYVQFKERPAVGLALKLHESKMGSRKLRVFRCSETDMVKGKNPVKNTDKSKKDAKKPRAKMVKPKTQQEGERAVKEKKPRVRARTQAWKKTGKKPAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.11
3 0.11
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.18
10 0.21
11 0.23
12 0.22
13 0.24
14 0.24
15 0.25
16 0.22
17 0.21
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.17
31 0.25
32 0.29
33 0.32
34 0.34
35 0.38
36 0.43
37 0.5
38 0.58
39 0.6
40 0.66
41 0.71
42 0.72
43 0.77
44 0.76
45 0.68
46 0.68
47 0.65
48 0.61
49 0.55
50 0.52
51 0.49
52 0.45
53 0.43
54 0.41
55 0.43
56 0.46
57 0.5
58 0.57
59 0.6
60 0.67
61 0.78
62 0.79
63 0.76
64 0.78
65 0.8
66 0.81
67 0.75
68 0.67
69 0.65
70 0.66
71 0.64
72 0.6
73 0.58
74 0.55
75 0.59
76 0.64
77 0.6
78 0.55
79 0.55
80 0.58
81 0.55
82 0.51
83 0.44
84 0.41
85 0.37
86 0.34
87 0.34
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.29
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.24
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.16
114 0.18
115 0.23
116 0.29
117 0.35
118 0.42
119 0.43
120 0.46
121 0.42
122 0.4
123 0.4
124 0.33
125 0.28
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.14
140 0.17
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.19
147 0.17
148 0.21
149 0.26
150 0.29
151 0.38
152 0.39
153 0.4
154 0.37
155 0.37
156 0.33
157 0.33
158 0.31
159 0.23
160 0.23
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.17
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.1
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.2
188 0.19
189 0.2
190 0.26
191 0.25
192 0.26
193 0.28
194 0.27
195 0.29
196 0.34
197 0.34
198 0.31
199 0.32
200 0.27
201 0.26
202 0.27
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.2
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.1
212 0.07
213 0.08
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.22
234 0.22
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.23
239 0.29
240 0.34
241 0.3
242 0.32
243 0.28
244 0.28
245 0.28
246 0.28
247 0.26
248 0.21
249 0.24
250 0.26
251 0.27
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.2
256 0.22
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.27
268 0.33
269 0.35
270 0.4
271 0.48
272 0.55
273 0.62
274 0.61
275 0.59
276 0.55
277 0.59
278 0.57
279 0.53
280 0.47
281 0.45
282 0.44
283 0.41
284 0.4
285 0.41
286 0.43
287 0.44
288 0.44
289 0.47
290 0.49
291 0.55
292 0.61
293 0.64
294 0.64
295 0.66
296 0.73
297 0.74
298 0.78
299 0.8
300 0.81
301 0.82
302 0.84
303 0.89
304 0.89
305 0.88
306 0.88
307 0.88
308 0.88
309 0.85
310 0.85
311 0.83
312 0.8
313 0.77
314 0.73
315 0.73
316 0.68
317 0.67
318 0.64
319 0.61
320 0.59
321 0.64
322 0.66
323 0.65
324 0.69
325 0.72
326 0.75
327 0.8
328 0.84
329 0.85
330 0.87
331 0.89
332 0.88
333 0.86
334 0.88
335 0.85
336 0.85
337 0.86