Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XYZ0

Protein Details
Accession A0A1Y1XYZ0    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-57YSTLGVLRDHKPKNKPKGNQKPRPKAKNLPNKGGDLHydrophilic
84-107SQSPNIKTRKTNARKDKKGLSGLGHydrophilic
119-147PVLNEKDTTKTPKKKKKASTEKNMQEDLHHydrophilic
185-213SQSRAAQSKTPKKGKQTPLKSNSKKSLDKHydrophilic
264-292EKEGNRSKKNETKTPRKQIRQKKEAGSSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-53HKPKNKPKGNQKPRPKAKNLPNK
130-135PKKKKK
193-205KTPKKGKQTPLKS
244-289RGAPRKKSASKPAEDLATKAEKEGNRSKKNETKTPRKQIRQKKEAG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041505  Dis3_CSD2  
IPR028591  DIS3L2  
IPR041093  Dis3l2_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR001900  RNase_II/R  
IPR022966  RNase_II/R_CS  
IPR033770  RRP44_S1  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:1990074  P:polyuridylation-dependent mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF17877  Dis3l2_C_term  
PF17849  OB_Dis3  
PF00773  RNB  
PF17215  Rrp44_S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01175  RIBONUCLEASE_II  
Amino Acid Sequences MPLFDSPNTLSFSSNELEVIDYSTLGVLRDHKPKNKPKGNQKPRPKAKNLPNKGGDLKDSKEFNEDHHAVPFDYSTLNSQTSLSQSPNIKTRKTNARKDKKGLSGLGTNVAGLTNDTIPVLNEKDTTKTPKKKKKASTEKNMQEDLHEVEDLAQSMSKIDIAAKPNSSGQQTSELPTKLPSKPESQSRAAQSKTPKKGKQTPLKSNSKKSLDKPSASSISEKLKAEAAMEVDGAEVIVKGESSRGAPRKKSASKPAEDLATKAEKEGNRSKKNETKTPRKQIRQKKEAGSSQTPKAARNEESSSKPVADKPSATVQKHKQRSVYEKYLTTKELAAGLSQNTIYRGKLRINKRNRSDAYVISDAFDNDIYIWGTNLRNRALEGDSVAVTLLEGRKLEDVKEQRAKHAEKRGRQLNDEDGGKLQYGEVVYIYERANGNQYSGTLVLQRPNEASSQHKKELKFVWFIPTDKRVPYIIIPIRNVPKDFIADPEAYSNQLLVASIHDWPVHSMHPFGKVVRKIGSIGNLAAETEALLADNNVRTEDFGPKVKECLPKLPWSIPKSEFKVRRDLRRERVFTIDPASAKDLDDAVSCRRLPDGNLEIGVHIADVTYFVKPGTALDREARLRATTVYLVEKAIPMLPHILCQELCSLNPGVDRLAFSVMWKMSPQAEVLDVWFGRTVINSCCRLAYEQAQEVILGKPLDPSITLYGQPKDEIETDIKTFYQLSQIMRTRRFESGALSINSIRLHFELNSDGIPTSCNVYDIKDSNRLIEEFMLLANISVAEKISAAYPEQAFLRRHPSPVEKRLLEFTKIAEELGYDIDIETAGALQKSLNSIGSVSTQHVLKTLCIKPMQRAKYFCAGSIEPERYRHYALNVPLYTHFTSPIRRYADVIVHRELQSALLEKDRFNESAEKIDAIANHCNNKKDSAKNAQETSSHIYLAVYLYNLTQAYGPIVCTAIVVDVVENGFDVLIPQYGIEKRIYLDKLPIENATWDSQNKTITLKWKKDTQVGADQDSDELPLDLSMDEICFEESSCATAVENDYSHLSSMNDADYLEECFDDSGEVLVEDNTDELYEKLSVFEQGDSEAQLPYAITKPKAPQSQLLQTELNFNLHGDTQTIKILGHVNALVTSDISVSPANINVLAVNPLVPLDKTALSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.15
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.14
15 0.2
16 0.3
17 0.38
18 0.46
19 0.56
20 0.66
21 0.75
22 0.8
23 0.84
24 0.86
25 0.89
26 0.92
27 0.93
28 0.94
29 0.94
30 0.94
31 0.95
32 0.92
33 0.91
34 0.91
35 0.91
36 0.89
37 0.88
38 0.82
39 0.78
40 0.75
41 0.68
42 0.64
43 0.58
44 0.52
45 0.49
46 0.46
47 0.41
48 0.4
49 0.37
50 0.35
51 0.4
52 0.38
53 0.33
54 0.35
55 0.35
56 0.3
57 0.31
58 0.27
59 0.18
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.21
69 0.24
70 0.22
71 0.25
72 0.29
73 0.33
74 0.4
75 0.44
76 0.44
77 0.47
78 0.53
79 0.59
80 0.64
81 0.7
82 0.73
83 0.79
84 0.84
85 0.87
86 0.87
87 0.84
88 0.82
89 0.75
90 0.68
91 0.63
92 0.55
93 0.51
94 0.42
95 0.33
96 0.25
97 0.22
98 0.17
99 0.12
100 0.12
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.15
110 0.17
111 0.21
112 0.26
113 0.35
114 0.42
115 0.5
116 0.6
117 0.68
118 0.78
119 0.84
120 0.89
121 0.91
122 0.92
123 0.92
124 0.93
125 0.93
126 0.92
127 0.88
128 0.82
129 0.71
130 0.61
131 0.53
132 0.45
133 0.36
134 0.26
135 0.19
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.13
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.09
147 0.14
148 0.18
149 0.22
150 0.23
151 0.25
152 0.27
153 0.3
154 0.31
155 0.27
156 0.25
157 0.27
158 0.28
159 0.29
160 0.33
161 0.3
162 0.28
163 0.31
164 0.35
165 0.31
166 0.36
167 0.35
168 0.36
169 0.41
170 0.5
171 0.52
172 0.51
173 0.55
174 0.56
175 0.6
176 0.55
177 0.55
178 0.56
179 0.6
180 0.65
181 0.68
182 0.66
183 0.68
184 0.77
185 0.82
186 0.83
187 0.83
188 0.84
189 0.84
190 0.9
191 0.88
192 0.87
193 0.86
194 0.83
195 0.8
196 0.75
197 0.76
198 0.73
199 0.69
200 0.64
201 0.62
202 0.58
203 0.52
204 0.49
205 0.42
206 0.41
207 0.42
208 0.38
209 0.32
210 0.29
211 0.28
212 0.26
213 0.24
214 0.18
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.17
231 0.24
232 0.31
233 0.35
234 0.41
235 0.51
236 0.58
237 0.64
238 0.67
239 0.68
240 0.66
241 0.67
242 0.64
243 0.6
244 0.52
245 0.45
246 0.39
247 0.35
248 0.3
249 0.27
250 0.29
251 0.24
252 0.3
253 0.39
254 0.44
255 0.48
256 0.51
257 0.59
258 0.61
259 0.67
260 0.7
261 0.7
262 0.71
263 0.73
264 0.81
265 0.83
266 0.85
267 0.89
268 0.9
269 0.91
270 0.89
271 0.87
272 0.84
273 0.82
274 0.78
275 0.76
276 0.74
277 0.68
278 0.62
279 0.6
280 0.54
281 0.48
282 0.46
283 0.43
284 0.36
285 0.37
286 0.39
287 0.38
288 0.41
289 0.41
290 0.38
291 0.35
292 0.33
293 0.31
294 0.31
295 0.29
296 0.26
297 0.26
298 0.34
299 0.41
300 0.41
301 0.45
302 0.49
303 0.56
304 0.63
305 0.64
306 0.6
307 0.59
308 0.66
309 0.67
310 0.66
311 0.6
312 0.57
313 0.58
314 0.55
315 0.49
316 0.42
317 0.34
318 0.26
319 0.23
320 0.19
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.14
331 0.16
332 0.22
333 0.3
334 0.39
335 0.47
336 0.56
337 0.66
338 0.69
339 0.76
340 0.72
341 0.7
342 0.64
343 0.58
344 0.54
345 0.47
346 0.41
347 0.31
348 0.29
349 0.23
350 0.2
351 0.16
352 0.09
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.1
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.18
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.08
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.1
381 0.11
382 0.12
383 0.18
384 0.22
385 0.29
386 0.37
387 0.37
388 0.39
389 0.47
390 0.5
391 0.49
392 0.56
393 0.55
394 0.54
395 0.62
396 0.66
397 0.61
398 0.6
399 0.56
400 0.51
401 0.48
402 0.42
403 0.34
404 0.26
405 0.24
406 0.21
407 0.18
408 0.12
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.13
424 0.13
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.15
431 0.15
432 0.15
433 0.15
434 0.15
435 0.16
436 0.15
437 0.21
438 0.25
439 0.31
440 0.37
441 0.41
442 0.4
443 0.45
444 0.49
445 0.46
446 0.42
447 0.36
448 0.37
449 0.35
450 0.36
451 0.34
452 0.33
453 0.31
454 0.27
455 0.28
456 0.22
457 0.21
458 0.21
459 0.26
460 0.25
461 0.26
462 0.27
463 0.29
464 0.33
465 0.34
466 0.33
467 0.26
468 0.22
469 0.21
470 0.2
471 0.18
472 0.17
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.14
478 0.13
479 0.11
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.14
497 0.15
498 0.15
499 0.21
500 0.21
501 0.23
502 0.23
503 0.23
504 0.21
505 0.21
506 0.23
507 0.18
508 0.16
509 0.14
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.08
514 0.05
515 0.04
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.08
527 0.11
528 0.12
529 0.16
530 0.18
531 0.18
532 0.2
533 0.24
534 0.29
535 0.27
536 0.32
537 0.31
538 0.34
539 0.37
540 0.41
541 0.43
542 0.39
543 0.42
544 0.39
545 0.41
546 0.41
547 0.46
548 0.47
549 0.42
550 0.51
551 0.5
552 0.56
553 0.6
554 0.63
555 0.64
556 0.67
557 0.68
558 0.59
559 0.6
560 0.52
561 0.44
562 0.39
563 0.32
564 0.23
565 0.21
566 0.2
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.1
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.16
582 0.17
583 0.15
584 0.16
585 0.16
586 0.15
587 0.15
588 0.14
589 0.07
590 0.04
591 0.03
592 0.02
593 0.03
594 0.04
595 0.04
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.08
602 0.09
603 0.11
604 0.12
605 0.16
606 0.17
607 0.18
608 0.17
609 0.14
610 0.14
611 0.13
612 0.13
613 0.1
614 0.1
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.11
619 0.1
620 0.09
621 0.1
622 0.08
623 0.07
624 0.1
625 0.09
626 0.11
627 0.11
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.14
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.07
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.1
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.07
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.15
668 0.16
669 0.16
670 0.16
671 0.17
672 0.18
673 0.19
674 0.21
675 0.2
676 0.2
677 0.2
678 0.2
679 0.19
680 0.19
681 0.17
682 0.14
683 0.1
684 0.08
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.08
689 0.1
690 0.1
691 0.11
692 0.13
693 0.15
694 0.16
695 0.17
696 0.17
697 0.15
698 0.14
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.14
704 0.15
705 0.15
706 0.13
707 0.12
708 0.1
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.22
713 0.27
714 0.32
715 0.36
716 0.38
717 0.37
718 0.36
719 0.36
720 0.29
721 0.27
722 0.26
723 0.28
724 0.25
725 0.24
726 0.22
727 0.22
728 0.22
729 0.19
730 0.15
731 0.1
732 0.11
733 0.1
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.08
743 0.09
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.1
748 0.14
749 0.16
750 0.19
751 0.24
752 0.25
753 0.25
754 0.27
755 0.25
756 0.22
757 0.2
758 0.17
759 0.1
760 0.1
761 0.08
762 0.06
763 0.06
764 0.05
765 0.04
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.05
773 0.06
774 0.06
775 0.09
776 0.09
777 0.1
778 0.12
779 0.17
780 0.18
781 0.19
782 0.26
783 0.25
784 0.26
785 0.29
786 0.38
787 0.41
788 0.48
789 0.54
790 0.47
791 0.48
792 0.53
793 0.52
794 0.45
795 0.37
796 0.3
797 0.26
798 0.25
799 0.23
800 0.16
801 0.13
802 0.11
803 0.11
804 0.1
805 0.06
806 0.05
807 0.05
808 0.05
809 0.05
810 0.04
811 0.04
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.05
817 0.07
818 0.08
819 0.08
820 0.07
821 0.08
822 0.09
823 0.11
824 0.11
825 0.11
826 0.12
827 0.13
828 0.12
829 0.15
830 0.15
831 0.14
832 0.21
833 0.23
834 0.26
835 0.29
836 0.31
837 0.36
838 0.45
839 0.51
840 0.49
841 0.5
842 0.49
843 0.54
844 0.53
845 0.47
846 0.42
847 0.35
848 0.34
849 0.37
850 0.38
851 0.31
852 0.33
853 0.36
854 0.33
855 0.36
856 0.33
857 0.29
858 0.3
859 0.32
860 0.38
861 0.34
862 0.33
863 0.32
864 0.35
865 0.33
866 0.27
867 0.26
868 0.2
869 0.25
870 0.26
871 0.32
872 0.32
873 0.31
874 0.33
875 0.33
876 0.39
877 0.4
878 0.41
879 0.37
880 0.37
881 0.36
882 0.35
883 0.32
884 0.25
885 0.2
886 0.19
887 0.17
888 0.18
889 0.19
890 0.18
891 0.21
892 0.23
893 0.22
894 0.22
895 0.27
896 0.23
897 0.27
898 0.28
899 0.25
900 0.23
901 0.24
902 0.24
903 0.22
904 0.28
905 0.25
906 0.31
907 0.34
908 0.37
909 0.36
910 0.41
911 0.44
912 0.43
913 0.48
914 0.52
915 0.57
916 0.6
917 0.62
918 0.58
919 0.52
920 0.5
921 0.48
922 0.39
923 0.3
924 0.23
925 0.21
926 0.19
927 0.18
928 0.15
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.09
933 0.09
934 0.09
935 0.08
936 0.08
937 0.09
938 0.1
939 0.1
940 0.09
941 0.09
942 0.09
943 0.08
944 0.08
945 0.06
946 0.06
947 0.06
948 0.05
949 0.05
950 0.06
951 0.05
952 0.05
953 0.05
954 0.04
955 0.04
956 0.05
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.1
962 0.11
963 0.13
964 0.14
965 0.14
966 0.14
967 0.22
968 0.24
969 0.22
970 0.26
971 0.3
972 0.32
973 0.33
974 0.34
975 0.28
976 0.28
977 0.29
978 0.25
979 0.23
980 0.22
981 0.23
982 0.24
983 0.25
984 0.23
985 0.24
986 0.25
987 0.32
988 0.41
989 0.45
990 0.47
991 0.54
992 0.58
993 0.62
994 0.63
995 0.59
996 0.59
997 0.55
998 0.54
999 0.47
1000 0.43
1001 0.36
1002 0.31
1003 0.25
1004 0.16
1005 0.12
1006 0.09
1007 0.07
1008 0.08
1009 0.06
1010 0.07
1011 0.06
1012 0.06
1013 0.06
1014 0.07
1015 0.08
1016 0.07
1017 0.08
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.1
1021 0.1
1022 0.1
1023 0.09
1024 0.11
1025 0.13
1026 0.14
1027 0.15
1028 0.14
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.17
1032 0.15
1033 0.14
1034 0.12
1035 0.14
1036 0.13
1037 0.11
1038 0.11
1039 0.12
1040 0.12
1041 0.13
1042 0.12
1043 0.1
1044 0.1
1045 0.09
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.08
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.07
1055 0.06
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.07
1060 0.06
1061 0.08
1062 0.09
1063 0.09
1064 0.1
1065 0.11
1066 0.13
1067 0.14
1068 0.14
1069 0.13
1070 0.14
1071 0.15
1072 0.15
1073 0.15
1074 0.13
1075 0.12
1076 0.11
1077 0.11
1078 0.11
1079 0.16
1080 0.19
1081 0.19
1082 0.24
1083 0.31
1084 0.4
1085 0.47
1086 0.48
1087 0.5
1088 0.54
1089 0.62
1090 0.61
1091 0.6
1092 0.53
1093 0.45
1094 0.49
1095 0.43
1096 0.36
1097 0.27
1098 0.23
1099 0.2
1100 0.19
1101 0.19
1102 0.14
1103 0.14
1104 0.14
1105 0.16
1106 0.16
1107 0.14
1108 0.15
1109 0.19
1110 0.19
1111 0.2
1112 0.19
1113 0.18
1114 0.18
1115 0.19
1116 0.17
1117 0.12
1118 0.12
1119 0.1
1120 0.09
1121 0.1
1122 0.1
1123 0.1
1124 0.11
1125 0.12
1126 0.13
1127 0.12
1128 0.12
1129 0.11
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.11
1133 0.1
1134 0.09
1135 0.09
1136 0.11
1137 0.1
1138 0.11
1139 0.12