Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YBX2

Protein Details
Accession A0A1Y1YBX2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-565IPNRKFLKSSSKSPRPNRPASDAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MHFSELSFDILIPDVAPTETLASGVDILNAPVRKQLFFDEVLNFYLVIRTPTSSTLFKNSKQEEIASLFHSLLQIQVQVDVRDGSSVENIDPSTQVYEFTEKSGSYENTQHTNGHGGNSTTNGKPFIEGGKLSRIYNLRPKEIEKLKLFQVNDELVCLYPLGVPLAFAKVKGQELVAVITIFINEKSVQDSRKISQSIPKEEEEEGESLENMDIITLMGNLSYDIGSLDDSADDSPTTLLPSSYPFPRVGLPLEKITLQKTISITQALEARIRTTVIGDKASFISLCLKCSNQTPVLLEKVETTVTNATVTYCGDEDGLFPMSFQATDHSTFLFDVNLIENSVTKNGSQASLPPLNGASYRKPSYQQQPPPPPKGSEERAYYATITVLSVPQLDCFQGRSIRSEWKFPIEVSTQTKRVVPNTPNLNMRPQSSPVPNRRQLGSAASDFEYSPSGAHPNLRKFIPASTKLARSSSLTARPNSHLGIRTTDRRDMLGEDTPTLQLDNGVFISFTIPETPIVARKFFSVELFFVNQSGATRNLTVVIPNRKFLKSSSKSPRPNRPASDASTDSRVAPMMRAPDFLRRQVEHEKSQATMLCLESNVQLSPLQPSSCQKIQLHLITTTEHLHTLLPIQILDTDTGSITNLRDVLEFYVEREAVEGIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.09
14 0.1
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.2
19 0.21
20 0.2
21 0.22
22 0.26
23 0.25
24 0.26
25 0.3
26 0.28
27 0.29
28 0.29
29 0.28
30 0.24
31 0.19
32 0.19
33 0.16
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.18
39 0.23
40 0.24
41 0.26
42 0.33
43 0.37
44 0.41
45 0.49
46 0.49
47 0.5
48 0.49
49 0.47
50 0.42
51 0.41
52 0.38
53 0.3
54 0.29
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.16
59 0.13
60 0.11
61 0.12
62 0.1
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.2
88 0.17
89 0.19
90 0.24
91 0.24
92 0.23
93 0.29
94 0.3
95 0.33
96 0.35
97 0.33
98 0.28
99 0.32
100 0.29
101 0.25
102 0.24
103 0.2
104 0.19
105 0.22
106 0.25
107 0.21
108 0.22
109 0.21
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.26
118 0.28
119 0.27
120 0.31
121 0.3
122 0.32
123 0.4
124 0.42
125 0.39
126 0.41
127 0.43
128 0.48
129 0.52
130 0.55
131 0.5
132 0.49
133 0.48
134 0.51
135 0.48
136 0.41
137 0.38
138 0.33
139 0.29
140 0.26
141 0.22
142 0.16
143 0.16
144 0.14
145 0.1
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.11
174 0.14
175 0.16
176 0.2
177 0.24
178 0.24
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.34
183 0.39
184 0.43
185 0.43
186 0.42
187 0.38
188 0.36
189 0.36
190 0.32
191 0.25
192 0.17
193 0.14
194 0.12
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.09
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.1
271 0.16
272 0.15
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.2
278 0.24
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.21
284 0.2
285 0.18
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.13
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.16
345 0.14
346 0.18
347 0.2
348 0.21
349 0.23
350 0.28
351 0.35
352 0.43
353 0.48
354 0.53
355 0.61
356 0.67
357 0.71
358 0.68
359 0.61
360 0.55
361 0.53
362 0.47
363 0.42
364 0.38
365 0.35
366 0.34
367 0.33
368 0.3
369 0.23
370 0.19
371 0.13
372 0.1
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.1
384 0.13
385 0.14
386 0.17
387 0.19
388 0.27
389 0.28
390 0.32
391 0.31
392 0.32
393 0.32
394 0.29
395 0.31
396 0.24
397 0.28
398 0.29
399 0.32
400 0.29
401 0.3
402 0.32
403 0.29
404 0.3
405 0.33
406 0.29
407 0.33
408 0.37
409 0.4
410 0.42
411 0.42
412 0.45
413 0.39
414 0.39
415 0.34
416 0.31
417 0.32
418 0.35
419 0.42
420 0.45
421 0.52
422 0.55
423 0.55
424 0.54
425 0.5
426 0.44
427 0.4
428 0.35
429 0.27
430 0.23
431 0.21
432 0.21
433 0.19
434 0.18
435 0.15
436 0.11
437 0.1
438 0.08
439 0.1
440 0.1
441 0.15
442 0.2
443 0.24
444 0.28
445 0.28
446 0.28
447 0.27
448 0.32
449 0.36
450 0.33
451 0.35
452 0.36
453 0.39
454 0.4
455 0.4
456 0.36
457 0.3
458 0.31
459 0.31
460 0.35
461 0.35
462 0.36
463 0.39
464 0.4
465 0.4
466 0.36
467 0.34
468 0.3
469 0.27
470 0.31
471 0.32
472 0.36
473 0.38
474 0.41
475 0.38
476 0.34
477 0.34
478 0.3
479 0.3
480 0.27
481 0.24
482 0.21
483 0.22
484 0.21
485 0.2
486 0.17
487 0.14
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.1
502 0.11
503 0.16
504 0.18
505 0.19
506 0.18
507 0.18
508 0.21
509 0.2
510 0.21
511 0.18
512 0.17
513 0.19
514 0.21
515 0.2
516 0.18
517 0.17
518 0.14
519 0.13
520 0.14
521 0.13
522 0.12
523 0.13
524 0.12
525 0.14
526 0.14
527 0.17
528 0.22
529 0.31
530 0.31
531 0.34
532 0.39
533 0.38
534 0.39
535 0.39
536 0.42
537 0.38
538 0.47
539 0.54
540 0.6
541 0.69
542 0.77
543 0.85
544 0.82
545 0.86
546 0.81
547 0.78
548 0.73
549 0.68
550 0.67
551 0.6
552 0.53
553 0.48
554 0.43
555 0.36
556 0.31
557 0.27
558 0.2
559 0.17
560 0.18
561 0.19
562 0.19
563 0.22
564 0.23
565 0.31
566 0.35
567 0.39
568 0.43
569 0.38
570 0.43
571 0.51
572 0.56
573 0.52
574 0.54
575 0.5
576 0.44
577 0.46
578 0.43
579 0.34
580 0.3
581 0.26
582 0.21
583 0.19
584 0.2
585 0.18
586 0.17
587 0.15
588 0.13
589 0.13
590 0.12
591 0.17
592 0.19
593 0.18
594 0.2
595 0.24
596 0.31
597 0.34
598 0.4
599 0.36
600 0.39
601 0.46
602 0.48
603 0.48
604 0.42
605 0.39
606 0.34
607 0.35
608 0.32
609 0.25
610 0.2
611 0.17
612 0.16
613 0.15
614 0.16
615 0.17
616 0.15
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.16
622 0.14
623 0.12
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.12
628 0.11
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.13
633 0.15
634 0.16
635 0.2
636 0.19
637 0.18
638 0.24
639 0.23
640 0.22
641 0.21