Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PDS1

Protein Details
Accession B8PDS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210AEYSLRRSTRKRKRVEPAPSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-201RKRK
311-318KASKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_105098  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MPSAPHIVPESAPRPLAIDTHFVGETNAPEIELAGLLQQVVTPSSDESGRMLAVHMQTPTASAFDEDLLREHDTDVELDNLFGDSITADTHPVSSVVIPGLPEVEQEPTTTKYANCIRGATVDRHMLDGQGDAITLNDDGANCNDERGVTEVPSSAGPSLASLSTPRSQAQHDAAQTTEHPVEATGVNAEYSLRRSTRKRKRVEPAPSATSIEPTQSSDPLQQVRSGSRSASGRETAAITADGRFACPHCPARTFQRYHDCRRHMDTSKRCLGWNGIVYPCHRCGSEYTRRDAVKRHMDDKPDCAQDGGEKASKRRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.27
4 0.21
5 0.22
6 0.2
7 0.23
8 0.23
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.18
13 0.15
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.11
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.19
100 0.25
101 0.29
102 0.28
103 0.26
104 0.26
105 0.29
106 0.32
107 0.28
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.23
112 0.23
113 0.19
114 0.16
115 0.14
116 0.11
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.17
157 0.19
158 0.21
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.14
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.16
182 0.23
183 0.35
184 0.45
185 0.54
186 0.6
187 0.66
188 0.75
189 0.8
190 0.83
191 0.81
192 0.76
193 0.71
194 0.65
195 0.58
196 0.48
197 0.4
198 0.31
199 0.23
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.19
207 0.21
208 0.21
209 0.21
210 0.21
211 0.23
212 0.24
213 0.22
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.24
219 0.22
220 0.2
221 0.2
222 0.21
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.18
235 0.24
236 0.24
237 0.27
238 0.3
239 0.39
240 0.48
241 0.49
242 0.51
243 0.56
244 0.6
245 0.68
246 0.74
247 0.69
248 0.66
249 0.69
250 0.7
251 0.68
252 0.71
253 0.7
254 0.69
255 0.73
256 0.68
257 0.62
258 0.56
259 0.52
260 0.48
261 0.45
262 0.4
263 0.35
264 0.36
265 0.37
266 0.4
267 0.39
268 0.33
269 0.28
270 0.25
271 0.28
272 0.34
273 0.43
274 0.43
275 0.46
276 0.52
277 0.54
278 0.55
279 0.56
280 0.57
281 0.57
282 0.58
283 0.59
284 0.57
285 0.64
286 0.65
287 0.64
288 0.62
289 0.55
290 0.49
291 0.43
292 0.38
293 0.34
294 0.34
295 0.33
296 0.31
297 0.3
298 0.37