Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZDV5

Protein Details
Accession A0A1Y1ZDV5    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
436-486INKGVPRSKKETPEEKKARKAAIKEERKNRRSEKKQSKSLHKEQQSLRQRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
438-474KGVPRSKKETPEEKKARKAAIKEERKNRRSEKKQSKS
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGKKQFIDRKNARHFEVVHRSQRDPLAGDGDSSSRVLREVVPLNVAKKENKEERRLEAQEGNKEDLEERIGQAALYGIYYDDSKYDYTQHLRPIGENPDAVFVAAPKKQEKTRHTGIQFVDDDVASVSSRRERKVTFDLPQDALPSEYELSTGVMNQSALPEDLQGLQPDMDPELRAVLEALDDEDGIDDGDLDEDFIQSLDAEGGEEYGDDYADYDDEEYEEDTTGWANIRRYMGAKYDSDDEYEEDTRTNFTMSSSVMFRNDKLTLLDEQFDKVEKEYEESETESESDSERPEREDLDDILDEFLDKYELVGKKMVPKLEGDSEEKLEAMRKAFLEVSLEEKKQQMNAPPKYEKDSTPMLMPVASRAEREREMWDCESILSTYSNLDNHPSLIREEPKRRIKFDKNGFPVVEVPKQQAEEEENEEEEEDTAEKINKGVPRSKKETPEEKKARKAAIKEERKNRRSEKKQSKSLHKEQQSLRQRVLDQRAKSLATLHLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.69
4 0.67
5 0.65
6 0.64
7 0.63
8 0.61
9 0.61
10 0.54
11 0.46
12 0.39
13 0.35
14 0.3
15 0.29
16 0.25
17 0.23
18 0.2
19 0.19
20 0.17
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.18
26 0.21
27 0.22
28 0.27
29 0.29
30 0.31
31 0.35
32 0.37
33 0.35
34 0.36
35 0.44
36 0.49
37 0.55
38 0.61
39 0.61
40 0.65
41 0.7
42 0.68
43 0.63
44 0.61
45 0.59
46 0.58
47 0.56
48 0.53
49 0.43
50 0.41
51 0.36
52 0.3
53 0.27
54 0.21
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.11
72 0.14
73 0.18
74 0.23
75 0.27
76 0.32
77 0.35
78 0.35
79 0.36
80 0.38
81 0.38
82 0.36
83 0.32
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.22
88 0.17
89 0.12
90 0.15
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.24
95 0.29
96 0.39
97 0.43
98 0.47
99 0.53
100 0.6
101 0.58
102 0.6
103 0.55
104 0.54
105 0.49
106 0.41
107 0.34
108 0.24
109 0.23
110 0.17
111 0.16
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.14
116 0.18
117 0.2
118 0.24
119 0.25
120 0.31
121 0.4
122 0.45
123 0.44
124 0.47
125 0.49
126 0.46
127 0.46
128 0.4
129 0.32
130 0.26
131 0.2
132 0.15
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.19
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.16
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.11
262 0.09
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.23
303 0.26
304 0.27
305 0.22
306 0.22
307 0.24
308 0.27
309 0.3
310 0.25
311 0.24
312 0.24
313 0.24
314 0.22
315 0.19
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.18
327 0.21
328 0.21
329 0.2
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.26
334 0.27
335 0.33
336 0.39
337 0.45
338 0.48
339 0.49
340 0.52
341 0.52
342 0.45
343 0.39
344 0.38
345 0.32
346 0.29
347 0.28
348 0.22
349 0.2
350 0.19
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.21
357 0.21
358 0.23
359 0.26
360 0.24
361 0.29
362 0.29
363 0.28
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.18
368 0.16
369 0.11
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.15
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.21
382 0.28
383 0.34
384 0.41
385 0.49
386 0.58
387 0.63
388 0.66
389 0.7
390 0.73
391 0.74
392 0.77
393 0.78
394 0.74
395 0.74
396 0.69
397 0.61
398 0.57
399 0.52
400 0.47
401 0.37
402 0.34
403 0.31
404 0.32
405 0.3
406 0.27
407 0.26
408 0.24
409 0.27
410 0.26
411 0.24
412 0.23
413 0.23
414 0.21
415 0.17
416 0.14
417 0.1
418 0.08
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.16
424 0.19
425 0.23
426 0.31
427 0.39
428 0.46
429 0.53
430 0.6
431 0.65
432 0.71
433 0.77
434 0.77
435 0.79
436 0.81
437 0.82
438 0.84
439 0.81
440 0.8
441 0.76
442 0.73
443 0.73
444 0.73
445 0.76
446 0.76
447 0.8
448 0.83
449 0.81
450 0.85
451 0.84
452 0.85
453 0.84
454 0.86
455 0.87
456 0.86
457 0.91
458 0.91
459 0.92
460 0.91
461 0.91
462 0.91
463 0.87
464 0.86
465 0.82
466 0.83
467 0.82
468 0.78
469 0.71
470 0.67
471 0.64
472 0.64
473 0.68
474 0.65
475 0.57
476 0.59
477 0.59
478 0.54
479 0.5
480 0.44