Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XTN4

Protein Details
Accession A0A1Y1XTN4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-41HTREVDKELERKKKRQQLEEERRKKGEEBasic
187-208LSPPGRSRKRASSPRRPSSRKSHydrophilic
281-302EQERLRARKKARLGMDKKKSPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-103ERKKKRQQLEEERRKKGEERRRQEEKASSAAQLAERRKNDLKLEREREERRREKERELLREKLKKDNAREKEAKPAPYKRE
170-207KTPPIPKYSNDKPRRRSLSPPGRSRKRASSPRRPSSRK
284-302RLRARKKARLGMDKKKSPR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MGEFEELMRLAAQHTREVDKELERKKKRQQLEEERRKKGEERRRQEEKASSAAQLAERRKNDLKLEREREERRREKERELLREKLKKDNAREKEAKPAPYKRETLLPQPKQKKQIGAVLVDLKSIDSRANASIPNRDARLDLSSRYTQSPISRDGKRSTSEPSTAIKGAKTPPIPKYSNDKPRRRSLSPPGRSRKRASSPRRPSSRKSIDESDFNEDYVKQNNISSIIGQLFGYDRSRYANERYSDDDMEASISDLRKEESRSAKIARLEDEREEELERLEQERLRARKKARLGMDKKKSPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.25
4 0.28
5 0.31
6 0.34
7 0.42
8 0.47
9 0.55
10 0.59
11 0.67
12 0.74
13 0.79
14 0.8
15 0.81
16 0.83
17 0.84
18 0.87
19 0.9
20 0.89
21 0.88
22 0.82
23 0.75
24 0.71
25 0.7
26 0.7
27 0.69
28 0.69
29 0.72
30 0.78
31 0.78
32 0.78
33 0.75
34 0.68
35 0.64
36 0.56
37 0.47
38 0.39
39 0.37
40 0.34
41 0.33
42 0.35
43 0.36
44 0.35
45 0.41
46 0.44
47 0.47
48 0.51
49 0.53
50 0.56
51 0.58
52 0.65
53 0.64
54 0.69
55 0.72
56 0.73
57 0.75
58 0.75
59 0.72
60 0.75
61 0.74
62 0.72
63 0.72
64 0.72
65 0.72
66 0.69
67 0.7
68 0.69
69 0.71
70 0.67
71 0.67
72 0.67
73 0.63
74 0.67
75 0.69
76 0.66
77 0.68
78 0.72
79 0.64
80 0.66
81 0.64
82 0.62
83 0.59
84 0.6
85 0.58
86 0.57
87 0.58
88 0.48
89 0.5
90 0.46
91 0.5
92 0.53
93 0.54
94 0.58
95 0.65
96 0.69
97 0.69
98 0.69
99 0.64
100 0.56
101 0.55
102 0.48
103 0.4
104 0.38
105 0.34
106 0.31
107 0.26
108 0.22
109 0.16
110 0.12
111 0.12
112 0.09
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.16
120 0.17
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.19
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.17
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.25
139 0.27
140 0.29
141 0.32
142 0.33
143 0.32
144 0.31
145 0.3
146 0.28
147 0.26
148 0.25
149 0.24
150 0.23
151 0.23
152 0.22
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.2
157 0.22
158 0.24
159 0.26
160 0.32
161 0.34
162 0.34
163 0.4
164 0.45
165 0.52
166 0.58
167 0.63
168 0.62
169 0.7
170 0.75
171 0.71
172 0.69
173 0.7
174 0.71
175 0.71
176 0.75
177 0.76
178 0.77
179 0.78
180 0.75
181 0.74
182 0.72
183 0.74
184 0.74
185 0.75
186 0.77
187 0.82
188 0.87
189 0.83
190 0.79
191 0.79
192 0.79
193 0.73
194 0.68
195 0.66
196 0.59
197 0.59
198 0.57
199 0.53
200 0.43
201 0.38
202 0.33
203 0.26
204 0.24
205 0.22
206 0.2
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.14
224 0.17
225 0.2
226 0.25
227 0.3
228 0.31
229 0.34
230 0.39
231 0.4
232 0.38
233 0.36
234 0.3
235 0.23
236 0.21
237 0.18
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.16
245 0.19
246 0.25
247 0.31
248 0.35
249 0.39
250 0.42
251 0.46
252 0.48
253 0.48
254 0.45
255 0.43
256 0.42
257 0.41
258 0.42
259 0.39
260 0.35
261 0.34
262 0.29
263 0.25
264 0.24
265 0.22
266 0.19
267 0.21
268 0.21
269 0.24
270 0.33
271 0.4
272 0.44
273 0.51
274 0.55
275 0.6
276 0.67
277 0.71
278 0.72
279 0.75
280 0.78
281 0.81
282 0.86