Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YXM7

Protein Details
Accession A0A1Y1YXM7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSSVSGRQQKNRRQDFPFQPAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
472-512KEKEKEKPASPEIEPKAVEKEVAKPKKGATKSPESAPASKP
Subcellular Location(s) mito 11.5, nucl 10, cyto_mito 8.666, cyto_nucl 8.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MSSVSGRQQKNRRQDFPFQPAAQRGGRGKWGQYSNTMPRGGGPKPWGVHQNPSHAPAPAAAPMTPSVEVKNDSFARHMHDRMLYLLIHLVGLNVQVTVKSGAKYEGLFHAACTEGELGVVLKFARIVKAASEEKTEASAEVIPTLIILAKDFVEMNAVGVDFSISEKGPEKDTFKTDTNISGHTGSVRERELHKWNADDHGDFHTLEELEAGEDIEWDQFAANEHLFGLKTDFDEEIYTTKLDRNSANFKEREKQAIRIANEIARMSSMNPHVAEERGQSIDDSQMDEEDKYSSVVRTSSLRGGDRQGKYTPPAMRPRTASNQSAENAPANVESKQPSLPAETDPKSKVKQAEAPKESATGGATPTAPTANSTKAANSQTTKIAEPIASLLNSKSSKKTSSEAGAAKPIEAEIVGTFRSFVNHEKERLQQTRQAYLKMEKDGRVAELIKFSQSFKLKTPVPADLIPILGKDKEKEKEKPASPEIEPKAVEKEVAKPKKGATKSPESAPASKPVAEKEANPKPAAASGDTKPSDKNSKQATEPASTTATATATTPASTAPTKPSTTFKFNVKATEFKPNPSAAPFVPASHQNSDKKATANAASSPFFANKNLKRGHASVKGMLKKADSEEKSEDPSTIAPTWPFGQKSFRHQFSHTVIYDEDMYGQNGMNQAYLPYVAYRYPAQFPGMPAMGMQQPPMPYMPPAPFVPNMPFTASMPHPAGPPSAVYSPQMTPVSAPRMYPKGQAPPAEGQHFAPPGNYPPQGRGPMVPAMPPQMYAYPGPQGPMMVRYPTEMMPHVAGPPMIVPQRSPMDQPPMAPYTPNEQSNDGLTEDPAAGTASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.81
4 0.81
5 0.73
6 0.69
7 0.65
8 0.64
9 0.56
10 0.52
11 0.47
12 0.42
13 0.47
14 0.44
15 0.43
16 0.46
17 0.5
18 0.46
19 0.48
20 0.52
21 0.53
22 0.56
23 0.53
24 0.45
25 0.43
26 0.46
27 0.42
28 0.4
29 0.35
30 0.36
31 0.36
32 0.41
33 0.45
34 0.43
35 0.51
36 0.5
37 0.55
38 0.52
39 0.55
40 0.52
41 0.44
42 0.41
43 0.33
44 0.3
45 0.25
46 0.23
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.2
51 0.2
52 0.18
53 0.16
54 0.18
55 0.21
56 0.2
57 0.26
58 0.26
59 0.26
60 0.27
61 0.27
62 0.31
63 0.35
64 0.35
65 0.32
66 0.33
67 0.32
68 0.32
69 0.33
70 0.26
71 0.2
72 0.21
73 0.16
74 0.13
75 0.12
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.13
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.2
116 0.24
117 0.24
118 0.27
119 0.27
120 0.26
121 0.27
122 0.26
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.08
153 0.12
154 0.13
155 0.17
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.3
160 0.34
161 0.33
162 0.35
163 0.32
164 0.34
165 0.33
166 0.3
167 0.29
168 0.24
169 0.22
170 0.21
171 0.21
172 0.16
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.21
177 0.26
178 0.32
179 0.37
180 0.38
181 0.37
182 0.37
183 0.39
184 0.39
185 0.34
186 0.29
187 0.27
188 0.26
189 0.24
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.13
228 0.14
229 0.16
230 0.18
231 0.22
232 0.29
233 0.34
234 0.41
235 0.41
236 0.42
237 0.48
238 0.48
239 0.52
240 0.46
241 0.46
242 0.46
243 0.5
244 0.48
245 0.43
246 0.43
247 0.35
248 0.34
249 0.3
250 0.22
251 0.16
252 0.15
253 0.12
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.14
286 0.16
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.26
291 0.33
292 0.32
293 0.33
294 0.31
295 0.3
296 0.31
297 0.36
298 0.35
299 0.34
300 0.42
301 0.42
302 0.44
303 0.44
304 0.48
305 0.5
306 0.5
307 0.46
308 0.38
309 0.38
310 0.35
311 0.34
312 0.29
313 0.22
314 0.17
315 0.14
316 0.14
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.15
328 0.21
329 0.21
330 0.25
331 0.26
332 0.29
333 0.29
334 0.31
335 0.31
336 0.28
337 0.34
338 0.39
339 0.47
340 0.46
341 0.47
342 0.44
343 0.41
344 0.38
345 0.3
346 0.22
347 0.12
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.16
362 0.18
363 0.19
364 0.19
365 0.19
366 0.21
367 0.23
368 0.22
369 0.18
370 0.17
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.21
387 0.23
388 0.27
389 0.27
390 0.25
391 0.27
392 0.25
393 0.23
394 0.2
395 0.16
396 0.11
397 0.08
398 0.07
399 0.03
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.1
408 0.16
409 0.18
410 0.21
411 0.23
412 0.27
413 0.34
414 0.37
415 0.35
416 0.34
417 0.34
418 0.4
419 0.38
420 0.35
421 0.3
422 0.31
423 0.32
424 0.32
425 0.32
426 0.25
427 0.26
428 0.24
429 0.22
430 0.2
431 0.18
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.16
439 0.18
440 0.19
441 0.19
442 0.24
443 0.25
444 0.29
445 0.31
446 0.28
447 0.28
448 0.27
449 0.26
450 0.21
451 0.2
452 0.15
453 0.13
454 0.11
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.14
459 0.2
460 0.26
461 0.3
462 0.36
463 0.44
464 0.47
465 0.52
466 0.5
467 0.48
468 0.44
469 0.48
470 0.44
471 0.38
472 0.35
473 0.29
474 0.29
475 0.24
476 0.24
477 0.16
478 0.23
479 0.3
480 0.35
481 0.35
482 0.33
483 0.36
484 0.44
485 0.45
486 0.43
487 0.39
488 0.44
489 0.45
490 0.46
491 0.51
492 0.46
493 0.47
494 0.42
495 0.41
496 0.33
497 0.33
498 0.31
499 0.25
500 0.26
501 0.24
502 0.25
503 0.28
504 0.34
505 0.34
506 0.34
507 0.33
508 0.28
509 0.3
510 0.29
511 0.22
512 0.18
513 0.16
514 0.24
515 0.25
516 0.25
517 0.23
518 0.26
519 0.33
520 0.3
521 0.36
522 0.35
523 0.37
524 0.38
525 0.43
526 0.43
527 0.37
528 0.37
529 0.32
530 0.27
531 0.23
532 0.22
533 0.17
534 0.13
535 0.1
536 0.1
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.1
543 0.1
544 0.11
545 0.14
546 0.18
547 0.19
548 0.21
549 0.27
550 0.3
551 0.35
552 0.37
553 0.38
554 0.41
555 0.41
556 0.46
557 0.43
558 0.43
559 0.39
560 0.47
561 0.42
562 0.37
563 0.39
564 0.34
565 0.32
566 0.28
567 0.29
568 0.18
569 0.22
570 0.2
571 0.17
572 0.18
573 0.21
574 0.24
575 0.25
576 0.31
577 0.3
578 0.33
579 0.36
580 0.37
581 0.34
582 0.31
583 0.3
584 0.27
585 0.25
586 0.25
587 0.25
588 0.23
589 0.23
590 0.23
591 0.21
592 0.19
593 0.21
594 0.27
595 0.27
596 0.35
597 0.37
598 0.38
599 0.41
600 0.43
601 0.47
602 0.46
603 0.45
604 0.43
605 0.49
606 0.51
607 0.48
608 0.46
609 0.39
610 0.33
611 0.34
612 0.37
613 0.31
614 0.31
615 0.34
616 0.35
617 0.39
618 0.37
619 0.33
620 0.25
621 0.25
622 0.23
623 0.2
624 0.19
625 0.14
626 0.16
627 0.18
628 0.21
629 0.21
630 0.19
631 0.26
632 0.28
633 0.38
634 0.45
635 0.49
636 0.48
637 0.49
638 0.54
639 0.52
640 0.57
641 0.47
642 0.4
643 0.34
644 0.32
645 0.31
646 0.23
647 0.2
648 0.13
649 0.13
650 0.11
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.12
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.09
663 0.09
664 0.11
665 0.13
666 0.16
667 0.19
668 0.2
669 0.22
670 0.23
671 0.24
672 0.27
673 0.25
674 0.21
675 0.18
676 0.19
677 0.2
678 0.18
679 0.18
680 0.15
681 0.15
682 0.16
683 0.18
684 0.16
685 0.14
686 0.18
687 0.19
688 0.2
689 0.21
690 0.24
691 0.24
692 0.25
693 0.28
694 0.27
695 0.26
696 0.25
697 0.25
698 0.21
699 0.26
700 0.24
701 0.24
702 0.23
703 0.23
704 0.22
705 0.21
706 0.22
707 0.17
708 0.18
709 0.17
710 0.17
711 0.17
712 0.18
713 0.2
714 0.2
715 0.25
716 0.25
717 0.21
718 0.21
719 0.25
720 0.29
721 0.27
722 0.27
723 0.27
724 0.31
725 0.33
726 0.37
727 0.37
728 0.41
729 0.45
730 0.47
731 0.47
732 0.48
733 0.52
734 0.5
735 0.46
736 0.38
737 0.38
738 0.37
739 0.32
740 0.25
741 0.21
742 0.23
743 0.28
744 0.3
745 0.26
746 0.29
747 0.36
748 0.39
749 0.39
750 0.36
751 0.34
752 0.36
753 0.36
754 0.33
755 0.28
756 0.29
757 0.27
758 0.26
759 0.25
760 0.21
761 0.22
762 0.21
763 0.21
764 0.21
765 0.21
766 0.22
767 0.2
768 0.19
769 0.18
770 0.21
771 0.21
772 0.19
773 0.19
774 0.21
775 0.23
776 0.24
777 0.26
778 0.23
779 0.23
780 0.22
781 0.23
782 0.22
783 0.2
784 0.18
785 0.15
786 0.15
787 0.18
788 0.19
789 0.18
790 0.18
791 0.23
792 0.29
793 0.3
794 0.33
795 0.33
796 0.39
797 0.4
798 0.41
799 0.41
800 0.4
801 0.39
802 0.37
803 0.33
804 0.32
805 0.37
806 0.39
807 0.36
808 0.34
809 0.35
810 0.36
811 0.36
812 0.3
813 0.24
814 0.2
815 0.19
816 0.17
817 0.15
818 0.12